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Teicp_00330 : CDS information

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Organism
StrainDSM 43866 (=NBRC 13999)
Entry nameTeicoplanin
Contig
Start / Stop / Direction67,556 / 68,221 / + [in whole cluster]
67,556 / 68,221 / + [in contig]
Location67556..68221 [in whole cluster]
67556..68221 [in contig]
TypeCDS
Length666 bp (221 aa)
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Category2.1 modification addition of extender units
Productputative enoyl-CoA hydratase
Product (GenBank)DpgB protein
GenedpgB
Gene (GenBank)
EC number4.2.1.-
Keyword
  • Dpg
Note
Note (GenBank)
  • ORF18*
Reference
ACC
PmId
[15113000] Biosynthetic gene cluster of the glycopeptide antibiotic teicoplanin: characterization of two glycosyltransferases and the key acyltransferase. (Chem Biol. , 2004)
comment
DSM 43866株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。

tei orf18*: DpgB

配列解析のみ。DpgA-DとHpgTは3,5-dihydroxyphenylglycine (Dpg)の合成に関与する。
Related Reference
ACC
Q6ZZH5
NITE
Teicp2_00400
PmId
[14702401] Organization of the teicoplanin gene cluster in Actinoplanes teichomyceticus. (Microbiology. , 2004)
comment
DSM 43866株でのtei orf18*とAA配列完全一致。
UniProt同一entry.

---
ATCC 31121株teicoplanin生合成gene clusterの同定論文。

tcp ORF31: DpgB

配列解析のみ。ORFs 30-33はDpgA-Dをコードし、dihydroxyphenylglycine (DPG) 合成に要求される。
ACC
O52796
NITE
Chlor_00290
PmId
[11752437] Glycopeptide antibiotic biosynthesis: enzymatic assembly of the dedicated amino acid monomer (S)-3,5-dihydroxyphenylglycine. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2001)
comment
BLAST id53%
Amycolatopsis orientalis (Nocardia orientalis)
PCZA361.7

ORF28, dpgBに相当するentry.

---
chloroeremomycin産生株A. orientalis NRRL 18098由来dpgA-D（もともとはORFs 27-30としてリストされたもの）を、E. coliで発現・精製し、酵素活性と産物同定の実験に使用している。

DpgAはmalonyl-CoAから3,5-dihydroxyphenylacetyl-CoA(DPA-CoA)とCoASHを産生。DPA-CoAはかろうじて検出できる程度だが、DpgBを追加すると劇的に産生促進された。DpgB単独ではmalonyl-CoAを基質として活性を持たない。DpgA/DpgBによるmalonyl-CoA利用のkcat and Km値測定あり。

DpgBの代わりにDpgDを加えてもDpgA活性に影響はなかったが、DpgA/DpgBにDpgDを加えるとさらに2倍の増加が見られた。

DpgB and DpgDは、β-hydroxy acyl-CoA基質→α,β-enoyl-CoAsへの可逆的dehydrationを触媒するcrotonase superfamilyのメンバーに似ていることから、いくつかのenoyl-CoA and β-hydroxy acyl-CoA基質でテストされた。crotonyl- and β-methylcrotonyl-CoAでのhydratase活性が検出されたが、kcat値が低かったのでこれらは生理学的基質ではない。Dpg生合成では逆反応のdehydratasesとして働き、DPA-SR(R = DpgA or CoA)へのaromatizationを促進するのかもしれない。

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selected fasta
>putative enoyl-CoA hydratase [DpgB protein]
MTAAGVDDLVLRIDGSEPVTPATVEAVLGICDRAEDGYAAGLLTVHVSGVPAPGWTSDLS
VGLTTKWERAVRRLERLGLLTAGVATGDCGGAALDLLLATDVRIAVAGARLVVPVSGDAT
WPGMALYRLARQGATAGLRRAALLGTPLDAARAVAAGVIDVVVDRPEPALAEIAAAAAGI
TGTELAIRRQLMLDAAEHSFEEAVGSHLAACDRTLRRAAAS
selected fasta
>putative enoyl-CoA hydratase [DpgB protein]
GTGACCGCGGCCGGCGTCGACGACCTGGTGCTGCGGATCGACGGGAGCGAGCCGGTCACG
CCGGCCACCGTCGAGGCGGTGCTGGGCATCTGTGATCGGGCCGAGGACGGGTACGCCGCC
GGGCTGCTGACCGTCCACGTCTCGGGCGTCCCGGCTCCCGGCTGGACGAGCGACCTCAGC
GTCGGCCTGACGACCAAGTGGGAGCGCGCCGTCCGCCGGCTGGAGCGCCTCGGCCTGCTC
ACCGCCGGGGTGGCCACCGGCGACTGCGGCGGCGCGGCGCTGGACCTGCTGCTGGCCACC
GACGTGCGGATCGCCGTCGCCGGCGCCCGGCTGGTCGTCCCGGTGAGCGGCGACGCGACC
TGGCCGGGCATGGCGCTGTACCGGCTCGCCCGGCAGGGCGCCACCGCCGGGCTGCGCCGG
GCCGCCCTGCTCGGCACCCCGCTCGACGCCGCTCGGGCGGTGGCGGCCGGGGTGATCGAC
GTGGTGGTGGACCGGCCCGAGCCGGCGCTCGCCGAGATCGCCGCCGCGGCGGCCGGCATC
ACCGGCACCGAGCTGGCCATCCGGCGGCAGCTGATGCTCGACGCCGCGGAGCACAGCTTC
GAGGAGGCGGTCGGCTCGCACCTGGCCGCGTGCGACCGGACCCTGCGCCGGGCGGCGGCG
TCATGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001753 Crotonase, core (Domain)
[66-203] 1.8e-05 PF00378
PF00378   ECH
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Teicp_00320 Teicp_00320   Teicp_00340 Teicp_00340
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