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微生物 : Cellulophaga lytica

微生物株情報

NBRC番号 14961
学名 Cellulophaga lytica
別名（シノニム） Cytophaga lytica
由来 IFO 14961 <- ATCC 23178 <- R.A. Lewin, LIM-21
他保存機関番号 ATCC 23178=CIP 103822=DSM 7489=JCM 8516=LMG 1344=VKM B-1433
他株番号 LIM-21
参考文献
5360476
A classification of flexibacteria. (J Gen Microbiol. 1969)
10425785
Description of Cellulophaga baltica gen. nov., sp. nov. and Cellulophaga fucicola gen. nov., sp. nov. and reclassification of [Cytophaga] lytica to Cellulophaga lytica gen. nov., comb. nov. (Int J Syst Bacteriol. 1999)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCelly_1183
Alginate degradation(NFUNC_0062)
必須B
ALY
(NRULE_0227)
Alginate lyaseCelly_0299 Celly_3050
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBCelly_0109
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseCelly_2712
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCelly_0901
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseCelly_2361
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCelly_0863
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinCelly_0863
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseCelly_1016
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseCelly_2540
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseCelly_2540

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA50743
ローカスタグCELLY
INSDC entriesCP002534
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 3,765,936
遺伝子数 3,284
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • Illumina
  • 454-Titanium
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.1 MB 1.0 MB 731.9 KB 250.3 KB