Chlor_00130 : CDS information

Location

Organism	Amycolatopsis orientalis
Strain	A82846UV37B
Entry name	Chloroeremomycin
Contig	AJ223998
Start / Stop / Direction	38,065 / 39,288 / + [in whole cluster] 3,821 / 5,044 / + [in contig]
Location	38065..39288 [in whole cluster] 3821..5044 [in contig]
Type	CDS
Length	1,224 bp (407 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	glycosyltransferase
Product (GenBank)	PCZA361.20
Gene	gtfB ORF12
Gene (GenBank)
EC number	2.4.1.310
Keyword	D-glucose Hpg4
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC P96559 PmId [9545426] Sequencing and analysis of genes involved in the biosynthesis of a vancomycin group antibiotic. (Chem Biol. , 1998) [9115410] Production of hybrid glycopeptide antibiotics in vitro and in Streptomyces toyocaensis. (Chem Biol. , 1997) [11294642] Tandem action of glycosyltransferases in the maturation of vancomycin and teicoplanin aglycones: novel glycopeptides. (Biochemistry. , 2001) [11470430] Structure of the UDP-glucosyltransferase GtfB that modifies the heptapeptide aglycone in the biosynthesis of vancomycin group antibiotics. (Structure. , 2001) [19549605] Chimeric glycosyltransferases for the generation of hybrid glycopeptides. (Chem Biol. , 2009) comment [PMID: 9545426](1998) chloroeremomycin生合成 gene clusterの報告。 ORF12/GtfB(407aa): Glycosyl transferase 詳細記載は下記論文を引用。 --- [PMID: 9115410](1997) ・A82846B(chloroeremomycin)産生菌A. orientalis A82846由来 gtfA, gtfB, gtfC ・vancomycin産生菌A. orientalis C329.4由来 gtfD, gtfE のクローニング、配列解析、E. coli発現して得た未精製抽出物を用いたGtfB, GtfEの活性測定など。配列解析から、GtfBとGtfEは同じ機能を持つと考えられた。 GtfBとGtfE'(single serine-for-proline置換ありGtfE変異体) は、dTDP-D-glucose, UDP-D-glucose, UDP-D-xyloseをsugar donorとしてaglycosyl vancomycinへglucoseを付加した。 GtfE' はdTDP-glucose or UDP-glucoseから代替heptapeptide cores A47934 and A41030Aにglucoseを効率的に付加し、抗菌活性産物をもたらした。GtfBはdTDP-D-glucoseからA41030Aにはglucoseを付加できるが、A47934にはできなかった。（この違いはGtfE'における1aa置換のせいではない。） --- [PMID: 11294642](2001) ・chloroeremomycin産生A. orientalis A82846由来 GtfB, C ・vancomycin産生A. orientalis ATCC19795由来 GtfD, E をコードする遺伝子をE. coliでサブクローニング、発現、精製し、活性の特徴づけをしている。 GtfBの活性により、UDP-glucoseとvancomycin aglyconeから、そのmonoglucosyl中間体であるvancomycin pseudoaglyconeが産生されることをHPLCで確認している。 GtfEは同様の活性があり、さらにteicoplanin aglyconeへのglucose移動もできた。 GtfB/Eによって付加されたglucose部分の2-OHに、GtfC/Dが4-epi-vancosaminyl基を付加することも確認されている。 --- [PMID: 11470430](2001) GtfBの結晶構造解析。 2つのdomainから成り、N末domainとC末domainの間にsingle major interdomain linkerがある。 --- [PMID: 19549605](2009) GtfBとteicoplanin生合成cluster Orf10*のN末domainとC末domainを入れ替えたGtfBキメラ = GtfBH1, GtfBH2を作成。 acceptorとして・AGT (teicoplanin aglycones) ・AGV (vancomycin aglycones) donor(糖)として・UDP-glucose ・UDP-N-acetylglucosamine を用いてglycosyltransferase活性をテストした。また、donor特異性を探索するため競合アッセイを使用した。結果から、N末domainがacceptor、C末domainがdonor(糖)の特異性を指示するが、C末domainによる調節はN末domainほど絶対的ではないことがわかった。

