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微生物 : Phycisphaera mikurensis

微生物株情報

NBRC番号 102666
学名 Phycisphaera mikurensis
別名（シノニム） 該当データなし
由来
他保存機関番号 KCTC 22515
他株番号 FYK2301M01
参考文献
19700920
Phycisphaera mikurensis gen. nov., sp. nov., isolated from a marine alga, and proposal of Phycisphaeraceae fam. nov., Phycisphaerales ord. nov. and Phycisphaerae classis nov. in the phylum Planctomycetes. (J Gen Appl Microbiol. 2009)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemasePSMK_09540
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class APSMK_24770
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphatasePSMK_14590
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class APSMK_24770
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinPSMK_19130
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinPSMK_19130
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class APSMK_24770

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDB46
ローカスタグPSMK
INSDC entriesAP012338
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 3,884,382
遺伝子数 3,284
フィニッシングゴール
アセンブル方法phrap v. 0.020425.c
冗長度8.7X
シーケンス方法
  • Sanger ABI 3730
参考文献
  • Molecular characterization of a new hypovirus infecting a phytopathogenic fungus, Valsa ceratosperma. (Virus Res. 2012) PMID: 22366520

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.1 MB 1.0 MB 694.9 KB 244.8 KB