Teicp_00170 : CDS information

Location

Organism	Actinoplanes teichomyceticus
Strain	DSM 43866 (=NBRC 13999)
Entry name	Teicoplanin
Contig	AJ632270
Start / Stop / Direction	41,804 / 42,625 / + [in whole cluster] 41,804 / 42,625 / + [in contig]
Location	41804..42625 [in whole cluster] 41804..42625 [in contig]
Type	CDS
Length	822 bp (273 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	deacetylase
Product (GenBank)	hypothetical protein
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword	N-acyl-glucosamine moiety
Note
Note (GenBank)	ORF2*
Reference	ACC Q6ZZJ1 PmId [15113000] Biosynthetic gene cluster of the glycopeptide antibiotic teicoplanin: characterization of two glycosyltransferases and the key acyltransferase. (Chem Biol. , 2004) [17044690] Glycopeptide biosynthesis: Dbv21/Orf2 from dbv/tcp gene clusters are N-Ac-Glm teicoplanin pseudoaglycone deacetylases and Orf15 from cep gene cluster is a Glc-1-P thymidyltransferase. (J Am Chem Soc. , 2006) [17009278] Identification of a deacetylase involved in the maturation of teicoplanin. (Chembiochem. , 2006) [18482700] The role of cep15 in the biosynthesis of chloroeremomycin: reactivation of an ancestral catalytic function. (Chem Biol. , 2008) [18559264] Crystal structures of lipoglycopeptide antibiotic deacetylases: implications for the biosynthesis of A40926 and teicoplanin. (Chem Biol. , 2008) [21267472] Regioselective deacetylation based on teicoplanin-complexed Orf2* crystal structures. (Mol Biosyst. , 2011) comment [PMID: 15113000](2004) DSM 43866株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。 tei orf2: Hypothetical protein --- [PMID: 17044690](2006) abstract Orf2はN-acetylglucosaminyl-teicoplanin pseudoaglyconeの脱アセチル化反応を触媒する。 --- [PMID: 17009278](2006) teicoplaninのN-acyl-glucosaminyl部分は、Orf10によりaglyconeへUDP-N-acetyl-glucosamineが付加され、その後Orf2による脱アセチル化を経て形成される。Orf2は天然teicoplaninのglucosamineのacy基を脱アシルすることもできる。 --- [PMID: 18482700](2008) wild株はaa4のglucosamine基に付着したN-アシル鎖の長さに違いのある一連のteicoplaninsを産生した。 orf2のin-frame deletion mutantは成熟したteicoplaninを産生せず、代わりにdoubly glycosylated teicoplanin と N-acetylglucosaminyl pseudoaglyconeを蓄積した。このmutantはorf2によって相補され、teicoplanin産生を回復した。この結果はteicoplanin生合成でのN-acetylglucosaminyl deacetylaseとして、Orf2の役割を実証する。aa6でglycosylateされたteicoplanin誘導体は分離されなかったので、in vivoではおそらくaa6へのglycosyl基移動の前にdeacetylation or acylationが起こる。また、deacetylasesとわかっているOrf2* and Dbv21と配列比較したところ、活性のないCep15とBal2はmetal-binding Hisの代わりにAsnを持っていた。そこで、Orf2のHisをAsnに置換すると不活性になった。逆にCep15のN164H mutantは活性のあるdeacetylaseとなった。 --- [PMID: 18559264](2008) pseudoaglycone deacetylases Orf2(teicoplanin) と Dbv21(A40926)の結晶構造解析。 --- [PMID: 21267472](2011) abstract Orf2*の複合型構造の解析。
Related Reference	ACC Q6ZZJ1 NITE Teicp2_00230 PmId [14702401] Organization of the teicoplanin gene cluster in Actinoplanes teichomyceticus. (Microbiology. , 2004) [18482700] The role of cep15 in the biosynthesis of chloroeremomycin: reactivation of an ancestral catalytic function. (Chem Biol. , 2008) [18559264] Crystal structures of lipoglycopeptide antibiotic deacetylases: implications for the biosynthesis of A40926 and teicoplanin. (Chem Biol. , 2008) comment DSM 43866株でのtei orf2とAA配列完全一致。 UniProt同一entry. ----- [PMID: 14702401](2004) ATCC 31121株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。 tcp ORF14: Unknown ORF14は他のグリコペプチドclusters(bal, cep, dbv)に一致するものがある。配列解析のみ。 --- [PMID: 18482700](2008) A. teichomyceticus ATCC 31121使用。しかしorf2/Orf2として挙げられているNCBI accession numberはAJ632270関連。クローニングと発現は、PMID: 17009278を参照している。コメントはDSM 43866株tei orf2(Teicp_00170)を参照。 --- [PMID: 18559264](2008) 使用株はATCCから購入したとの記載あり。コメントはDSM 43866株tei orf2*(Teicp_00170)を参照。

