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微生物 : Flavobacterium johnsoniae

微生物株情報

NBRC番号 14942
学名 Flavobacterium johnsoniae
別名(シノニム) Cytophaga johnsonae
Flavobacterium johnsonae (sic)
Flexibacter aurantiacus
由来 IFO 14942 <- GIFU 2500 <- ATCC 17061 <- C.B. van Niel
他保存機関番号 ATCC 17061=CCUG 35202=CFBP 3036=CIP 100931=DSM 2064=GIFU 2500=JCM 8514=LMG 1341
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseFjoh_1318
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseFjoh_3322
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBFjoh_2991 Fjoh_3083 Fjoh_4422
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseFjoh_4784
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseFjoh_0569
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseFjoh_0863
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFjoh_2768 Fjoh_0606
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFjoh_2768 Fjoh_0606
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseFjoh_1367

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA16082
ローカスタグFjoh
INSDC entriesCP000685
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 6,096,872
遺伝子数 5,017
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Novel features of the polysaccharide-digesting gliding bacterium Flavobacterium johnsoniae as revealed by genome sequence analysis. (Appl Environ Microbiol. 2009) PMID: 19717629

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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1.8 MB 1.6 MB 1.1 MB 390.2 KB