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微生物 : Leuconostoc pseudomesenteroides

微生物株情報

NBRC番号 107767
学名 Leuconostoc pseudomesenteroides
別名（シノニム） 該当データなし
由来 NCIMB 8699 <- Univ. Louvain (H.G. Hers)
他保存機関番号 ATCC 12291, ATCC 49371, BCRC 11651, BCRC 16065, CCM 2083, CCUG 30063, CECT 4027, CIP 103316, DSM 20193, IMET 10696, JCM 9696, KCTC 3652, LMG 11482, NCCB 83005, NCDO 768, NCFB 768, NCIMB 8699, NRIC 1777, VTT E-98970
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLpseK3_010100002337 LpseK3_010100002889 LpseK3_010100016925 LpseK3_010100020851
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseLpseK3_010100000758
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeLpseK3_010100021582
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinLpseK3_010100019126
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLpseK3_010100006607 LpseK3_010100014464
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLpseK3_010100006607 LpseK3_010100014464

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA68681
ローカスタグLpseK3
INSDC entriesNZ_AEOQ01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数1160
サイズ(bp) 3,244,985
遺伝子数 3,825
フィニッシングゴール
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度20x
シーケンス方法
  • 454 GS Titanium
参考文献

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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