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微生物 : Weeksella virosa

微生物株情報

NBRC番号 16016
学名 Weeksella virosa
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 16016 <- IAM 14551 <- NCTC 11634 <- CDC 9751
他保存機関番号 ATCC 43766=CCUG 30538=CIP 103040=IAM 14551=LMG 12995=NCTC 11634
他株番号
参考文献
21475590
Complete genome sequence of Weeksella virosa type strain (9751). (Stand Genomic Sci. 2011)

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseWeevi_1001
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseWeevi_0487
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseWeevi_1206
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterWeevi_1429

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA50581
ローカスタグSIGS
INSDC entriesCP002455
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,272,954
遺伝子数 2,049
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献
  • Complete genome sequence of Weeksella virosa type strain (9751). (Stand Genomic Sci. 2011) PMID: 21475590

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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FASTA
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TSV
uncompressed
687.2 KB 617.7 KB 437.6 KB 159.1 KB