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微生物 : Pedobacter saltans

微生物株情報

NBRC番号 100064
学名 Pedobacter saltans
別名（シノニム） 該当データなし
由来 LMG 9526 <- Univ. Pretoria (P. Steyn)
他保存機関番号 ATCC 51119=CCUG 39354=CIP 105500=DSM 12145=IAM 15374=JCM 21818=LMG 10337=LMG 9526=NCIMB 13634
他株番号
参考文献
9542086
Classification of heparinolytic bacteria into a new genus, Pedobacter, comprising four species: Pedobacter heparinus comb. nov., Pedobacter piscium comb. nov., Pedobacter africanus sp. nov. and Pedobacter saltans sp. nov. proposal of the family Sphingobacteriaceae fam. nov. (Int J Syst Bacteriol. 1998)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemasePedsa_0984
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphatasePedsa_0245

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA49337
ローカスタグPEDSA
INSDC entriesCP002545.1
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 4,635,236
遺伝子数 3,792
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454-FLX
参考文献
  • Complete genome sequence of the gliding, heparinolytic Pedobacter saltans type strain (113). (Stand Genomic Sci. 2011) PMID: 22180808

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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1.4 MB 1.2 MB 882.5 KB 291.4 KB