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Megalo_00170 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 3275 (=NBRC 14744)
Entry nameMegalomicin
Contig
Start / Stop / Direction45,620 / 46,591 / + [in whole cluster]
45,620 / 46,591 / + [in contig]
Location45620..46591 [in whole cluster]
45620..46591 [in contig]
TypeCDS
Length972 bp (323 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
ProductdTDP-hexose C-3 ketoreductase component
Product (GenBank)TDP-4-keto-6-deoxyglucose 2,3 dehydratase
GenemegBIIa
Gene (GenBank)megBII
EC number
Keyword
  • mycarose
  • axial-OH
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[10972798] Biosynthesis of the anti-parasitic agent megalomicin: transformation of erythromycin to megalomicin in Saccharopolyspora erythraea. (Mol Microbiol. , 2000)
[17571859] Characterization of the heterodimeric MegBIIa:MegBIIb aldo-keto reductase involved in the biosynthesis of L-mycarose from Micromonospora megalomicea. (Biochemistry. , 2007)
comment
[PMID: 10972798](2000)
megalomicin (meg) biosynthetic gene clusterの報告。
megBII: 2,3-reductase

---
[PMID: 17571859](2007)
megDVII→megBIIb
megBII→megBIIa

vivoでのdTDP-sugar中間体の解析が示したのは、MegBIIaも、そのhomologueであるMegBIIbも、それ自身による完全な活性型酵素ではないということ。
C3-ketoreductase activityはMegBIIa and MegBIIbの両方の存在下のみ観察されたことから活性型複合体形成が示唆された。
MegBIIa and MegBIIb が1:1 heterodimeric complexを形成する相互作用をすることが同時精製とsize exclusion chromatography experimentsで確かめられた。
L-mycarose pathwayの他の生合成遺伝子と共にmegBIIa and megBIIbを含むmycarose operonが構築され、E.coliでの生物変換実験によってテストされ、高レベルのmycarosyl-erythronolide Bが産生された。

MegBIIaは活性残基を欠いている。
MegBIIbはC末が不完全で、EryBIIのC末で置きかえるとself-dimerizationし、活性を持つ。
MegBIIaは、MegBIIbの構造安定性を維持するための足場として働くと示唆される。

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selected fasta
>dTDP-hexose C-3 ketoreductase component [TDP-4-keto-6-deoxyglucose 2,3 dehydratase]
MSTDATHVRLGRCALLTSRLWLGTAALAGQDDADAVRLLDHARSRGVNCLDTADDDSAST
SAQVAEESVGRWLAGDTGRREETVLSVTVGVPPGGQVGGGGLSARQIIASCEGSLRRLGV
DHVDVLHLPRVDRVEPWDEVWQAVDALVAAGKVCYVGSSGFPGWHIVAAQEHAVRRHRLG
LVSHQCRYDLTSRHPELEVLPAAQAYGLGVFARPTRLGGLLGGDGPGAAAARASGQPTAL
RSAVEAYEVFCRDLGEHPAEVALAWVLSRPGVAGAVVGARTPGRLDSALRACGVALGATE
LTALDGIFPGVAAAGAAPEAWLR
selected fasta
>dTDP-hexose C-3 ketoreductase component [TDP-4-keto-6-deoxyglucose 2,3 dehydratase]
ATGAGCACCGACGCCACCCACGTCCGGCTCGGCCGGTGCGCCCTGCTGACCAGCCGGCTC
TGGCTGGGTACGGCAGCCCTCGCCGGCCAGGACGACGCCGACGCAGTACGCCTGCTCGAC
CACGCCCGTTCCCGGGGCGTCAACTGCCTCGACACCGCCGACGACGACTCTGCGTCGACC
AGTGCCCAGGTCGCCGAGGAGTCGGTCGGCCGGTGGTTGGCCGGGGACACCGGTCGGCGG
GAGGAGACCGTCCTGTCGGTGACGGTGGGTGTCCCACCGGGCGGGCAGGTCGGCGGGGGC
GGCCTCTCCGCCCGGCAGATCATCGCCTCCTGTGAGGGCTCCCTGCGGCGTCTCGGTGTC
GACCACGTCGACGTCCTTCACCTGCCCCGGGTGGACCGGGTGGAGCCGTGGGACGAGGTC
TGGCAGGCGGTGGACGCCCTCGTGGCCGCCGGAAAGGTCTGTTACGTCGGGTCGTCGGGC
TTCCCCGGATGGCACATCGTCGCCGCCCAGGAGCACGCCGTCCGCCGTCACCGCCTCGGC
CTGGTGTCCCACCAGTGTCGGTACGACCTGACGTCGCGCCATCCCGAACTGGAGGTCCTG
CCCGCCGCGCAGGCGTACGGGCTCGGGGTCTTCGCCAGGCCGACCCGCCTCGGCGGTCTG
CTCGGCGGCGACGGTCCGGGCGCCGCAGCCGCACGGGCGTCGGGACAGCCGACGGCACTG
CGCTCGGCGGTGGAGGCGTACGAGGTGTTCTGCAGAGACCTCGGCGAGCACCCCGCCGAG
GTCGCACTGGCGTGGGTGCTGTCCCGGCCCGGTGTGGCGGGGGCGGTCGTCGGTGCGCGG
ACGCCCGGACGGCTCGACTCCGCGCTCCGCGCCTGCGGCGTCGCCCTCGGCGCGACGGAA
CTCACCGCCCTGGACGGGATCTTCCCCGGGGTCGCCGCAGCAGGGGCGGCCCCGGAGGCG
TGGCTACGGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR023210 NADP-dependent oxidoreductase domain (Domain)
[5-316] 7.60000011115808e-62 SSF51430
SSF51430   Aldo/ket_red
[7-308] 1.6e-57 G3DSA:3.20.20.100
G3DSA:3.20.20.100   Aldo/ket_red
[20-308] 3.5e-45 PF00248
PF00248   Aldo_ket_red
SignalP
[1-28] 0.944 Signal
Eukaryota   
[1-28] 0.713 Signal
Bacteria, Gram-negative   
[1-28] 0.539 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
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