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FR008_00010 : CDS information

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Organism
StrainFR-008
Entry nameFR-008
Contig
Start / Stop / Direction1,950 / 574 / - [in whole cluster]
1,950 / 574 / - [in contig]
Locationcomplement(574..1950) [in whole cluster]
complement(574..1950) [in contig]
TypeCDS
Length1,377 bp (458 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productputative monooxygenase
Product (GenBank)FscO
Gene
Gene (GenBank)fscO
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • putative FAD-dependent monooxygenase
Reference
ACC
PmId
[14652074] Organizational and mutational analysis of a complete FR-008/candicidin gene cluster encoding a structurally related polyene complex. (Chem Biol. , 2003)
comment
complete FR-008 gene clusterの報告。
fscO: FAD-dependent monooxygenase
@putative tailoring enzyme

fscOはFAD-dependent monooxygenaseに似ている。
aglycone modificationに関与すると考えられているが、詳細はさらなる実験をしてみないとわからない。
Related Reference
ACC
Q93NG3
PmId
[11514508] Gene cluster on pAO1 of Arthrobacter nicotinovorans involved in degradation of the plant alkaloid nicotine: cloning, purification, and characterization of 2,6-dihydroxypyridine 3-hydroxylase. (J Bacteriol. , 2001)
comment
35th(Q93NG3) 30%, 8e-25
Arthrobacter nicotinovorans_dhph
2,6-dihydroxypyridine hydroxylase

Arthrobacter nictinovoransのplasmid pAO1より植物アルカロイドであるニコチンの分解に関与する遺伝子群を同定している。6-hydroxypseudooxynicotine (ketone) dehydrogenase (KDH) 遺伝子群をクローニングしてシークエンス。molybdopterin cofactor (MoCo)-, flavin adenine dinucleotide (FAD)-, and [Fe-S] cluster-をそれぞれ含む蛋白質をコードする3つの遺伝子からなることを見出しており、ニコチン分解の3rd stepに関与すると述べている。さらに、5th stepに関与する2,6-dihydroxypyridine 3-hydroxylase遺伝子をクローニングして大腸菌で発現、精製、キャラクタリゼーションしている。その酵素活性はNADH依存的であること、2,6-dihydroxypyridineに特異的であること、2,3-Dihydroxypyridine, 2,6-dimethoxypyridineによって不可逆的に阻害されることを明らかにしている。

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selected fasta
>putative monooxygenase [FscO]
MPSTCPAPTSIGFRGCPHRRKGRTSRGRRIAVPTRPCGKVRKGHQHAKKWRVSMRGGSVA
VVGGSIAGCAAALAASRGGAERITVFERADARLRDRGVGIGVHDARYAELRDAGYMADEM
PWAPLNRRVWSVRDGDAEHGRAIGTQPFPFRAYNWGSLWSELRRRVPETATYRAGAKVEA
VEQDADGVTVRLADGEPERFDLVIGADGYRSVVREAMYPGTGAAYAGYIGWRGTSPDVSG
LPSDGLDAHNITFPGGHCMAYRIPDGSGGHRLNWVLYTAPPRIDGLHPDLRTPTSLPPGR
LNAELTEHLRALVAEHFPPFWAAKLLSTPAETTFIQPIYDLDVPHYATDRMVLIGDAASV
ARPHLGAGSVKALQDATALEAAWVAGESWKEILEGYHAARGPVGTAMVGLARRMGSAQVE
ETPDWSAMGQAEFDAWWQEQNNGSDRRSGFGGHSLKSR
selected fasta
>putative monooxygenase [FscO]
ATGCCCTCGACATGCCCGGCACCCACCTCGATAGGGTTTCGCGGGTGTCCTCACCGCAGG
AAAGGGCGGACAAGTCGGGGACGGCGGATCGCCGTTCCGACGCGCCCCTGCGGGAAAGTC
CGGAAAGGGCACCAGCACGCGAAGAAGTGGAGAGTCAGTATGCGTGGAGGCAGTGTCGCC
GTCGTCGGCGGCAGTATCGCGGGATGCGCCGCCGCATTGGCGGCGTCGCGCGGCGGGGCG
GAGAGGATCACCGTCTTCGAACGCGCCGACGCGCGACTCCGCGACAGGGGAGTGGGCATC
GGTGTCCACGACGCCCGGTACGCCGAACTGCGCGACGCCGGTTACATGGCGGACGAGATG
CCGTGGGCGCCGCTGAACCGCAGGGTGTGGAGCGTGCGCGACGGCGACGCCGAGCACGGC
AGAGCCATCGGCACCCAGCCGTTCCCCTTCCGGGCCTACAACTGGGGTTCGCTGTGGAGC
GAGTTGCGCCGCCGGGTGCCCGAGACCGCCACCTATCGGGCAGGCGCCAAGGTGGAAGCG
GTGGAGCAGGACGCCGACGGGGTCACGGTACGTCTCGCCGACGGCGAGCCGGAACGCTTC
GACCTGGTCATAGGCGCCGACGGCTACCGCTCCGTCGTCCGTGAGGCCATGTACCCGGGC
ACCGGCGCCGCGTACGCCGGCTACATCGGCTGGCGCGGGACCTCCCCGGACGTCTCCGGT
CTTCCCTCGGACGGGCTCGACGCGCACAACATCACCTTCCCCGGCGGCCACTGCATGGCC
TACCGCATCCCGGACGGCTCCGGCGGCCACCGCCTCAACTGGGTGCTCTACACGGCACCC
CCGCGGATCGACGGCCTCCACCCCGACCTGCGGACCCCCACCTCCCTGCCGCCGGGCCGG
CTCAACGCGGAACTGACGGAGCACCTGCGCGCCCTGGTGGCAGAGCACTTCCCGCCCTTC
TGGGCCGCCAAGCTCCTCTCCACCCCGGCCGAGACCACCTTCATCCAGCCCATCTACGAC
CTGGACGTGCCGCACTACGCCACCGACCGGATGGTGCTCATCGGGGACGCCGCGAGCGTG
GCCCGGCCGCACCTCGGCGCCGGCAGTGTGAAGGCACTCCAGGACGCCACCGCGCTGGAA
GCCGCCTGGGTGGCCGGGGAGAGCTGGAAGGAGATCCTGGAGGGGTACCACGCGGCTCGG
GGTCCCGTCGGCACGGCCATGGTGGGACTCGCCCGCCGGATGGGCAGTGCCCAGGTCGAG
GAGACCCCCGACTGGTCCGCGATGGGCCAGGCCGAGTTCGACGCGTGGTGGCAGGAGCAG
AACAACGGCTCCGACCGGCGCAGCGGCTTCGGCGGACACAGCCTGAAGTCCAGGTAA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09
show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002938 Monooxygenase, FAD-binding (Domain)
 [59-408]  5.10000000000001e-11 PF01494
PF01494   FAD_binding_3
IPR003042 Aromatic-ring hydroxylase-like (Domain)
 [58-80]  1.09999909120787e-13 PR00420 [199-214]  1.09999909120787e-13 PR00420 [348-363]  1.09999909120787e-13 PR00420 [363-379]  1.09999909120787e-13 PR00420
PR00420   RNGMNOXGNASE
SignalP
 [1-1]  Signal-anchor
Eukaryota   
 [1-31]  0.452 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
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