Monen_00320 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces cinnamonensis
Strain	ATCC 15413
Entry name	Monensin
Contig	AF440781
Start / Stop / Direction	101,433 / 100,507 / - [in whole cluster] 101,433 / 100,507 / - [in contig]
Location	complement(100507..101433) [in whole cluster] complement(100507..101433) [in contig]
Type	CDS
Length	927 bp (308 aa)

Annotation

Category	4.3 transport
Product	putative cation efflux protein
Product (GenBank)	hypothetical transport protein
Gene
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	SCN_32
Reference	ACC Q846V9 PmId [12940979] Analysis of the biosynthetic gene cluster for the polyether antibiotic monensin in Streptomyces cinnamonensis and evidence for the role of monB and monC genes in oxidative cyclization. (Mol Microbiol. , 2003) comment monensin生合成 gene clusterの解析論文。 ORF32: Co-Zn-Cd resistance protein 論文に詳細記載なし。 Fig. 2だとORF31に相当。
Related Reference	ACC O07084 PmId [9099864] A Bacillus subtilis locus encoding several gene products affecting transport of cations. (Gene. , 1997) [12100555] An antiport mechanism for a member of the cation diffusion facilitator family: divalent cations efflux in exchange for K+ and H+. (Mol Microbiol. , 2002) comment 117th(O07084) 35%, 3e-54 Bacillus subtilis_czcD Cadmium, cobalt and zinc/H(+)-K(+) antiporter -- [PMID: 9099864](1997) abstract E.coli TK2420 (Kイオン取込不能)株を相補する、B.subtilisの3.6Kb DNA断片の解析。 insertional mutagenesisやサブクローニングから、E.coli_trkAのホモログを単離。また、DNAシークエンス解析により、3つのORFをさらに含んでいた。・A.eutrophus_czcDホモログ・lysR-typeの制御遺伝子; E.coli_nhaA欠損株のNaイオン抵抗性を相補・orfD; no significant similarity --- [PMID: 12100555](2002) B.subtilis_czcDの機能解析。 Zn(2+)を排出し、K(+)の取り込みを行うantiporter. 他に、Co(2+)およびCd(2+)の排出能を持ち、H(+)の取り込み能を持つとしている。 czcDと同じオペロンに含まれるoxidoreductaseであるczcOは、czcDの活性を少し上昇させる。しかし、czcOは膜タンパクでもなければ、単独でのantiporterとしての活性は無し。
	ACC P13512 PmId [2678100] Expression and nucleotide sequence of a plasmid-determined divalent cation efflux system from Alcaligenes eutrophus. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1989) [9044283] Two-component regulatory system involved in transcriptional control of heavy-metal homoeostasis in Alcaligenes eutrophus. (Mol Microbiol. , 1997) comment 224th(P13512) 42%, 1e-50 Ralstonia metallidurans_czcD Cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD -- [PMID: 2678100](1989) Alcaligenes eutrophus CH34 (Ralstonia metallidurans CH34)株が持つlarge plasmidの1つ、pMOL30に含まれるCo,Zn,Cd排出に関わるタンパクをコードしている遺伝子群の解析。 czcCBAD gene clusterのクローニングとDNAシークエンス解析。また、個々あるいは複数連結遺伝子のmutant recombiant strainを作製し、上記3金属イオンの排出ならびに抵抗性を調査。・czcD欠失-->抵抗性に影響なし。Cd(2+)の排出低下。・czcAD欠失->抵抗性喪失。排出能欠失。 *czcD欠失かつczcAの部分欠失ではあまり抵抗性に影響ないが、Cd(2+)に対してのみやや低下。Cd(2+)とCo(2+)の排出低下。また、czcDについては、E.coli lac promoterを用いたsystemとは異なり、A.eutrophusでのczc活性化に必要。 <--pMOL30でのczcD欠損により、金属イオン抵抗性レベル減少。また、相補可(D.H.N., unpublished data)。 --- [PMID: 9044283](1997) abstract Alcaligenes eutrophus CH34 (Ralstonia metallidurans CH34)株の、czc system制御に関わる遺伝子についての解析。・czcCABとそのupstream regulatory region (URR)---重金属イオンにより制御・czcD---その下流に位置するczcR (response activator)とczcS (sensor histidine kinase)により制御
	ACC P75757 PmId [11443104] ZitB (YbgR), a member of the cation diffusion facilitator family, is an additional zinc transporter in Escherichia coli. (J Bacteriol. , 2001) comment 390th(P75757) 43%, 8e-48 Escherichia coli(K12)_zitB Zinc transporter zitB E.coli_zntA disruptantを用いた、zitB遺伝子の機能解析。 zntAはtranscriptional activatorで、E.coliでの破壊株はZn(2+), Cd(2+), Pb(2+)感受性となる。この破壊株にE.coli_zitBタンパク発現ベクターを導入すると、亜鉛抵抗性が上昇。 -->zitBは、Zn(2+)の排出に関わる。また、zitBと同じくCDF family transporterに関わる遺伝子ホモログyiiPについても解析。・yiiP単独破壊株では、Zn(2+), Cd(2+), Co(2+)抵抗性に関してはWTと変らず。・zntA,yiiP double mutantは、zntA破壊株と比べると亜鉛抵抗性が上昇。 zitBおよびyiiPは、亜鉛により強く誘導。しかし、いずれもカドミウムによる誘導性は弱い。

