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微生物 : Fusobacterium nucleatum subsp. Nucleatum

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Fusobacterium nucleatum subsp. Nucleatum
別名（シノニム） 該当データなし
由来
他保存機関番号 ATCC 25586
他株番号
参考文献
11889109
Genome sequence and analysis of the oral bacterium Fusobacterium nucleatum strain ATCC 25586. (J Bacteriol. 2002)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseFN0406
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseFN1702
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFN2058 FN0132 FN0375
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFN2058 FN0375 FN0132
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseFN1508
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2FN1508
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDFN1506
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseFN1505
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseFN1507
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFFN0707
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterFN0107

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA295
ローカスタグFN
INSDC entriesAE009951
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,174,500
遺伝子数 2,067
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Genome sequence and analysis of the oral bacterium Fusobacterium nucleatum strain ATCC 25586. (J Bacteriol. 2002) PMID: 11889109

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
628.4 KB 1.2 MB 405.9 KB 145.7 KB