Sequence

>deacetylase [hypothetical protein]
MPHDPGATRLLAISPHLDDAVLSFGAGLAQAAQDGANVLVYTVFAGAAQPPYSPAAQRMH
TIWGLAPDDDAVLYRRKEDIAALDHLRVAHRHGRFLDSIYRKLPDGRWLTAHVEGRQKLA
VNDHSPDSDHDLVGEVADDIRSIIDEFDPTLVVTCAAIGEHPDHEATRDAALFATHEKNV
PVRLWEDLPYAVFKSGAVELPQGFRLGSADVSSVKPEMRSQKFQAVERYSSQMVLLNGSE
NNLFDRLDEHARQNAPHGGYGETTWPVVRSDDS

>deacetylase [hypothetical protein]
ATGCCTCACGACCCCGGTGCAACCCGGCTCCTGGCAATTTCCCCTCATCTGGACGACGCG
GTTCTGTCTTTCGGGGCCGGTCTGGCCCAGGCGGCACAGGACGGCGCGAATGTGCTCGTC
TATACGGTATTTGCCGGCGCCGCACAGCCTCCTTATTCCCCGGCGGCGCAGCGAATGCAC
ACGATCTGGGGCCTCGCGCCGGACGACGACGCGGTGCTCTACCGCCGGAAAGAAGACATC
GCCGCTCTTGATCACCTGAGGGTGGCTCATCGGCACGGCCGGTTCCTCGACTCCATCTAC
CGTAAGTTGCCGGACGGTCGTTGGCTGACCGCCCATGTGGAGGGCAGGCAGAAGCTGGCC
GTCAACGATCACTCGCCGGACAGCGACCATGACCTGGTTGGCGAGGTGGCGGACGACATC
AGGTCGATCATCGACGAGTTCGACCCGACGCTTGTCGTCACCTGTGCGGCCATCGGCGAA
CACCCCGACCATGAGGCGACGCGAGATGCCGCGCTGTTCGCCACGCACGAGAAGAACGTT
CCGGTACGGCTGTGGGAGGACCTGCCGTATGCGGTCTTCAAATCAGGTGCGGTCGAATTG
CCGCAGGGTTTTCGTCTCGGCTCTGCGGATGTCAGCTCGGTGAAGCCGGAGATGCGGTCG
CAGAAATTCCAAGCTGTGGAGCGGTATTCGTCTCAAATGGTGCTGCTCAACGGAAGTGAA
AACAATCTGTTCGACCGGCTGGACGAGCATGCTCGGCAGAATGCACCACACGGCGGATAC
GGCGAGACGACCTGGCCGGTCGTCCGCAGCGACGACAGCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR003737 N-acetylglucosaminyl phosphatidylinositol deacetylase (Family) PF02585 PIG-L IPR024078 Putative deacetylase LmbE-like domain (Domain) SSF102588 SSF102588 G3DSA:3.40.50.10320 G3DSA:3.40.50.10320
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Teicp_00160 Teicp_00180