| Category | 1.4 Other |
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| Product | putative MbtH-like protein |
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| Product (GenBank) | hypothetical protein |
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| Gene | |
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| Gene (GenBank) | |
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| EC number | |
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| Keyword | |
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| Note | |
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| Note (GenBank) | |
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| Reference | - ACC
- Q6ZZJ2
- PmId
[15113000] Biosynthetic gene cluster of the glycopeptide antibiotic teicoplanin: characterization of two glycosyltransferases and the key acyltransferase. (Chem Biol. , 2004) - comment
- DSM 43866株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。
tei orf1*: Unknown
配列解析のみ。多くのNRPS gene clusterにおいて、NRPSの末端TE domainのすぐ後ろにみられる機能不明遺伝子。
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| Related Reference | - ACC
- Q70AZ5
- NITE
- Teicp2_00220
- PmId
[14702401] Organization of the teicoplanin gene cluster in Actinoplanes teichomyceticus. (Microbiology. , 2004) - comment
- DSM 43866株でのtei orf1*とはN末1AAの違いのみ。
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ATCC 31121株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。
tcp ORF13: Unknown
配列解析のみ。ORF13とORF17はほとんど配列が同じであり、一方のduplicationから生じたと示唆される。
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- ACC
- Q939Y8
- NITE
- Balhi_00100
- PmId
[11932455] Nonribosomal biosynthesis of vancomycin-type antibiotics: a heptapeptide backbone and eight peptide synthetase modules. (Microbiology. , 2002)
[16907743] The small MbtH-like protein encoded by an internal gene of the balhimycin biosynthetic gene cluster is not required for glycopeptide production. (FEMS Microbiol Lett. , 2006)
[21826462] Function of MbtH homologs in nonribosomal peptide biosynthesis and applications in secondary metabolite discovery. (J Ind Microbiol Biotechnol. , 2011) - comment
- BLAST id79%
Amycolatopsis balhimycina
Putative uncharacterized protein
orf1に相当するentry.
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[PMID: 11932455](2002)
balhimycin生合成gene clusterにおけるbpsA, bpsB, bpsC, bpsD, orf1の同定。
orf1については配列解析のみ。orf1とそれに似たタンパクをコードする遺伝子はNRPSをコードするclusterにあり、bpsC/orf1は翻訳共役される。よって非リボソーム生合成での関与が示唆される。
Orf1(69aa)とchloroeremomycin cluster Orf6(56aa)は高い相同性があるが長さが異なる。しかしOrf6は上流の次のスタートコドンに変更すれば同じ長さになり、上流のCepCと翻訳共役する。
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[PMID: 16907743](2006)
orf1は、ほとんどすべてのNRPS生合成gene clustersにおいて同定されるmbtH-like geneである。すべてのグリコペプチド生合成gene clustersにおいて、orf1-like geneはいつもNRPSの最後のmoduleをコードする遺伝子の下流に位置する。
orf1 deletion mutantはbalhimycin産生に影響しなかった。これはOrf1がNRPSや複合体の安定化に関与しているからか、A. balhimycina染色体上に少なくともあと2つあるOrf1-like proteinが代替しているせいかもしれない。
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[PMID: 21826462](2011)
mbtH homologsに関するレビュー。
いくつかのケースで、MbtH-like proteinsはそれらの同族ペプチドの生合成に必要とされ、非同族MbtH-like proteinsは部分的に相補的であることが示されている。
いくつかのMbtHタンパク(PacJなど)はアデニル化反応を促進することが生化学的に示されている。
orf1についても述べられ、配列解析に使用されている。
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- ACC
- Q8GHC8
- PmId
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[21890635] Role of MbtH-like proteins in the adenylation of tyrosine during aminocoumarin and vancomycin biosynthesis. (J Biol Chem. , 2011) - comment
- BLAST id69%
Streptomyces roseochromogenes subsp. oscitans_cloY
MbtH-like protein
clorobiocin生合成遺伝子
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[PMID: 17464055](2007)
cloYのin-frame deletion株を作製。
宿主大腸菌のMbtH-like proteinも不活性化させ完全に欠損させるとclorobiocin合成は劇的に減少した。相補実験もされており、CloY(MbtH-like protein)は二次代謝産物生合成に関与することを示した。
また、宿主が持つMbtH-like proteinが相補できることから、異なるmbtH-like genesはお互いに機能を補えることも示した。CloYは、clorobiocin moleculeの3-amino-4,7-dihydroxy-coumarin moietyの形成を特異的に要求すると考察。
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[PMID: 21890635](2011)
aminocoumarin抗生物質やグリコペプチド系抗生物質の生合成において、Tyrアデニル化酵素はその活性にモル比率1:1のMbtH-like proteinを必要とする。
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- ACC
- Q50EC7
- PmId
- comment
- BLAST id65%
Streptomyces filamentosus (Streptomyces roseosporus)_dptG
DaptomycinはA21978C family天然産物の環状lipopeptideである。
ΔdptGHIJ mutantの相補実験でdptGHIJすべての存在がA21978Cの最大産生に必要とされることから、dptGはA21978Cの生合成でプラス効果を持つようだと述べている。
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- ACC
- E2EKP2
- PmId
- comment
- BLAST id43%
Streptomyces coeruleorubidus_pac10(pacJ)
MbtH domain-containing protein
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- ACC
- Q8RN06
- NITE
- Vanco_00110
- PmId
[21890635] Role of MbtH-like proteins in the adenylation of tyrosine during aminocoumarin and vancomycin biosynthesis. (J Biol Chem. , 2011) - comment
- BLAST id79%
Amycolatopsis orientalis_ORF127
Putative MbtH like protein
aminocoumarin抗生物質やグリコペプチド系抗生物質の生合成において、Tyrアデニル化酵素はその活性にモル比率1:1のMbtH-like proteinを必要とする。
MbtH-like proteinとして使用されているOrf1vanがこのentryに相当する。対応するTyrアデニル化酵素として使用されているのは、Chloroeremomycin cluster geneのPCZA361.18(Chlor_00200)である。
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- ACC
- A0A0A0V1G6
- PmId
- comment
- BLAST id81%
Amycolatopsis orientalis_vcm11
MbtH-like protein
vancomycin生合成gene clusterにおけるmbtH-like gene (vcm11)のdeletionはvancomycin産生を完全に廃止し、その相補株はvancomycin産生のほぼ完全な回復を示した。
同族(Vcm11)と非同族(CloY)のMbtH-like proteinの過剰発現で、vancomycin産生が増加した。
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Teicp_00150
Location
![[4-54] 1.20000117458134e-33 SM00923](../../img/R.gif "[4-54] 1.20000117458134e-33 SM00923"){kind=small}
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![[12-68] 1.3e-28 G3DSA:3.90.820.10](../../img/X2.gif "[12-68] 1.3e-28 G3DSA:3.90.820.10"){kind=small}
