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微生物 : Fluviicola taffensis

微生物株情報

NBRC番号 106335
学名 Fluviicola taffensis
別名（シノニム） 該当データなし
由来 NCIMB 13979 <- Cardiff Univ. (L. O'Sullivan, RW262)
他保存機関番号 DSM 16823=NCIMB 13979
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseFluta_1149
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseFluta_3162
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AFluta_3361
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBFluta_3070
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseFluta_1935
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseFluta_0925
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AFluta_3361
Bioplastic degradation(NFUNC_0015)
必須B
PHAZ2
(NRULE_0080)
Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymeraseFluta_3623
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFluta_0433 Fluta_2885 Fluta_2185
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFluta_0433 Fluta_2185 Fluta_2885
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class AFluta_3361

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA47603
ローカスタグFLUTA
INSDC entriesCP002542
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 4,633,577
遺伝子数 4,033
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454-Titanium
  • Illumina
参考文献
  • Complete genome sequence of the gliding freshwater bacterium Fluviicola taffensis type strain (RW262). (Stand Genomic Sci. 2011) PMID: 22180807

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
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1.4 MB 1.2 MB 891.0 KB 302.4 KB