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微生物 : Pyrococcus horikoshii

微生物株情報

NBRC番号 100139
学名 Pyrococcus horikoshii
別名(シノニム) 該当データなし
由来 JCM 9974 <- C. Kato <- F. Robb, OT-3
他保存機関番号 DSM 12428=JCM 9974=ATCC 700860
他株番号 OT-3
参考文献
9672687
Pyrococcus horikoshii sp. nov., a hyperthermophilic archaeon isolated from a hydrothermal vent at the Okinawa Trough. (Extremophiles. 1998)
9679194
Complete sequence and gene organization of the genome of a hyper-thermophilic archaebacterium, Pyrococcus horikoshii OT3. (DNA Res. 1998)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinPH0157 PH0194.1
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinPH0151 PH1349.1
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRPH0601
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinPH1349.1 PH0151
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthasePH1035.1
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSPH1355
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTPH1354

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA207
ローカスタグPH
INSDC entriesBA000001
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,738,506
遺伝子数 1,883
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete sequence and gene organization of the genome of a hyper-thermophilic archaebacterium, Pyrococcus horikoshii OT3. (DNA Res. 1998) PMID: 9679194

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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527.5 KB 516.7 KB 336.3 KB 142.3 KB