Megalo_00020 : CDS information

Location

Organism	Micromonospora megalomicea subsp. nigra
Strain	NRRL 3275 (=NBRC 14744)
Entry name	Megalomicin
Contig	AF263245
Start / Stop / Direction	928 / 2,061 / + [in whole cluster] 928 / 2,061 / + [in contig]
Location	928..2061 [in whole cluster] 928..2061 [in contig]
Type	CDS
Length	1,134 bp (377 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	glycosyltransferase helper protein
Product (GenBank)	TDP-4-keto-6-deoxyhexose 3,4-isomerase
Gene
Gene (GenBank)	megDVI
EC number
Keyword	megosamine
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q9F840 PmId [10972798] Biosynthesis of the anti-parasitic agent megalomicin: transformation of erythromycin to megalomicin in Saccharopolyspora erythraea. (Mol Microbiol. , 2000) [20418422] TDP-L-megosamine biosynthesis pathway elucidation and megalomicin a production in Escherichia coli. (Appl Environ Microbiol. , 2010) comment [PMID: 10972798](2000) megalomicin (meg) biosynthetic gene clusterの報告。 megDVI: 3,4-isomerase megalomicinは、unique deoxyamino sugarであるmegosamineがC6 hydroxyl基へ付加するとこがerythromycinと異なる。 putative megosamine pathway(megT-BIV)を含む12kbp fragmentがerythromycin産生菌Saccharopolyspora erythraeaに組み込まれると、erythromycin→megalomicinが産生されるようになった。このfragmentにmegDVIは含まれている。ただし、ひとつひとつの機能は確かめられていない。 megDVI(3,4-tautomerization)はmegDVII(2,3-reduction)と共に、megDV(4-ketoreduction)の代替経路を担うことが提唱されている。 --- [PMID: 20418422](2010) MegDVIはmegosamine glycosylTF_MegDIのすぐ上流に位置し、TDP-amino-sugar transferase helper proteinsへの相同性を持つので、MegDIのhelper proteinとして機能しうることが示唆される。遺伝子導入の組み合わせと、その結果産生される産物の解析により、megDVIはmegosamine glycosyltransferase_MegDIの反応のために必須であることを確かめている。 meg clusterに存在するもうひとつのamino-sugar transferase MegCIII/MegCIIとの関連も確認したところ、glycosyltransferaseについては基質特異的（MegCIIIはD-desosamineに、MegDIはL-megosamineに）だが、helper protein MegCII, MegDVIはどちらのglycosyltransferasesにも有効である。この論文で上記cluster Evi論文で提唱されているmegosamine pathwayは、実験的な検証のもと再構築されている。

Sequence

>glycosyltransferase helper protein [TDP-4-keto-6-deoxyhexose 3,4-isomerase]
MAVGDRRRLGRELQMARGLYWGFGANGDLYSMLLSGRDDDPWTWYERLRAAGRGPYASRA
GTWVVGDHRTAAEVLADPGFTHGPPDAARWMQVAHCPAASWAGPFREFYARTEDAASVTV
DADWLQQRCARLVTELGSRFDLVNDFAREVPVLALGTAPALKGVDPDRLRSWTSATRVCL
DAQVSPQQLAVTEQALTALDEIDAVTGGRDAAVLVGVVAELAANTVGNAVLAVTELPELA
ARLADDPETATRVVTEVSRTSPGVHLERRTAASDRRVGGVDVPTGGEVTVVVAAANRDPE
VFTDPDRFDVDRGGDAEILSSRPGSPRTDLDALVATLATAALRAAAPVLPRLSRSGPVIR
RRRSPVARGLSRCPVEL

>glycosyltransferase helper protein [TDP-4-keto-6-deoxyhexose 3,4-isomerase]
ATGGCAGTTGGCGATCGAAGGCGGCTGGGCCGGGAGTTGCAGATGGCCCGGGGTCTCTAC
TGGGGGTTCGGTGCCAACGGCGATCTGTACTCGATGCTCCTGTCCGGACGGGACGACGAC
CCCTGGACCTGGTACGAACGGTTGCGGGCCGCCGGACGGGGACCGTACGCCAGTCGGGCC
GGAACGTGGGTGGTCGGTGACCACCGGACCGCCGCCGAGGTGCTCGCCGATCCGGGCTTC
ACCCACGGCCCGCCCGACGCTGCCCGGTGGATGCAGGTGGCCCACTGCCCGGCGGCCTCC
TGGGCCGGCCCCTTCCGGGAGTTCTACGCCCGCACCGAGGACGCGGCGTCGGTGACAGTG
GACGCCGACTGGCTCCAGCAGCGGTGCGCCAGGCTGGTGACCGAGCTGGGGTCGCGCTTC
GATCTCGTGAACGACTTCGCCCGGGAGGTCCCGGTGCTGGCGCTCGGTACCGCGCCCGCA
CTCAAGGGCGTGGACCCCGACCGTCTCCGGTCCTGGACCTCGGCGACCCGGGTATGCCTG
GACGCCCAGGTCAGCCCGCAACAGCTCGCGGTGACCGAACAGGCGCTGACCGCCCTCGAC
GAGATCGACGCGGTCACCGGCGGTCGGGACGCCGCGGTGCTGGTGGGGGTGGTGGCGGAG
CTGGCGGCCAACACGGTGGGCAACGCCGTCCTGGCCGTCACCGAGCTTCCCGAACTGGCG
GCACGACTTGCCGACGACCCGGAGACCGCGACCCGTGTGGTGACGGAGGTGTCGCGGACG
AGTCCCGGCGTCCACCTGGAACGCCGCACCGCCGCGTCGGACCGCCGGGTGGGCGGGGTC
GACGTCCCGACCGGTGGCGAGGTGACAGTGGTCGTCGCCGCGGCGAACCGTGATCCCGAG
GTCTTCACCGATCCCGACCGGTTCGACGTGGACCGTGGCGGCGACGCCGAGATCCTGTCG
TCCCGGCCCGGCTCGCCCCGCACCGACCTCGACGCCCTGGTGGCCACCCTGGCCACGGCG
GCGCTGCGGGCCGCCGCGCCGGTGTTGCCCCGGCTGTCCCGTTCCGGGCCGGTGATCAGA
CGACGTCGGTCACCCGTCGCCCGTGGTCTCAGCCGTTGCCCGGTCGAGCTGTAG

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001128 Cytochrome P450 (Family) G3DSA:1.10.630.10 Cyt_P450 PF00067 p450 SSF48264 Cytochrome_P450 IPR002397 Cytochrome P450, B-class (Family) PR00359 BP450
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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