Rapam_00100
Rapam_00110 : CDS information
Location
| Organism | Streptomyces rapamycinicus |
|---|---|
| Strain | NRRL 5491 |
| Entry name | Rapamycin |
| Contig | X86780 |
| Start / Stop / Direction | 41,245 / 10,574 / - [in whole cluster] 41,245 / 10,574 / - [in contig] |
| Location | complement(10574..41245) [in whole cluster] complement(10574..41245) [in contig] |
| Type | CDS |
| Length | 30,672 bp (10,223 aa) |
Annotation
| Category | 1.1 PKS |
|---|---|
| Product | polyketide synthase |
| Product (GenBank) | polyketide synthase |
| Gene | |
| Gene (GenBank) | rapB |
| EC number | |
| Keyword | |
| Note | |
| Note (GenBank) | |
| Reference |
|
PKS/NRPS Module
| 5 |  | malonyl-CoA |
| 6 |  | methylmalonyl-CoA |
| 7 |  | methylmalonyl-CoA |
| 8 |  | malonyl-CoA |
| 9 | | malonyl-CoA |
| 10 | | methylmalonyl-CoA |
Sequence
>polyketide synthase [polyketide synthase] MREDQLLDALRKSVKENARLRKANTSLRAAMDEPLAIVGMACRLPGGVSSPEDLWRLVES GTDAISGFPADRGWDVENLYDPDPEAAGKSYCVQGGFLDSAGGFDASFFGISPREALAMD PQQRLVLEASWEAFERAGIEPGSLRGSDTGVFMGAYPGGYGVGADLGGFGATAGAVSVLS GRVSYFFGLEGPAVTVDTACSSSLVALHQAAYALRQGECSLALVGGVTVMATPQSFVEFS RQRGLASDGRCKAFADSADGTGWAEGAGVLLVERLSDAQRKGHQVLAVVRGSAVNQDGAS NGLSAPNGPSQQRVIRAALSNAGLSTAEVDVVEAHGTGTTLGDPIEAQALLATYGQDREQ PLLLGSVKSNLGHTQAAAGVSGVIKMVMALQHVLVPRTLHVDEPSRHVDWTDGAVALVTE NQPWPDMGRPRRAGVSSFGISGTNAHVILESAPPTQAVDDVPPAEAPVVASELVPLVISA RTLPALVEYEDRLRAYLAASPGVDVRGVASTLAVTRSVFEHRAVLLGDDTVTGTTVSDPR VVFVFPGQGSQRAGMGEELAAAFPVFARIHQQVWGLLDVPDLEVNETGYAQPALFALQVA LFGLLESWGVRPDAVVGHSVGELAAGYVSGLWSLEDACTLVSARARLMQALPPGGVMVAV PVSEDEARAVLGEGVEIAAVNGPSSVVLSGDETAVLQAAAALGKSTRLATSHAFHSARME PMLEEFRTVAERLTYQTPRLAMAAGDRVTTAEYWVRQVRDTVRFGEQVASYEDAVFIELG ADRSLARLVDGVAMLHTDHEAQAAISALAHLYVNGVTVDWTALLGDAPATRVLDLPTYAF QHQRYWLEGADRAAAGGHPLLGPAVGLAEASGVLFTSQVSRSGDLWLQDQTVLPATAFAE 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>polyketide synthase [polyketide synthase] ATGAGGGAAGATCAGCTTCTCGACGCATTGCGCAAGTCGGTCAAGGAGAACGCGCGGCTC CGCAAGGCGAACACGTCGTTGCGGGCAGCCATGGACGAGCCGTTGGCGATTGTGGGTATG GCGTGCCGTCTGCCGGGTGGGGTGTCGTCCCCGGAGGATCTGTGGCGCCTTGTCGAGTCG GGTACGGACGCGATTTCCGGATTCCCCGCCGACCGTGGCTGGGACGTCGAGAACCTGTAC GACCCTGATCCGGAGGCGGCAGGCAAGTCGTACTGCGTGCAGGGCGGCTTCCTGGACTCC GCAGGCGGTTTCGACGCCTCGTTCTTCGGGATCAGTCCTCGTGAGGCGTTGGCGATGGAT