A4793_00010 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces toyocaensis
Strain	NRRL 15009
Entry name	A47934
Contig	U82965
Start / Stop / Direction	2,022 / 766 / - [in whole cluster] 2,022 / 766 / - [in contig]
Location	complement(766..2022) [in whole cluster] complement(766..2022) [in contig]
Type	CDS
Length	1,257 bp (418 aa)

Annotation

Category	4.3 transport
Product	putative transporter
Product (GenBank)	StaN
Gene	staN ORF34
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	integral membrane ion transporter
Reference	ACC Q8KLM5 PmId [12060705] Assembling the glycopeptide antibiotic scaffold: The biosynthesis of A47934 from Streptomyces toyocaensis NRRL15009. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2002) comment Streptomyces toyocaensis NRRL15009由来A47934生合成gene clusterの同定論文。 34のORFsからなるclusterは、A47934の生合成とその調節に必要だと予測される遺伝子をすべて含む。グリコペプチド耐性を担う酵素をコードするORFsも含む。 StaN: Integral membrane ion transporter putative ABC transport protein StaT(おそらくStaUのこと)と協力して、もしくは単独で、細胞内部から環境へ抗生物質を排出する役割をするかもしれない。配列解析のみ。
Related Reference	ACC Q6BJU7 PmId [17559408] ( , ) comment BLAST id33%, C末側500aaほど余る Debaryomyces hansenii(Yeast)_KHA1 Putative sodium KHA1 transporter Debaryomyces hansenii kha1の機能解析。アミノ酸配列はNa+/H+ transporterのクラスに属した。また、Na(+)に対して高い耐性を示すが、他のtoxic cationsあるいはstress factorsには耐性を示さないことを確認している。しかし、機能を同定するにはまだ実験が不十分であるとも言っている。現時点ではputative Na+ transporter。
Family/Domain	FD IPR006153 comment [IPR006153] Cation/H+ exchanger (Domain) Function : solute:proton antiporter activity

Sequence

>putative transporter [StaN]
MLAGLAVTFAVAFVFARLAKRIRQPRVMGEIIAGLALGPSLLGLLPGDPVEALFPADARP
VLQALSQLGLVLFMFGIGYELDFALLRGAGSRVTLVSLSSMALPMALGAGLAVLLFPLYD
KSQLSSDGVLAPAIFLGVAMSITAFPVLARIIAENGMQRTRIGAMALACAVVQDFLAWCV
LAVAVVIATASGLWPLARMVLESGLFLGVLLYVVRPGLRRLLAPERRRAVGSSLIHAILV
TGLLVSAWATHEIGLHAVFGAFAFGAVVPHRHIEVQAPQVVERIEQTSLFLLPVFFTVTG
LSVDVGGLGRTGLIMTVAVVLVACTGKYVGAAVSARLTGASKAESRTLGVLLNARGLTEL
VILNVGLGLGVLDSRLFSAMVVMALVTTFMTGPLLHRLGFHEELRLVPAPVKNADNSV

>putative transporter [StaN]
ATGCTCGCGGGCCTCGCGGTGACCTTCGCCGTGGCATTCGTCTTCGCCCGGCTCGCCAAG
CGCATTCGGCAACCCAGGGTCATGGGAGAGATCATCGCCGGTCTTGCCCTGGGGCCGAGC
CTGTTGGGCCTCTTACCGGGAGACCCCGTCGAAGCGTTGTTCCCGGCGGACGCACGGCCG
GTCCTTCAGGCGCTCTCGCAGCTCGGACTCGTCCTGTTCATGTTCGGCATCGGCTACGAA
CTGGACTTCGCCCTTCTTCGGGGGGCCGGCAGCCGGGTCACCTTGGTCTCACTCAGCTCC
ATGGCGCTGCCGATGGCGCTGGGGGCCGGGCTCGCCGTTCTCCTCTTCCCTCTGTACGAC
AAGTCGCAGCTCAGCAGCGACGGTGTGCTCGCCCCGGCGATCTTCCTCGGGGTGGCGATG
TCGATCACGGCGTTCCCGGTGCTGGCCCGGATCATCGCGGAAAACGGCATGCAACGCACC
CGCATCGGTGCCATGGCGCTCGCCTGTGCCGTCGTCCAGGACTTCCTCGCCTGGTGTGTA
CTGGCCGTTGCCGTGGTGATCGCCACCGCAAGTGGTCTGTGGCCGCTGGCGCGGATGGTG
CTGGAGTCCGGCCTGTTCCTGGGCGTCCTCCTCTACGTCGTGCGACCGGGGCTGCGTCGG
CTGCTGGCCCCGGAGCGGAGGCGGGCGGTCGGCAGCTCCCTGATCCACGCCATCCTCGTC
ACCGGACTGCTGGTGTCCGCCTGGGCGACCCACGAGATCGGCCTGCACGCCGTCTTCGGT
GCCTTCGCCTTCGGCGCCGTGGTGCCCCACCGCCACATAGAGGTGCAGGCCCCCCAGGTC
GTCGAGCGCATCGAGCAGACCAGTCTCTTTCTGCTGCCGGTCTTCTTCACCGTGACCGGC
CTGTCGGTGGACGTCGGCGGGCTCGGCAGAACCGGCCTGATCATGACCGTCGCCGTCGTG
CTGGTGGCCTGCACGGGGAAGTACGTCGGCGCCGCCGTCTCCGCACGACTGACCGGCGCC
TCGAAGGCCGAGTCGAGAACGCTCGGCGTCCTGCTCAACGCCCGCGGACTCACAGAACTG
GTCATCCTGAACGTGGGCCTCGGGCTCGGCGTGCTGGACAGTCGTCTGTTCAGTGCCATG
GTCGTCATGGCACTGGTCACCACCTTCATGACGGGACCACTGCTGCACCGCCTCGGATTC
CACGAGGAACTGCGACTGGTTCCGGCTCCCGTGAAGAACGCGGACAACAGCGTCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR006153 Cation/H+ exchanger (Domain) PF00999 Na_H_Exchanger
SignalP	No significant hit
TMHMM	Transmembrane 12

first A4793_00020