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微生物 : Enterococcus hirae

微生物株情報

NBRC番号 3181
学名 Enterococcus hirae
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 3181 <- ATCC 8043 <- E.E. Snell
他保存機関番号 ATCC 8043=ATCC 9790=BCRC 11054=BCRC 12496=BCRC 80016=CCM 2423=CCUG 1332=CCUG 18659=CCUG 19917=CECT 179=CECT 294=CECT 302=CFBP 4250=CGMCC 1.2140=CIP 53.48=CIP 82.112=DSM 20160=HAMBI 1709=HAMBI 644=IAM 1262=JCM 8729=KCTC 2022=KCTC 3606=LMG 6399=NCCB 46070=NCCB 58005=NCDO 1258=NCIMB 6459=NCIMB 8123=NCIMB 8191=NCTC 12367=VKM B-2107=VTT E-97046
他株番号
参考文献
22933757
Genome sequence of Enterococcus hirae (Streptococcus faecalis) ATCC 9790, a model organism for the study of ion transport, bioenergetics, and copper homeostasis. (J Bacteriol. 2012)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseEHR_03895
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseEHR_02160
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseEHR_12700
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseEHR_02905
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeEHR_08090
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinEHR_07370
Tyramine biosynthesis(NFUNC_0079)
必須A
TYRDC
(NRULE_0248)
Pyridoxal-dependent tyrosine decarboxylaseEHR_06195 EHR_03460
任意 
TYRP
(NRULE_0249)
Tyrosine permeaseEHR_06200 EHR_03455

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA49385
ローカスタグHER
INSDC entriesCP003504
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 2,856,440
遺伝子数 2,755
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度30x
シーケンス方法
参考文献
  • Genome sequence of Enterococcus hirae (Streptococcus faecalis) ATCC 9790, a model organism for the study of ion transport, bioenergetics, and copper homeostasis. (J Bacteriol. 2012) PMID: 22933757

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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864.5 KB 702.4 KB 493.1 KB 203.3 KB