CCGCAGCAGCGGCTGGTCCTGGAGGCGTCCTGGGAAGCGTTCGAACGGGCCGGGATCGAA CCCGGTTCCCTCCGCGGTAGCGACACCGGTGTTTTCATGGGTGCGTACCCCGGTGGCTAC GGCGTTGGTGCCGACCTCGGCGGCTTCGGGGCAACTGCCGGTGCGGTGAGTGTCCTGTCG GGTCGGGTGTCGTATTTCTTCGGTCTCGAGGGGCCGGCTGTCACGGTGGACACGGCGTGT TCGTCGTCGTTGGTGGCGTTGCATCAGGCGGCGTATGCCCTGCGGCAGGGTGAGTGTTCG CTGGCCCTGGTCGGTGGTGTCACTGTGATGGCCACGCCGCAAAGTTTCGTGGAGTTCTCG CGGCAGCGTGGCCTGGCCTCCGACGGCCGGTGCAAGGCGTTCGCGGATAGTGCGGACGGC ACGGGCTGGGCTGAAGGCGCCGGTGTGCTGCTGGTAGAGCGGCTGTCCGATGCCCAGCGC AAGGGCCACCAGGTGCTTGCGGTGGTGCGGGGATCGGCGGTCAATCAGGACGGTGCGTCG 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CCCGGGGTGGATATGCGGGCTGTGGCATCGACGCTGGCGATGACACGGTCGGTGTTCGAG CACCGTGCGGTGATCGTGGGTGATGACACTGTTAGTGGGACCGCGGCGACCGATCCGCGG GTGGTGTTCGTCTTCCCGGGGCAGGGGTCGCAGCGTGCTGGTATGGGTGCGGAACTGGCC GCCGCGTTCCCCGTCTTCGCGCGGATCCATCAGCAGGTGTGGGACCTGCTCGATGTGCCC GATCTGGAGGTGAATGAGACCGGTTACGCCCAGCCGGCTTTGTTCGCTTTGCAGGTGGCT CTGTTCGGGTTGCTGGAATCGTGGGGTGTACGGCCGGACGCGGTGATCGGCCATTCGGTG GGTGAGCTTGCGGCTGCGTACGTGTCCGGGTTGTGGTCGTTGGAGGATGCCTGCACTTTG GTGTCGGCGCGGGCTCGTCTGATGCAGGCTCTGCCTGCGGGTGGGGTGATGGTCGCTGTC CCGGTCTCGGAGGATGAGGCTCGGGCCGTGCTGGGTGAGGGTGTGGAGATCGCCGCGGTC AACGGCCCGTCGTCGGTGGTTCTCTCCGGTGATGAGGCCGCTGTGCTGCAGGCCGCGGAG GGGCTGGGGAAGTGGACGCGGCTGGCGACCAGTCACGCGTTCCATTCCGCCCGTATGGAG CCGATGCTGGAGGAGTTCCGGGCGGTCGCTCAAGGCCTGACCTATCACGCACCTGGTGTC GTGATGGCCGCTGGTGATCGGGTGATGACGGCTGAGTATTGGGTGCGGCAGGTCCGGGAT ACGGTCCGGTTCGGCGAGCAGGTGGCCTCATACGAGGACGCCGTGTTCGTCGAGCTGGGT GCCGACCGGTCACTGGCCCGCCTGGTCGACGGCGTCGCGATGCTGCACGGCGACCACGAA ACCCAGGCCGCGATCGGCGCCCTGGCCCACCTGTATGTCAACGGCGTCACCGTCGACTGG ACCGCGCTGCTGGGTGATGTCCCGGTAACCCGGGTGCTGGATCTTCCGACGTACGCCTTC CAGCAGCAGCGGTATTGGGCTGAGGTCGGCCGGTCTGCCGATGTGTCGGGGGCGGGTCTG GATGCGGTGGGGCATCCGTTGCTGGGTGCGGTGGTGGCGTTGCCGGGTTCGGATGGTGTG CTGTTGACCGGGCGGGTGTCGTTGGCCACGCATGCGTGGCTGGCTGATCACGCGGTGCGG GGCAGTGTGCTGCTGCCCGGTACCGGGTTTGTGGAGCTGGTTGTCCGCGCGGCTGATGAG GTGGGCTGCGACGTCGTTGACGAGCTGATCGTCGAAGCCCCGCTTCTGCTGCCGCAGACC GGCGGTGTGCAGGTGTCGGTATCGGTTGGTGAGGCTGACGAGTCCGGACACCGGGTGGTG ACGATCTTCTCCCGGGCGGACAACGCCGATACCTGGGTCCGGCACGTTTCCGCCGTGATC AGTACCTCTGACTCGACGGTCTCGCTGTCGGAGTTTGCCTCGTGGCCACCAGCTCAGGCA CAGCCGGTGGACGTGACGGGCTTCTACGACCCGCTGATGGCAGAAGGGTACGAGTACGGT CCCGCGTTCCAGGGTTTGCAGGCCGCGTGGCGTTATGGGGACACTGTCTTCGCCGAGGTT