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微生物 : Thermotoga naphthophila

微生物株情報

NBRC番号 104846
学名 Thermotoga naphthophila
別名（シノニム） 該当データなし
由来 Taisei Corp. (Y. Takahata & T. Hoaki, RKU-10)
他保存機関番号 ATCC BAA-489=DSM 13996=JCM 10882
他株番号
参考文献
11594624
Thermotoga petrophila sp. nov. and Thermotoga naphthophila sp. nov., two hyperthermophilic bacteria from the Kubiki oil reservoir in Niigata, Japan. (Int J Syst Evol Microbiol. 2001)
12947037
Active self-splicing group I introns in 23S rRNA genes of hyperthermophilic bacteria, derived from introns in eukaryotic organelles. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2003)
15747232
Polyamine analysis for chemotaxonomy of thermophilic eubacteria: Polyamine distribution profiles within the orders Aquificales, Thermotogales, Thermodesulfobacteriales, Thermales, Thermoanaerobacteriales, Clostridiales and Bacillales. (J Gen Appl Microbiol. 2004)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomeraseTnap_1696
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTnap_0034
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinTnap_1518 Tnap_0212
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseTnap_0184
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSTnap_0255
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTTnap_0254

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA33663
ローカスタグTNAP
INSDC entriesCP001839
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,809,823
遺伝子数 1,768
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
547.6 KB 519.2 KB 363.7 KB 141.5 KB