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ハロアルカン分解

概要

ハロアルカンはアルカン (CnH2n+2) の水素がハロゲンに置き換わった化合物で、ハロアルカンデハロゲナーゼによる脱ハロゲン化の後、数ステップを経て glycolate もしくは 2-hydroxyacid に分解される。 MiFuP では、ハロアルカン分解の中でも 1,2-dichroloethane 分解をモデルに Function/Rule を作成した。

機能に関する知見

機能を示すメカニズム

ハロアルカンデハロゲナーゼ (EC 3.8.1.5) は α/β-hydrolase family に属する加水分解酵素で、アルコールとハロゲン化水素を生じる反応を触媒する。 生じたアルコールは alcohol dehydrogenase、および aldehyde dehydrogenase により haloacetate に変換され、haloacetate dehalogenase (EC 3.8.1.3) により glycolate に、 haloalkanoic acid dehalogenase (EC 3.8.1.2) により 2-hydroxyacid に代謝される。
Metabolic pathway of haloalkane.
Metabolic pathway of haloalkane.
  • Haloalkane dehalogenase (EC 3.8.1.5)
    EC 3.8.1.5を対象とする既存ルール。(カッコ内は UniProt での登録数, May 2013 時点).
    HAMAPに2つのsubfamilyが存在。配列の相同性は高いが、基質特異性が異なる。
    MF_01230 (登録数112) => Type 1 subfamily
    MF_01231 (登録数94) => Type 2 subfamily
    K01563 (登録数258)
    Haloalkane dehalogenase 既存ルールのカバーしている範囲.
    Haloalkane dehalogenase 既存ルールのカバーしている範囲.

関連外部リンク

MiFuPへのリンク

（更新日 2014/03/13）