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Pyolu_00120 : CDS information

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Organism
StrainPf-5
Entry namePyoluteorin
Contig
Start / Stop / Direction23,452 / 24,465 / + [in whole cluster]
23,452 / 24,465 / + [in contig]
Location23452..24465 [in whole cluster]
23452..24465 [in contig]
TypeCDS
Length1,014 bp (337 aa)
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Category4.3 transport
Productputative membrane fusion protein
Product (GenBank)PltI
Gene
Gene (GenBank)pltI
EC number
Keyword
  • type I secretion system
Note
Note (GenBank)
  • putative membrane fusion proteins; similar to HlyD
Reference
ACC
PmId
[16269724] Reciprocal regulation of pyoluteorin production with membrane transporter gene expression in Pseudomonas fluorescens Pf-5. (Appl Environ Microbiol. , 2005)
comment
pyoluteorin生合成clusterの3'側 pltZ-orf1についての論文
pltI: HlyD homolog (membrane fusion protein)

pltI or pltJ mutantでpyoluteorin産生は非常に減るが、細胞内部のpyoluterin蓄積が比例して増えるわけではなかった。
よってpyoluteorinの独占的なexporterではなさそう。
pyoluteorinを含んだ培地において、pltI mutantのpopulationsは、pltI+ strainのpopulationsより低い。
pltI and pltJの転写は外因性pyoluteorinによって拡大する。
Related Reference
ACC
Q4VWD0
PmId
[16581203] Identification and characterization of a putative ABC transporter PltHIJKN required for pyoluteorin production in Pseudomonas sp. M18. (Gene. , 2006)
comment
5th(Q4VWD0) 71%, 1e-128
Pseudomonas sp. M18_pltH
PltH

Pseudomonas sp. M18もPyoluteorinを産生する。
gene nameはP. fluorescens Pf-5と一致していない。

---
配列から、pltHIJKN gene productsが典型的な3つの要素のABC export systemに組み込まれることが示唆される。
そのシステムは、
・inner membrane ABC transporter PltIJK
・membrane fusion protein PltH
・outer membrane efflux protein PltN
からなる。

pltH or pltI 欠陥mutantではPlt非産生。
pltHIJKN gene clusterの過剰発現でPlt産生増加。
pltHIJKN gene clusterの異種性発現で外因性Pltへの抵抗性あり。
外因性Pltは、Plt生合成gene clusterとABC transporter gene cluster pltHIJKN の両方の発現を転写レベルで誘導する。

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selected fasta
>putative membrane fusion protein [PltI]
MKKQLIVGVAVLLVATAGVSWFLLRPEKQNDHLKLHGNVDIRQVSLAFDGSERIAALYAE
EGDLVQPGQVLAELDTRTLRLEINRSKARIGAQEQALLRLKNGTRPQEVEQSKARFDAAQ
AQMQLAQLHMQRLRRIADDTQGKGVSQQRLDQAAARLQVAKAQSQEQRESWTLAKIGPRN
EDIAQATADLQASRADLDLLEHYLARAQLKAPTQARIRTRLLEPGDMASPQRPVFALALT
DPKWVRAYVNERQLGHIRADQMARVYTDSFPDQAIDGKVGYISSVAEFTPKSVETEDLRT
SLVYEIRVLVKDPDDRLRLGMPATVYLDQAPVAGATP
selected fasta
>putative membrane fusion protein [PltI]
ATGAAGAAGCAGTTGATTGTAGGGGTTGCCGTACTGCTGGTGGCCACAGCGGGTGTTTCC
TGGTTTCTCCTTCGCCCCGAGAAGCAGAACGACCACCTCAAGCTCCATGGCAACGTCGAC
ATTCGCCAGGTGTCACTGGCGTTCGACGGCAGTGAGCGAATCGCCGCGCTGTATGCCGAA
GAGGGCGACCTGGTGCAGCCAGGCCAGGTCCTGGCGGAACTCGACACACGCACACTGCGC
CTGGAAATAAATCGCTCCAAGGCCAGGATCGGCGCCCAGGAACAGGCGCTGCTGCGCTTG
AAAAATGGCACACGGCCTCAAGAGGTCGAGCAGTCCAAGGCACGTTTTGATGCCGCCCAG
GCGCAAATGCAGCTGGCTCAACTGCACATGCAGCGCCTGCGCAGGATCGCCGACGACACC
CAGGGCAAGGGCGTCAGCCAGCAACGCCTGGACCAGGCAGCCGCCCGCTTGCAAGTGGCC
AAGGCCCAGTCGCAGGAGCAGCGCGAATCCTGGACCCTGGCCAAGATCGGCCCACGCAAT
GAAGACATCGCCCAGGCCACGGCCGACCTGCAAGCCTCCAGGGCCGACCTGGACCTGCTG
GAACATTACCTGGCGCGCGCTCAGCTCAAGGCGCCGACCCAGGCCCGGATCCGCACGCGC
CTGCTGGAGCCGGGGGATATGGCCTCGCCCCAGCGCCCGGTGTTTGCCCTGGCCCTGACC
GACCCCAAGTGGGTACGGGCCTATGTCAACGAACGCCAGTTGGGCCACATACGTGCGGAC
CAGATGGCGCGGGTCTACACCGACAGCTTTCCTGACCAGGCCATCGACGGCAAAGTCGGC
TACATCTCCTCGGTTGCCGAATTCACCCCCAAGTCGGTGGAAACGGAAGACCTGCGCACC
AGCCTGGTCTACGAGATCCGGGTGCTGGTCAAGGACCCTGACGATCGCCTGCGGCTCGGT
ATGCCGGCGACCGTCTACCTTGACCAGGCACCGGTGGCCGGGGCCACGCCATGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR006143 RND efflux pump, membrane fusion protein (Family)
[53-273] 6.7e-14 PF00529
PF00529   HlyD
SignalP
[1-18] 0.942 Signal
Eukaryota   
[1-17] 0.926 Signal
Bacteria, Gram-negative   
TMHMM
[5-24] Transmembrane (i-o)
Transmembrane 1   
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