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微生物 : Solitalea canadensis

微生物株情報

NBRC番号 15130
学名 Solitalea canadensis
別名(シノニム) Flexibacter canadensis
由来 IFO 15130 <- ATCC 29591 <- P. Christensen <- F.D. Cook
他保存機関番号 ATCC 29591=CIP 104802=DSM 3403=LMG 8368
他株番号 USAM 9D
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseSolca_1259
Ampicillin resistance(NFUNC_0046)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ASolca_0574
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBSolca_3636
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseSolca_4385
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseSolca_2954
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ASolca_0574
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseSolca_4168
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSolca_2138
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinSolca_2138
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須A
BLAA
(NRULE_0122)
Beta-lactamase class ASolca_0574
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseSolca_2056
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseSolca_2056

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA60421
ローカスタグ
INSDC entriesCP003349
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 5,202,069
遺伝子数 4,310
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
1.5 MB 1.4 MB 973.2 KB 342.9 KB