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微生物 : Candidatus Nitrosopumilus sp.

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Candidatus Nitrosopumilus sp.
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 AR2
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Bioplastic synthesis(NFUNC_0001)
必須B
PHAE
(NRULE_0012)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaE subunitNSED_05710
PHAC2
(NRULE_0373)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaC subunitNSED_05715
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseNSED_02000
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseNSED_01995
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseNSED_02005
Hydroxyectoine biosynthesis(NFUNC_0057)
必須A
ECTD
(NRULE_0189)
Ectoine hydroxylaseNSED_02010
任意 
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseNSED_02000
 
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseNSED_01995
 
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseNSED_02005
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseNSED_00835
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinNSED_01485 NSED_05555 NSED_02490 NSED_08485

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA174388
ローカスタグC880
INSDC entriesNC_018656
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,690,905
遺伝子数 1,974
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
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504.9 KB 469.9 KB 313.6 KB 143.3 KB