Megalo_00150 : CDS information

Location

Organism	Micromonospora megalomicea subsp. nigra
Strain	NRRL 3275 (=NBRC 14744)
Entry name	Megalomicin
Contig	AF263245
Start / Stop / Direction	43,268 / 44,344 / + [in whole cluster] 43,268 / 44,344 / + [in contig]
Location	43268..44344 [in whole cluster] 43268..44344 [in contig]
Type	CDS
Length	1,077 bp (358 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	glycosyltransferase helper protein
Product (GenBank)	TDP-4-keto-6-deoxyglucose 3,4-isomerase
Gene
Gene (GenBank)	megCII
EC number
Keyword	desosamine
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q9F827 PmId [10972798] Biosynthesis of the anti-parasitic agent megalomicin: transformation of erythromycin to megalomicin in Saccharopolyspora erythraea. (Mol Microbiol. , 2000) [16514147] In vivo characterization of the dTDP-D-desosamine pathway of the megalomicin gene cluster from Micromonospora megalomicea. (Microbiology. , 2006) [20418422] TDP-L-megosamine biosynthesis pathway elucidation and megalomicin a production in Escherichia coli. (Appl Environ Microbiol. , 2010) comment [PMID: 10972798](2000) megalomicin (meg) biosynthetic gene clusterの報告。 megCII: 3,4-isomerase MegCIIはerythromycin clusterのEryCIIに似ているのでputative 3,4-isomerase。 TDP-desosamine形成の最初のステップを触媒する。 --- しかし[PMID: 16514147](2006)によって上記提唱機能が否定され、新たな機能が報告されている。異なる遺伝子セットを含んだオペロンによってE.coliで産生されたdTDP-sugar中間体のLC/MS/MS analysis。この解析により、これまでdesosamine生合成に関連すると提唱されていたMegCIIはこの経路から除外された。 MegCIIは、3-alpha-mycarosylerythronolide BへのD-desosamineの移動を触媒するMegCIIIと一緒に要求されることが実証されている。 --- また[PMID: 20418422](2010)においてmeg clusterに存在するもうひとつのamino-sugar transferase megDI/megDVIとの関連も確認したところ、glycosyltransferaseについては基質特異的（MegCIIIはD-desosamineに、MegDIはL-megosamineに）だが、helper protein MegCII, MegDVIはどちらのglycosyltransferasesにも有効であった。

Sequence

>glycosyltransferase helper protein [TDP-4-keto-6-deoxyglucose 3,4-isomerase]
MNTTDRAVLGRRLQMIRGLYWGYGSNGDPYPMLLCGHDDDPHRWYRGLGGSGVRRSRTET
WVVTDHATAVRVLDDPTFTRATGRTPEWMRAAGAPASTWAQPFRDVHAASWDAELPDPQE
VEDRLTGLLPAPGTRLDLVRDLAWPMASRGVGADDPDVLRAAWDARVGLDAQLTPQPLAV
TEAAIAAVPGDPHRRALFTAVEMTATAFVDAVLAVTATAGAAQRLADDPDVAARLVAEVL
RLHPTAHLERRTAGTETVVGEHTVAAGDEVVVVVAAANRDAGVFADPDRLDPDRADADRA
LSAQRGHPGRLEELVVVLTTAALRSVAKALPGLTAGGPVVRRRRSPVLRATAHCPVEL

>glycosyltransferase helper protein [TDP-4-keto-6-deoxyglucose 3,4-isomerase]
ATGAACACGACCGATCGCGCCGTGCTGGGCCGACGACTCCAGATGATCCGGGGACTGTAC
TGGGGTTACGGCAGCAACGGAGACCCGTACCCGATGCTGTTGTGCGGGCACGACGACGAC
CCGCACCGCTGGTACCGGGGGCTGGGCGGATCCGGGGTCCGGCGCAGCCGTACCGAGACG
TGGGTGGTGACCGACCACGCCACCGCCGTGCGGGTGCTCGACGACCCGACCTTCACCCGG
GCCACCGGCCGGACGCCGGAGTGGATGCGGGCCGCGGGCGCCCCGGCCTCGACCTGGGCG
CAGCCGTTCCGTGACGTGCACGCCGCGTCCTGGGACGCCGAACTGCCCGACCCGCAGGAG
GTGGAGGACCGGCTGACGGGTCTCCTGCCTGCCCCGGGGACCCGCCTGGACCTGGTCCGC
GACCTCGCCTGGCCGATGGCGTCGCGGGGGGTCGGCGCGGACGACCCCGACGTGCTGCGC
GCCGCGTGGGACGCCCGGGTCGGCCTCGACGCCCAGCTCACCCCGCAGCCCCTGGCGGTG
ACCGAGGCGGCGATCGCCGCGGTGCCCGGGGACCCGCACCGGCGGGCGCTGTTCACCGCC
GTCGAGATGACAGCCACCGCGTTCGTCGACGCGGTGCTGGCGGTGACCGCCACGGCGGGG
GCGGCCCAGCGTCTCGCCGACGACCCCGACGTCGCCGCCCGTCTCGTCGCGGAGGTGCTG
CGCCTGCATCCGACGGCGCACCTGGAACGGCGTACCGCCGGCACCGAGACGGTGGTGGGC
GAGCACACGGTCGCGGCGGGCGACGAGGTCGTCGTGGTGGTCGCCGCCGCCAACCGTGAC
GCGGGGGTCTTCGCCGACCCGGACCGCCTCGACCCGGACCGGGCCGACGCCGACCGGGCC
CTGTCCGCCCAGCGCGGTCACCCCGGCCGGTTGGAGGAGCTGGTGGTGGTCCTGACCACC
GCCGCACTGCGCAGCGTCGCCAAGGCGCTGCCCGGTCTCACCGCCGGTGGCCCGGTCGTC
AGGCGACGTCGTTCACCGGTCCTGCGAGCCACCGCCCACTGCCCGGTCGAACTCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001128 Cytochrome P450 (Family) G3DSA:1.10.630.10 Cyt_P450 PF00067 p450 SSF48264 Cytochrome_P450
SignalP	Eukaryota
TMHMM	No significant hit

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