Sequence

>glycosyltransferase [PCZA361.20]
MRVLLATCGSRGDTEPLVALAVRVRDLGADVRMCAPPDCAERLAEVGVPHVPVGPSARAP
IQRAKPLTAEDVRRFTTEAIATQFDEIPAAAEGCAAVVTTGLLAAAIGVRSVAEKLGIPY
FYAFHCPSYVPSPYYPPPPLGEPSTQDTIDIPAQWERNNQSAYQRYGGLLNSHRDAIGLP
PVEDIFTFGYTDHPWVAADPVLAPLQPTDLDAVQTGAWILPDERPLSPELAAFLDAGPPP
VYLGFGSLGAPADAVRVAIDAIRAHGRRVILSRGWADLVLPDDGADCFAIGEVNHQVLFG
RVAAVIHHGGAGTTHVAARAGAPQILLPQMADQPYYAGRVAELGVGVAHDGPIPTFDSLS
AALATALTPETHARATAVAGTIRTDGAAVAARLLLDAVSREKPTVSA

>glycosyltransferase [PCZA361.20]
ATGCGTGTGCTGTTGGCGACGTGTGGATCGCGCGGAGATACCGAACCGCTGGTGGCACTG
GCGGTTCGGGTGCGGGACCTCGGCGCGGATGTGCGGATGTGCGCACCGCCGGACTGCGCG
GAGCGGCTGGCCGAGGTAGGTGTGCCGCATGTGCCCGTCGGCCCGTCGGCGCGCGCGCCG
ATCCAGCGAGCGAAACCGTTGACGGCCGAGGACGTGCGCCGGTTCACGACCGAGGCGATC
GCTACGCAGTTCGACGAGATCCCGGCGGCGGCCGAGGGGTGTGCCGCGGTGGTGACCACC
GGCCTGCTGGCCGCCGCGATCGGCGTGCGGTCGGTGGCCGAGAAGCTGGGCATCCCCTAC
TTCTATGCCTTCCACTGTCCGAGTTATGTGCCGTCGCCGTACTATCCGCCGCCGCCCCTC
GGCGAACCGTCCACACAGGACACGATCGACATTCCGGCGCAGTGGGAGCGGAACAACCAG
AGCGCCTACCAGCGGTACGGCGGCCTGCTCAACAGCCACCGGGACGCGATCGGCCTGCCA
CCGGTGGAGGACATCTTCACCTTCGGCTACACCGATCACCCCTGGGTGGCGGCGGATCCG
GTGCTGGCCCCGCTGCAGCCGACAGACCTCGACGCCGTGCAGACCGGCGCGTGGATCCTG
CCCGACGAACGGCCGCTTTCCCCGGAGCTGGCGGCGTTTCTGGACGCCGGCCCACCGCCG
GTGTACCTGGGGTTCGGCAGCCTGGGCGCACCTGCTGACGCGGTCCGGGTGGCCATCGAC
GCGATCCGTGCCCATGGCCGCCGGGTGATCCTTTCCCGTGGCTGGGCCGATTTGGTCCTG
CCCGACGACGGTGCCGACTGCTTCGCGATCGGCGAAGTGAACCATCAGGTGCTGTTCGGC
CGAGTCGCCGCCGTCATCCACCACGGCGGCGCGGGCACGACGCACGTGGCCGCGCGGGCA
GGTGCACCCCAGATCCTGTTGCCCCAGATGGCGGACCAGCCGTACTACGCCGGCCGGGTG
GCCGAACTGGGTGTTGGTGTGGCACATGATGGTCCAATTCCGACCTTCGATTCCTTGTCG
GCCGCGCTTGCCACGGCTCTGACCCCCGAAACCCACGCGCGAGCGACGGCCGTGGCAGGC
ACGATCCGCACCGACGGGGCAGCGGTGGCCGCGCGGTTGCTGCTCGACGCGGTCAGTCGG
GAAAAGCCGACTGTTTCCGCGTAA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR004276 Glycosyl transferase, family 28 (Domain) PF03033 Glyco_transf_28
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Chlor_00120 Chlor_00140