English site

微生物 : Prochlorococcus marinus subsp. marinus

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Prochlorococcus marinus subsp. marinus
別名（シノニム） 該当データなし
由来
他保存機関番号 CCMP1375
他株番号 SS120
参考文献
12917486
Genome sequence of the cyanobacterium Prochlorococcus marinus SS120, a nearly minimal oxyphototrophic genome. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2003)

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemasePro_1681
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphatasePro_0735
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthasePro_0943
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Pro_0943
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDPro_1339
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthasePro_1803
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthasePro_0438
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFPro_1347

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA419
ローカスタグPRO
INSDC entriesAE017126
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,751,080
遺伝子数 1,882
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Genome sequence of the cyanobacterium Prochlorococcus marinus SS120, a nearly minimal oxyphototrophic genome. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2003) PMID: 12917486

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
529.9 KB 510.7 KB 336.8 KB 147.2 KB