| Category | 1.4 Other |
|---|
| Product | putative type II thioesterase |
|---|
| Product (GenBank) | type-II thioesterase |
|---|
| Gene | TPA0598_03_00870 |
|---|
| Gene (GenBank) | |
|---|
| EC number | |
|---|
| Keyword | |
|---|
| Note | |
|---|
| Note (GenBank) | |
|---|
| Reference | - ACC
- A0A0P4R3P5
- PmId
[26380643] Draft genome sequence of marine-derived Streptomyces sp. TP-A0598, a producer of anti-MRSA antibiotic lydicamycins. (Stand Genomic Sci. , 2015) - comment
- Streptomyces sp. TP-A0598におけるputative lydicamycin biosynthetic gene clusterの報告。
このclusterが実際にlydicamycin産生に関わるかどうかの実験的な確認はされていない。
TPA0598_03_00870(253aa): type-II thioesterase
本文中にコメントなし。
|
|---|
| Related Reference | - ACC
- Q846W2
- NITE
- Monen_00290
- PmId
[16984884] Identification of NanE as the thioesterase for polyether chain release in nanchangmycin biosynthesis. (Chem Biol. , 2006) - comment
- BLAST id54%
Streptomyces cinnamonensis_monAX
Thioesterase
対照実験として。
MonAXはdiketide-SNACを加水分解したが、polyether-SNACを加水分解しなかった。
よって、polyether鎖の放出には関与しない。
|
|---|
- ACC
- Q7BUF9
- NITE
- Rifam_00540
- PmId
[19103602] Structure and functional analysis of RifR, the type II thioesterase from the rifamycin biosynthetic pathway. (J Biol Chem. , 2009) - comment
- BLAST id53%
Amycolatopsis mediterranei_rifR
RifR
[DoBISCUIT]type II thioesterase
RifRは、acyl-CoAsよりもacyl carrier domainのphosphopantetheinyl armからのacyl unitsを加水分解する(Steady-state kinetics)。
helical lidの運動が、RifR active siteへの基質のアクセスを調節する(立体構造解析)。
RifRがCoA基質よりACP基質への反応を好むことは、type II thioesteraseがcarrier domainsから異常unitsを除くようなhousekeeping functionsをすると考えられていることに一致する。
|
- ACC
- Q9ZGI1
- NITE
- Pikro_00070
- PmId
[9770448] A gene cluster for macrolide antibiotic biosynthesis in Streptomyces venezuelae: architecture of metabolic diversity. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1998)
[10421766] Elucidating the mechanism of chain termination switching in the picromycin/methymycin polyketide synthase. (Chem Biol. , 1999)
[10676969] Alternative modular polyketide synthase expression controls macrolactone structure. (Nature. , 2000)
[10713461] Genetic architecture of the polyketide synthases for methymycin and pikromycin series macrolides. (Gene. , 2000)
[11223265] The Streptomyces venezuelae pikAV gene contains a transcription unit essential for expression of enzymes involved in glycosylation of narbonolide and 10-deoxymethynolide. (Gene. , 2001)
[12368286] Biochemical evidence for an editing role of thioesterase II in the biosynthesis of the polyketide pikromycin. (J Biol Chem. , 2002) - comment
- BLAST id53%
Streptomyces venezuelae_pikAV
Thioesterase II PikAV
---
[PMID: 9770448](1998)
12員環骨格を持つMethymycin and Neomethymycinと、14員環骨格を持つNarbomycin and Pikromycinの生合成で共有されるclusterの同定。
PikAV: TEII
pikAV deletion/replacement mutantはmethymycin, neomethymycin or pikromycinを、wild-type S.venezuelaeと比べて5%以下しか産生しなかった。それらの中間体である10-deoxymethynolide or narbonolideの蓄積も検出されなかった。
---
[PMID: 10421766](1999)
pikAI-AIVをS. lividansで異種性発現し、12員環前駆体10-deoxymethynolideと14員環前駆体narbonolideの産生を確認。Pik TEII thioesterase(pikAV)も同時に発現させると産生レベルは増加するが、2つの化合物の比率は変わらない。
---
[PMID: 10676969](2000)
PikAIVのTE domain, TEII gene(pikAV)に関するmutantを作成。
TEII 単独ではpolyketide終結に十分でない。
---
[PMID: 10713461](2000)
・12員環＋14員環マクロライドを産生するS. venezuelae ATCC 15439
・主に12員環マクロライドを産生するS. venezuelae ATCC 15068
・14員環マクロライドのみを産生するS. narbonensis ATCC 19790
の3株のPKSの配列解析から、その産生調節の違いを検討している。
S. venezuelae ATCC 15439のpik clusterの5つの遺伝子座のうちPKSのpikAをシークエンスし、遺伝子構成を示している。
pik TEII 単独ではpolyketide鎖長を決定する因子になりえない。
---
[PMID: 11223265](2001)
pikAV in-frame deletionするとaglycone formだがpolyketide産物量は正常のまま。このdeletion株にdesVIII-VI and desRをplasmidで発現させると、機能的なPikAVはなくてもglycosylated products産生を完全に回復。
したがって、PikAV TE II はpolyketide生合成において重要な役割をしておらず、削除されたpikAV DNAの領域はdes genesの発現のために必須の転写unitを含む。
---
[PMID: 12368286](2002)
精製されたrecombinant TEIIでvitro enzyme assays.
TEII(PikAV)はacyl-ACP thioestersを加水分解できる。
長い半減期をもつ異常なacyl-ACP種を優先的に取り除く。
|
- ACC
- Q6W5Q5
- NITE
- FR008_00110
- PmId
[18836004] Selective removal of aberrant extender units by a type II thioesterase for efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. strain FR-008. (Appl Environ Microbiol. , 2008) - comment
- BLAST id54%
Streptomyces sp. FR-008_fscTE
FscTE
[DoBISCUIT]type II thioesterase
fscTEはputative type II thioesterase (TEII)をコードする。
fscTE deletionでFR-008/candicidin産生は約90%減。
FscTEは成熟伸長したpolyketideの放出を代償することができなかった。
FscTE and TylOのHydrolytic activitiesは、
propionyl-S-N-acetylcysteamine > methylmalonyl-S-N-acetylcysteamine
acetyl-S-N-acetylcysteamine > malonyl-S-N-acetylcysteamine
したがって、TEII はacyl carrier proteins(ACP)に結合するnon-elongatable residuesを選択的に除去することにより、効果的なpolyketide生合成を維持することが結論付けられる。
|
Lydi_00220
Location
![[23-245] 2.2e-55 PF00975](../../img/H.gif "[23-245] 2.2e-55 PF00975"){kind=small}