Sequence

>putative cation efflux protein [hypothetical transport protein]
MGHDHGPSAGAAGGTLSGTYRKRLLWTIGISGSITVIQVVGALLSGSLALLADAAHSLTD
AVGVSLALGAITLAQRAPTPRRTFGFYRVEIFSAVLNALLLVVIFAWVLWSAIGRFSEPV
EVKGGLMFVVALGGLAANLVGLWLLRDAKEKSLNLRGAYLEVLGDALGSVAVIVGGLVIL
LTGWQAADPIASIVIGLLIVPRAYGLLRDSLHVLLEATPQDVDLGEVRRHLLEERGVVAV
HDLHGWTVTSGMPVLTAHVVVTEEALASGYGELLGRLQRCVGGHFDVAHSTIQLEPEGHV
EEDGALHT

>putative cation efflux protein [hypothetical transport protein]
ATGGGGCACGACCACGGTCCGTCCGCCGGGGCGGCGGGCGGCACTCTCAGCGGCACGTAC
CGCAAGCGCCTGCTGTGGACCATCGGCATCAGCGGCTCGATCACCGTCATCCAGGTGGTC
GGCGCGCTCCTGTCCGGCAGCCTCGCGCTGCTCGCCGACGCCGCGCACAGCCTGACCGAC
GCGGTCGGCGTCTCGCTGGCCCTCGGTGCCATCACCCTCGCCCAGCGGGCGCCGACGCCG
CGGCGCACCTTTGGGTTCTACCGCGTGGAGATCTTCTCCGCGGTCCTGAACGCGCTGCTC
CTGGTCGTCATCTTCGCCTGGGTCCTGTGGTCGGCGATCGGCCGGTTCAGCGAGCCGGTG
GAGGTGAAGGGCGGCCTGATGTTCGTGGTCGCGCTGGGCGGGCTCGCCGCCAACCTGGTG
GGCCTGTGGCTGCTGCGGGACGCCAAGGAGAAGAGCCTCAATCTGCGGGGCGCGTACCTG
GAGGTGCTGGGCGACGCGCTCGGCTCGGTCGCGGTGATCGTGGGCGGCCTGGTCATCCTG
CTCACGGGGTGGCAGGCCGCCGACCCGATCGCGTCGATCGTCATCGGCCTGCTGATCGTG
CCGCGCGCGTACGGCCTGCTGCGGGACTCCTTGCACGTCCTGCTGGAGGCGACCCCGCAG
GACGTCGACCTCGGCGAGGTGCGCCGGCACCTGCTGGAGGAGCGGGGCGTGGTCGCCGTG
CACGATCTGCACGGCTGGACGGTCACCTCGGGGATGCCGGTGCTCACCGCGCACGTGGTG
GTCACGGAGGAGGCTCTCGCGAGCGGGTACGGGGAGCTCCTGGGGCGCCTTCAGCGGTGT
GTCGGGGGCCACTTCGACGTGGCCCACTCGACGATCCAGCTGGAGCCGGAGGGGCATGTG
GAGGAGGACGGGGCGCTGCACACGTAG

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR002524 Cation efflux protein (Family) TIGR01297 CDF PF01545 Cation_efflux
SignalP	Eukaryota
TMHMM	Transmembrane 5

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