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微生物 : Haloarcula vallismortis

微生物株情報

NBRC番号 14741
学名 Haloarcula vallismortis
別名（シノニム） Halobacterium vallismortis
由来 IFO 14741 <- ATCC 29715 <- Inst. Jaime Ferran de Microbiologia (C. Gonzalez, J.F. 54)
他保存機関番号 ATCC 29715=BCRC 14343=CCM 3404=DSM 3756=IAM 13180=JCM 8877=NCMB 2082=VKM B-1791
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseC437_01055
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseC437_04541 C437_01997
Bioplastic synthesis(NFUNC_0001)
必須B
PHAE
(NRULE_0012)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaE subunitC437_06290
PHAC2
(NRULE_0373)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaC subunitC437_06295
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinC437_18617 C437_02992 C437_00260 C437_13095 C437_18292
B
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorC437_18617
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRC437_03246 C437_02717
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterC437_07662
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSC437_11493
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTC437_03067

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA174884
ローカスタグHaVal
INSDC entriesAOLQ01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数69
サイズ(bp) 3,923,205
遺伝子数 3,961
フィニッシングゴール
アセンブル方法A5 v. Nov-2011
冗長度200x
シーケンス方法
  • Roche 454
参考文献
  • Sequencing of seven haloarchaeal genomes reveals patterns of genomic flux. (PLoS One. 2012) PMID: 22848480

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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