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微生物 : Lactobacillus fermentum

微生物株情報

NBRC番号 3956
学名 Lactobacillus fermentum
別名(シノニム) Lactobacillus cellobiosus
由来 IFO 3956 <- IFO (R. Kodama, 2134)
他保存機関番号 LMG 18251
他株番号 2134
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLAF_0211
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須E
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBLAF_1156
ARSC2
(NRULE_0018)
Arsenate reductaseLAF_1155
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseLAF_1534
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseLAF_0564

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDA18979
ローカスタグ
INSDC entriesAP008937
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,098,685
遺伝子数 1,843
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Comparative genome analysis of Lactobacillus reuteri and Lactobacillus fermentum reveal a genomic island for reuterin and cobalamin production. (DNA Res. 2008) PMID: 18487258

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
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TSV
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635.2 KB 514.8 KB 352.1 KB 131.6 KB