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微生物 : Methanocaldococcus jannaschii

微生物株情報

NBRC番号 100440
学名 Methanocaldococcus jannaschii
別名（シノニム） Methanococcus jannaschii
由来 JCM 10045 <- DSM 2661 <- J.A. Leigh & W.J. Jones, JAL-1
他保存機関番号 ATCC 43067=CIP 104961=DSM 2661=JCM 10045=OCM 168
他株番号 JAL-1
参考文献
8688087
Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii. (Science. 1996)
16348172
Partial Purification and Characterization of Two Hydrogenases from the Extreme Thermophile Methanococcus jannaschii. (Appl Environ Microbiol. 1990)
17131373
Incorporation of unnatural amino acids into cytochrome c3 and specific viologen binding to the unnatural amino acid. (Chembiochem. 2006)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseMJ_1298
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseMJ_1300
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDMJ_1299
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseMJ_1296
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRMJ_0549
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSMJ_0677
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTMJ_1661

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA102
ローカスタグ
INSDC entriesL77117
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数3
サイズ(bp) 1,739,927
遺伝子数 1,770
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii. (Science. 1996) PMID: 8688087

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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512.5 KB 451.5 KB 322.2 KB 130.2 KB