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微生物 : Caldisericum exile

微生物株情報

NBRC番号 104410
学名 Caldisericum exile
別名（シノニム） 該当データなし
由来 NBRC (K. Mori, AZM16c01)
他保存機関番号 DSM 21853
他株番号 AZM16c01
参考文献
18776034
First cultivation and ecological investigation of a bacterium affiliated with the candidate phylum OP5 from hot springs. (Appl Environ Microbiol. 2008)
19628600
Caldisericum exile gen. nov., sp. nov., an anaerobic, thermophilic, filamentous bacterium of a novel bacterial phylum, Caldiserica phyl. nov., originally called the candidate phylum OP5, and description of Caldisericaceae fam. nov., Caldisericales ord. nov. and Caldisericia classis nov. (Int J Syst Evol Microbiol. 2009)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCSE_10580
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCSE_08730
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinCSE_00960
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCSE_04480 CSE_05990 CSE_13690
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCSE_05990 CSE_04480 CSE_13690
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseCSE_06690
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSCSE_10820
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTCSE_10830

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA41615
ローカスタグCSE
INSDC entriesAP012051
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,558,103
遺伝子数 1,582
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度8.5x
シーケンス方法
  • Sanger ABI3730
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
468.6 KB 460.3 KB 301.1 KB 120.2 KB