Category | 1.4 Other |
Product | putative MbtH-like protein |
Product (GenBank) | PCZA363.8 |
Gene | cepD ORF6 |
Gene (GenBank) | |
EC number | |
Keyword | |
Note | - The N-terminal position was modified from original INSDC entry.
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Note (GenBank) | |
Reference | - ACC
- O52824
- PmId
[9545426] Sequencing and analysis of genes involved in the biosynthesis of a vancomycin group antibiotic. (Chem Biol. , 1998)
[12596194] Vancomycin assembly: nature's way. (Angew Chem Int Ed Engl. , 2003) - comment
- [PMID: 9545426](1998)
chloroeremomycin生合成 gene clusterの報告。
ORF6(56aa): Hypothetical protein in M. tuberculosis
配列解析のみ。詳細記載なし。
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[PMID: 12596194](2003)
グリコペプチド系抗生物質の生合成に関するレビュー。
chloroeremomycin-producing (Cep) A. orientalis由来約40genesのうち、明らかにグリコペプチド生合成経路に割り当てられる30genesを、タンパク名、予測された or 知られた機能、酵素活性の補助基質・補因子などと共にリスト化している。
>Orf6
metabolic pathway : unknown function
protein name : CepD (69aa)
クローニングや精製、解析はこれまでされていない。
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Related Reference | - ACC
- Q939Y8
- NITE
- Balhi_00100
- PmId
[11932455] Nonribosomal biosynthesis of vancomycin-type antibiotics: a heptapeptide backbone and eight peptide synthetase modules. (Microbiology. , 2002)
[16907743] The small MbtH-like protein encoded by an internal gene of the balhimycin biosynthetic gene cluster is not required for glycopeptide production. (FEMS Microbiol Lett. , 2006)
[21826462] Function of MbtH homologs in nonribosomal peptide biosynthesis and applications in secondary metabolite discovery. (J Ind Microbiol Biotechnol. , 2011) - comment
- BLAST id94%
Amycolatopsis balhimycina
Putative uncharacterized protein
orf1に相当するentry.
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[PMID: 11932455](2002)
balhimycin生合成gene clusterにおけるbpsA, bpsB, bpsC, bpsD, orf1の同定。
orf1については配列解析のみ。orf1とそれに似たタンパクをコードする遺伝子はNRPSをコードするclusterにあり、bpsC/orf1は翻訳共役される。よって非リボソーム生合成での関与が示唆される。
Orf1(69aa)とchloroeremomycin cluster Orf6(56aa)は高い相同性があるが長さが異なる。しかしOrf6は上流の次のスタートコドンに変更すれば同じ長さになり、上流のCepCと翻訳共役する。
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[PMID: 16907743](2006)
orf1は、ほとんどすべてのNRPS生合成gene clustersにおいて同定されるmbtH-like geneである。すべてのグリコペプチド生合成gene clustersにおいて、orf1-like geneはいつもNRPSの最後のmoduleをコードする遺伝子の下流に位置する。
orf1 deletion mutantはbalhimycin産生に影響しなかった。これはOrf1がNRPSや複合体の安定化に関与しているからか、A. balhimycina染色体上に少なくともあと2つあるOrf1-like proteinが代替しているせいかもしれない。
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[PMID: 21826462](2011)
mbtH homologsに関するレビュー。
いくつかのケースで、MbtH-like proteinsはそれらの同族ペプチドの生合成に必要とされ、非同族MbtH-like proteinsは部分的に相補的であることが示されている。
いくつかのMbtHタンパク(PacJなど)はアデニル化反応を促進することが生化学的に示されている。
orf1についても述べられ、配列解析に使用されている。
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- ACC
- Q50EC7
- PmId
- comment
- BLAST id69%
Streptomyces filamentosus (Streptomyces roseosporus)_dptG
DaptomycinはA21978C family天然産物の環状lipopeptideである。
ΔdptGHIJ mutantの相補実験でdptGHIJすべての存在がA21978Cの最大産生に必要とされることから、dptGはA21978Cの生合成でプラス効果を持つようだと述べている。
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- ACC
- Q8GHC8
- PmId
-
[21890635] Role of MbtH-like proteins in the adenylation of tyrosine during aminocoumarin and vancomycin biosynthesis. (J Biol Chem. , 2011) - comment
- BLAST id62%
Streptomyces roseochromogenes subsp. oscitans_cloY
MbtH-like protein
clorobiocin生合成遺伝子
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[PMID: 17464055](2007)
cloYのin-frame deletion株を作製。
宿主大腸菌のMbtH-like proteinも不活性化させ完全に欠損させるとclorobiocin合成は劇的に減少した。相補実験もされており、CloY(MbtH-like protein)は二次代謝産物生合成に関与することを示した。
また、宿主が持つMbtH-like proteinが相補できることから、異なるmbtH-like genesはお互いに機能を補えることも示した。CloYは、clorobiocin moleculeの3-amino-4,7-dihydroxy-coumarin moietyの形成を特異的に要求すると考察。
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[PMID: 21890635](2011)
aminocoumarin抗生物質やグリコペプチド系抗生物質の生合成において、Tyrアデニル化酵素はその活性にモル比率1:1のMbtH-like proteinを必要とする。
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- ACC
- E2EKP2
- PmId
- comment
- BLAST id49%
Streptomyces coeruleorubidus_pac10(pacJ)
MbtH domain-containing protein
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- ACC
- Q8RN06
- NITE
- Vanco_00110
- PmId
[21890635] Role of MbtH-like proteins in the adenylation of tyrosine during aminocoumarin and vancomycin biosynthesis. (J Biol Chem. , 2011) - comment
- BLAST id93%
Amycolatopsis orientalis_ORF127
Putative MbtH like protein
aminocoumarin抗生物質やグリコペプチド系抗生物質の生合成において、Tyrアデニル化酵素はその活性にモル比率1:1のMbtH-like proteinを必要とする。
MbtH-like proteinとして使用されているOrf1vanがこのentryに相当する。対応するTyrアデニル化酵素として使用されているのは、Chloroeremomycin cluster geneのPCZA361.18(Chlor_00200)である。
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- ACC
- A0A0A0V1G6
- PmId
- comment
- BLAST id92%
Amycolatopsis orientalis_vcm11
MbtH-like protein
vancomycin生合成gene clusterにおけるmbtH-like gene (vcm11)のdeletionはvancomycin産生を完全に廃止し、その相補株はvancomycin産生のほぼ完全な回復を示した。
同族(Vcm11)と非同族(CloY)のMbtH-like proteinの過剰発現で、vancomycin産生が増加した。
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