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微生物 : Thermotoga petrophila

微生物株情報

NBRC番号 104847
学名 Thermotoga petrophila
別名（シノニム） 該当データなし
由来 Taisei Corp. (Y. Takahata & T. Hoaki, RKU-1)
他保存機関番号 ATCC BAA-488=DSM 13995=JCM 10881
他株番号
参考文献
10618205
Distribution and physiological characteristics of hyperthermophiles in the Kubiki oil reservoir in Niigata, Japan. (Appl Environ Microbiol. 2000)
11594624
Thermotoga petrophila sp. nov. and Thermotoga naphthophila sp. nov., two hyperthermophilic bacteria from the Kubiki oil reservoir in Niigata, Japan. (Int J Syst Evol Microbiol. 2001)
12947037
Active self-splicing group I introns in 23S rRNA genes of hyperthermophilic bacteria, derived from introns in eukaryotic organelles. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2003)
15747232
Polyamine analysis for chemotaxonomy of thermophilic eubacteria: Polyamine distribution profiles within the orders Aquificales, Thermotogales, Thermodesulfobacteriales, Thermales, Thermoanaerobacteriales, Clostridiales and Bacillales. (J Gen Appl Microbiol. 2004)
19307556
On the chimeric nature, thermophilic origin, and phylogenetic placement of the Thermotogales. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2009)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseTpet_1673
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTpet_0034
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTpet_1495 Tpet_0500
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseTpet_0528
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSTpet_0447
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTTpet_0448

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA17089
ローカスタグTPET
INSDC entriesCP000702
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,823,511
遺伝子数 1,785
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • On the chimeric nature, thermophilic origin, and phylogenetic placement of the Thermotogales. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2009) PMID: 19307556

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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551.6 KB 530.8 KB 372.0 KB 142.0 KB