English site

微生物 : Acetobacter aceti

微生物株情報

NBRC番号 14818
学名 Acetobacter aceti
別名（シノニム） Acetobacter (Acetobacter) aceti
Acetobacter aceti subsp. aceti
由来 IFO 14818 <- Shizuoka Univ. (Y. Yamada) <- NCIB 8621 <- W. Verhoeven <- J. Frateur
他保存機関番号 ATCC 15973=CCUG 18122=CIP 103111=DSM 3508=ICMP 8807=JCM 7641=LMG 1261=LMG 1504=NCCB 23001=NCIB 8621=NCIMB 8621
他株番号
参考文献
10830489
Genetic characteristics of cellulose-forming acetic acid bacteria identified phenotypically as Gluconacetobacter xylinus. (Biosci Biotechnol Biochem. 2000)
12483588
Systematic study of the genus Acetobacter with descriptions of Acetobacter indonesiensis sp. nov., Acetobacter tropicalis sp. nov., Acetobacter orleanensis (Henneberg 1906) comb. nov., Acetobacter lovaniensis (Frateur 1950) comb. nov., and Acetobacter estunensis (Carr 1958) comb. nov. (J Gen Appl Microbiol. 2000)

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseAaceN1_010100014651
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseAaceN1_010100012208
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseAaceN1_010100010036
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須A
BETA
(NRULE_0175)
Choline dehydrogenaseAaceN1_010100013172
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseAaceN1_010100005161
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseAaceN1_010100005156
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDAaceN1_010100008202
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseAaceN1_010100007942
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinAaceN1_010100002190
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAaceN1_010100005061
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRAaceN1_010100011743
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAaceN1_010100005061
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseAaceN1_010100006258
任意 
PQQA
(NRULE_0090)
Coenzyme PQQ synthesis protein AAaceN1_010100006268
 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BAaceN1_010100006263
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein EAaceN1_010100006248

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA70715
ローカスタグEMQ
INSDC entriesNZ_BABW01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数1488
サイズ(bp) 3,577,688
遺伝子数 4,025
フィニッシングゴール
アセンブル方法Edena v. 2.1.1
冗長度61x
シーケンス方法
  • Illumina
  • Solexa
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.1 MB 1021.8 KB 671.9 KB 337.7 KB