Teicp_00250 : CDS information

Location

Organism	Actinoplanes teichomyceticus
Strain	DSM 43866 (=NBRC 13999)
Entry name	Teicoplanin
Contig	AJ632270
Start / Stop / Direction	53,863 / 55,089 / + [in whole cluster] 53,863 / 55,089 / + [in contig]
Location	53863..55089 [in whole cluster] 53863..55089 [in contig]
Type	CDS
Length	1,227 bp (408 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	glycosyltransferase UDP-N-acetyl-glucosamine transferase
Product (GenBank)	glycosyltransferase
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword	Hpg4 N-acyl-glucosamine moiety
Note
Note (GenBank)	ORF10*
Reference	ACC Q6ZZI3 PmId [15113000] Biosynthetic gene cluster of the glycopeptide antibiotic teicoplanin: characterization of two glycosyltransferases and the key acyltransferase. (Chem Biol. , 2004) [17009278] Identification of a deacetylase involved in the maturation of teicoplanin. (Chembiochem. , 2006) [27285718] Characterization of the Post-Assembly Line Tailoring Processes in Teicoplanin Biosynthesis. (ACS Chem Biol. , 2016) comment [PMID: 15113000](2004) DSM 43866株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。 tei orf10: Glycosyltransferase putative glycosyltransferases Orf1 and Orf10を異種性発現、精製し、teicoplanin (pseudo)aglyconeとのインキュベーション産物をLC-MSで解析した。Orf10は、teicoplanin aglyconeの4-hydroxyphenylglycine-4 (4Hpg)に、UDP-(N-acetyl)-glucosamineを移すglycosyltransferaseである。vancomycin aglycone、GDP-mannoseを基質として使用することはできない。 --- [PMID: 17009278](2006) teicoplaninのN-acyl-glucosamine部分は、Orf10によりaglyconeへUDP-N-acetyl-glucosamineが付加され、その後Orf2による脱アセチル化を経て形成される。 Orf10の天然基質がUDP-N-acetyl-glucosamineであることを確認している。 --- [PMID: 27285718](2016) tei10, tei3, tei11, tei13, tei30*を不活化したmutantを作製し、その結果から組立てライン後の仕立て過程の反応の順番を提唱している。
Related Reference	ACC Q6ZZI3 NITE Teicp2_00320 PmId [11386360] Teicoplanin biosynthesis genes in Actinoplanes teichomyceticus. (Antonie Van Leeuwenhoek. , 2000) [14702401] Organization of the teicoplanin gene cluster in Actinoplanes teichomyceticus. (Microbiology. , 2004) [17661468] Kinetic analysis of teicoplanin glycosyltransferases and acyltransferase reveal ordered tailoring of aglycone scaffold to reconstitute mature teicoplanin. (J Am Chem Soc. , 2007) comment DSM 43866株でのtei orf10*とAA配列完全一致。 UniProt同一entry. ----- [PMID: 11386360](2000) balhimycin clusterのbgtfAを用いてteicoplanin gene clusterを同定。 --- [PMID: 14702401](2004) ATCC 31121株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。 tcp ORF23: Glycosyltransferase GtfB ORF23はaa4を特異的にglycosylateするGtfBsに最も関連する。 ORF23によってコードされるtGtfBを過剰発現したE. coli抽出物とHis6-tGtfBは、teicoplanin aglycone, UDP-N-acetyl-glucosamineと共にインキュベーションされ新しいピークをもたらした。このピークは、標準化合物4(aa6にUDP-N-acetyl-glucosamineが付加したaglycone)とretention timeは異なるが分子量は同じなので、おそらくaa4にUDP-N-acetyl-glucosamineが付加された化合物3だとしている。 teicoplanin aglyconeの代わりに、化合物4やvancomycin aglyconeを用いても産物は得られなかった。UDP-N-acetylgalactosamine, U/TDP-glucose, UDP-galactoseも基質とはならなかった。 --- [PMID: 17661468](2007) teicoplanin glycosyltransferases (tGtfA and tGtfB) と acyltransferase (tAtf) の詳細な動態特徴づけの報告。基質による活性の違いから反応の順番が確定している。まずtGtfBが架橋済teicoplanin aglyconeのpositoin 4に、その次にtGtfAがposition 6にglycosylateする。acyltransferase tAtfはteicoplaninに繋がれた糖で働く。

