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Monen_00080 : CDS information

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Organism
StrainATCC 15413
Entry nameMonensin
Contig
Start / Stop / Direction6,010 / 5,693 / - [in whole cluster]
6,010 / 5,693 / - [in contig]
Locationcomplement(5693..6010) [in whole cluster]
complement(5693..6010) [in contig]
TypeCDS
Length318 bp (105 aa)
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Category1.1 PKS
Productpolyketide synthase
Product (GenBank)acyl carrier protein
GeneacpX
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
  • modification base
Note
  • It is proposed that this module is not involved in the extension of polyketide chain, but provides a base for modification.
Note (GenBank)
  • SCN_8
Reference
ACC
PmId
[12940979] Analysis of the biosynthetic gene cluster for the polyether antibiotic monensin in Streptomyces cinnamonensis and evidence for the role of monB and monC genes in oxidative cyclization. (Mol Microbiol. , 2003)
comment
monensin生合成 gene clusterの解析論文。

ORF8: ACP

figではORF8のままだが、本文中ではacpXとされている。
acpXの推定産物は106aaタンパクで、知られているtypeI and type II PKSsのACPs（特にmodular PKSsのACPs）に明らかな配列同一性がある。
上流に隣接するORF9(ksX)と共に、正確な役割はわかっていない。
Related Reference
ACC
Q27W65
NITE
Niger_00100
PmId
[17584617] Insights into polyether biosynthesis from analysis of the nigericin biosynthetic gene cluster in Streptomyces sp. DSM4137. (Chem Biol. , 2007)
comment
2nd, id59%, 2e-20
Streptomyces violaceoniger
NigAXI
[Niger_00100]putative acyl carrier protein

Nigericin生合成clusterの同定論文。

polyetherであるnigericin, nanchangmycin, and monensinのclusterには共通して、分離したORFの形でKSとACPが存在する。

S. cinnamonensis(monensin-overproducing strain A519)のmonACPX不活化変異株が本論文では作成されており、この変異株ではmonensinAとBの生産が他のdemethyl-, dehydroxy-, epi-monensinと比較して1000分の1に低下すること、monACPXの遺伝子をtransで相補するとmonensin生産が回復することが示されている。

polyketide鎖の伸長には関係せず、triepoxide中間体の正しいcyclizationに重要なのではないかと予想している。また、これら3種類の完全長直線polyketide鎖は、KS activity(NigAX, MonKSX, NanA9)によって、modular PKSからtype II ACP(NigACPX, MonACPX, or NanA10)に転移され、ACPに結合した状態でoxidative cyclizationや他のtailoring reactionを受けるとしている。

close this sectionPKS/NRPS Module

13
ACP27..97

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selected fasta
>polyketide synthase [acyl carrier protein]
MTSTDHTSGQDATELEKQLAAATPEEREKLLTDTIRTQAGTLLNTTLSDDSNFLENGLNS
LTALELTKTLMTLTGMEIAMVAIVENPTPAQLAHHLGQELAHTTA
selected fasta
>polyketide synthase [acyl carrier protein]
ATGACCAGCACCGACCACACCTCCGGCCAGGACGCCACCGAGCTGGAGAAGCAGCTCGCC
GCGGCCACCCCCGAGGAGCGCGAGAAGCTCCTCACCGACACCATCCGCACCCAGGCCGGC
ACCCTTCTGAACACCACCCTCAGCGACGACAGCAACTTCCTCGAGAACGGTCTCAACTCC
CTCACCGCCCTTGAGCTCACCAAGACACTGATGACGCTGACCGGGATGGAGATCGCGATG
GTCGCCATCGTCGAGAACCCCACGCCCGCACAGCTCGCCCACCACCTCGGCCAGGAACTG
GCACACACCACCGCGTGA
[13] ACP27..97
[13] ACP79..291

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
[21-101] 4.6e-13 G3DSA:1.10.1200.10
G3DSA:1.10.1200.10   ACP_like
[34-96] 2.6e-09 PF00550
PF00550   PP-binding
[24-100] 4.30000170645867e-12 SSF47336
SSF47336   ACP_like
[27-97] PS50075
PS50075   ACP_DOMAIN
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Monen_00070 Monen_00070   Monen_00090 Monen_00090
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