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微生物 : Propionibacterium acidipropionici

微生物株情報

NBRC番号 12425
学名 Propionibacterium acidipropionici
別名(シノニム) Propionibacterium acidi-propionici (sic)
由来 IFO 12425 <- ATCC 4875 <- C.B. van Niel, 4
他保存機関番号 ATCC 4875
他株番号 4
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemasePACID_31080
D-allose biosynthesis(NFUNC_0077)
必須A
LRHI
(NRULE_0242)
L-rhamnose isomerasePACID_06580
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphatasePACID_32290 PACID_30070
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DPACID_33580
Betaine biosynthesis (from choline)(NFUNC_0049)
必須A
BETA
(NRULE_0175)
Choline dehydrogenasePACID_07730
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylasePACID_18390
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferasePACID_22350
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinPACID_02580 PACID_02560
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinPACID_02570 PACID_28260
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinPACID_28260 PACID_02570
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DPACID_33580
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthasePACID_05880
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolasePACID_05850
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymePACID_19100
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthasePACID_18560
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphatasePACID_18570
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSPACID_18610
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTPACID_18620

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA158149
ローカスタグ
INSDC entriesCP003493
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,656,170
遺伝子数 3,336
フィニッシングゴール
アセンブル方法Velvet v. 0.11
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献
  • The genome sequence of Propionibacterium acidipropionici provides insights into its biotechnological and industrial potential. (BMC Genomics. 2012) PMID: 23083487

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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