Sequence

>glycosyltransferase [glycosyltransferase]
MRVLLSTTGGRGDVEPLVALAVRFRELGVDARVCAPPDCADRLAGVGVPLVEVGESVRAM
MHGGKRPSPEDAPRLDAEAIATQFDKVPAAAEGCAAVVTTGLLSAAVAVRSVAEKLRIPY
VYAAYCPIYLPSPYYPPPPALGGPPVPELTDNRAQWNRHSQGAYRRFGAALNSHRAAIGL
PPVENIYDYAFSDHPWLAADPVLAPLQPTDLDVVQTGAWILPDQRPLSAELEGFLRAGSP
PVYVGFGSGPAPAEAARVAIEAVRAQGRRVVLSSGWAGLGRIDEGDDCLVVGEVNHQVLF
GRVAAVVHAGSAGTTTAVTRAGAPQVVVPQMTDQPYYAGRVADLGVGVAHDGPTPTVESL
SAALATALTPGIRARAAAVAGTIRTDGTTVAAKLLLEAISRQRSSVSA

>glycosyltransferase [glycosyltransferase]
ATGCGTGTGTTGTTGTCGACGACCGGAGGGCGCGGCGACGTCGAACCGCTGGTCGCGCTG
GCGGTGCGGTTCCGCGAACTGGGTGTGGACGCGCGGGTCTGCGCACCGCCGGACTGCGCG
GACCGGCTGGCCGGCGTCGGTGTGCCACTGGTGGAGGTCGGCGAGTCGGTGCGCGCGATG
ATGCACGGAGGGAAGCGGCCGTCGCCCGAGGACGCGCCCCGGCTCGACGCCGAGGCCATC
GCTACGCAGTTCGACAAGGTCCCGGCGGCCGCCGAGGGCTGCGCCGCGGTGGTGACGACC
GGCCTGTTGTCCGCCGCGGTCGCGGTGCGGTCCGTGGCCGAGAAGCTGCGCATCCCCTAC
GTCTACGCCGCCTACTGCCCGATCTATCTGCCGTCGCCGTACTACCCGCCGCCGCCGGCC
CTGGGCGGCCCGCCCGTACCGGAACTGACCGACAACCGGGCGCAGTGGAACAGGCACAGC
CAGGGTGCCTACCGGCGGTTCGGCGCCGCGCTCAACAGCCACCGGGCGGCGATCGGCCTG
CCGCCGGTGGAGAACATCTACGACTACGCCTTCAGCGATCACCCGTGGCTGGCGGCCGAT
CCGGTCCTGGCCCCGCTGCAGCCGACCGATCTCGACGTGGTGCAGACCGGCGCGTGGATC
CTGCCCGACCAGCGGCCGTTGTCGGCGGAGTTGGAGGGGTTCTTGAGGGCTGGCTCGCCT
CCGGTGTACGTGGGTTTCGGCAGTGGGCCGGCGCCTGCCGAGGCCGCGCGGGTGGCCATC
GAGGCGGTTCGGGCTCAGGGCCGCCGGGTGGTGCTGTCCAGTGGTTGGGCCGGGTTGGGC
CGGATCGACGAGGGGGATGACTGTCTGGTGGTGGGCGAGGTGAACCATCAGGTGCTGTTC
GGCCGGGTGGCCGCCGTCGTCCACGCCGGCAGTGCGGGCACGACGACCGCGGTGACCCGG
GCGGGCGCTCCGCAGGTCGTGGTGCCCCAGATGACGGATCAGCCCTACTATGCCGGTCGG
GTGGCTGACCTGGGTGTCGGCGTGGCGCATGACGGTCCGACCCCGACCGTCGAGTCCCTG
TCCGCGGCGCTGGCCACGGCATTGACCCCGGGGATCCGGGCGCGAGCGGCGGCGGTGGCC
GGCACGATCCGCACCGACGGGACGACGGTGGCCGCGAAACTGCTCCTCGAGGCGATCAGC
CGGCAGAGATCGTCGGTCTCCGCGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR004276 Glycosyl transferase, family 28 (Domain) PF03033 Glyco_transf_28
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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