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微生物 : Lactobacillus fermentum

微生物株情報

NBRC番号 15885
学名 Lactobacillus fermentum
別名（シノニム） Lactobacillus cellobiosus
由来 IFO 15885 <- JCM 1173 <- ATCC 14931 <- P.A. Hansen, B1 28 <- Roy. Techn. Coll., Copenhagen <- S. Orla-Jensen, 28
他保存機関番号 ATCC 14931=DSM 20052=JCM 1173=NRIC 1752
他株番号 28=B1 28=NCDO 1750
参考文献
14354139
A serological classification of lactobacilli. (J Gen Microbiol. 1955)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0511_0447
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0511_1586
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF0511_0954
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeHMPREF0511_1547

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA31485
ローカスタグ
INSDC entriesACGI01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数145
サイズ(bp) 1,796,949
遺伝子数 1,866
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度11x
シーケンス方法
  • 454
  • ABI
  • Solexa/Illumina
参考文献

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
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546.3 KB 514.9 KB 340.6 KB 153.4 KB