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微生物 : Thermotoga maritima

微生物株情報

NBRC番号 100826
学名 Thermotoga maritima
別名（シノニム） 該当データなし
由来 JCM 10099 <- DSM 3109 <- K.O. Stetter, MSB8
他保存機関番号 ATCC 43589=DSM 3109=JCM 10099
他株番号
参考文献
7981093
Phylogenetic position of the genus Hydrogenobacter. (Int J Syst Bacteriol. 1994)
10360571
Evidence for lateral gene transfer between Archaea and bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima. (Nature. 1999)
19307556
On the chimeric nature, thermophilic origin, and phylogenetic placement of the Thermotogales. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2009)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseTM_1071
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTM_0893
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTM_0421 TM_1276
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTM_0595
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTM_0595
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseTM_0392
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSTM_0473
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTTM_0472

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA111
ローカスタグTM
INSDC entriesAE000512
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,860,725
遺伝子数 1,846
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Evidence for lateral gene transfer between Archaea and bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima. (Nature. 1999) PMID: 10360571

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
562.8 KB 536.5 KB 369.2 KB 136.5 KB