GCTCTGGCTGAGGAGCAGGTCCGGGAGGCGGCGCGATATCCCTCCGTGCATCCGGCTCTA CTGGATGCGGCTCTGCATGCCTGCACCCTTGAATGCGCCGATGCCGAGGTGGGTGTGGGG CTGCCGTTCTCCTGGGACGGTGTTCGGGTCCATGCTGGTGGTTCGGCCATGTTGCGTGTC GCGGTGACGCAGGCGGCGGATGGCTGGAGTGTGCGGGTCGCTGATGAGATCGGTCGGCCG GTGGCTAACGTGGGTTCGCTCGTGACGCGCCCGGTGACGGCCGACGCGCTCGGTTCCGCT GCCGATGACCTGCTCGCCTTGACCTGGGCGGAGATCCCGGCCCCTGAGGGGACCGGACTG ACGGTCGGCCGGTTCGAGGAGCTGGTGTCGGACGGCGATGTGCCGGTACCCGAGGTGGCG GTCTTCACCGCACTCCCCGACAACGACGACGACCCGCTGGAGCAAACACGAAAGCTGACC GGTCAGGTCCTCCAGGCAGTTCAGGAGTGGCTTGGCGGGGAGCGCTTCAGCGACAGCACG CTGGTGGTGCGGACCGGTACTGGTTTGGCCGCTGCTGGGGTGTCGGGGTTGATGCGGTCG GCCCAGTCCGAACACCCCGGCCGGTTCGTCCTGGTCGAGAGTGATGACGATGCCCTCGCT CTGGATCAGTTGGCGGCGGCGGTCGGGTTGGATGAGCCGCGCCTGCGGATCAGCGACGGC CGCTTCGAAGCGCCACGACTGACCCGTACGCATGCCGCTGAACCCGAGTCAGAGAAGGTG TGGGATCCGGATGGCACGGTTCTGATCACCGGTGGTTCGGGTGTGCTGGCGGGGATCGCC GTCCGGCACCTGGTGACCGAACGCGGCGTGCGTCATCTCCTTCTGCTGTCCCGCAGCGCC CCGGACGAGGCACTGATCAACCAACTCGGCGAACTGGGGGCCCGGGTCGAGACAGCGGCC TGTGACGTGTCCGATCGTGCCGCGCTGGCCCAGGTGCTGGCGGGTGTGTCACCGGAGCAT CCCCTGACGGCCGTGATTCACACCGCGGGCGTACTCGATGACGGTGTGGTGGAGTCCCTG ACCGCGCAGCGGCTGGACGCGGTGTTGCGGCCCAAGGCCGACGGTGCGTGGAACCTGCAC GAGCTCACCCGGGATGCCGACCTGGCGGCGTTCGTCATGTATTCCTCCGCCGCTGGTGTG CTCGGCAGTGGGGGACAGGGCAACTACGCGGCGGCCAATGCGTTCCTGGACGCGCTGGCT 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TCGGAACTGGTGCCGCTGGTGATATCGGCCAAGACCCAGCCCGCCCTGACCGAACACGAA GACCGGCTCCGCGCCTACCTGGCGGCGTCGCCCGGAGTGGATATACGGGCTGTGGCATCG ACGCTGGCGGTGACACGGTCGGTGTTCGAGCACCGCGCCGTACTCCTTGGAGATGAGACC GTCACCGGCACCGCGGTGTCCGACCCCAGGATCGTGTTCGTCTTTCCCGGGCAGGGATGG CAGTGGCTGGGGATGGGCAGTGCACTGCGCGATTCGTCGGTGGTGTTCGCCGAGCGGATG GCCGAGTGCGCGGCGGCGTTGAGTGAGTTTGTGGACTGGGATCTGTTCGCCGTGCTGGAT GATCCGGCGGTGGTGGACCGGGTTGATGTGGTCCAGCCCGCTTCCTGGGCGGTGATGGTT TCCCTGGCCGCGGTGTGGCAGGCCGCCGGTGTGCGGCCGGATGCGGTGATCGGCCATTCG CAGGGTGAGATCGCCGCGGCGTGTGTGGCGGGTGCGGTGTCGATGCGGGATGCCGCCCGG ATCGTGACCTTGCGCAGCCAGGCGATCGCCCGGGGCCTGGCGGGCCGTGGTGCGATGGCA TCCGTCGCCCTGCCCGCACAGGATGTCGAGCTGGTCGACGGGGCCTGGATCGCCGCCCAC AACGGTCCCGCCTCCACCGTGATCGCGGGCACCCCGGAAGCGGTCGACCATGTCCTCACC GCTCTGAGGCAAAGGGGTGCGGGTGCGGCGGATCACGTCGACTACGCCTCGCACACCCCG CACGTCGAGCTGATCCGCGACGAACTGCTCGACATCACTAGCGACAGCAGCTCGCAGGAC CCGCTCGTGCCGTGGCTGTCGACCGTGGACGGCACCTGGGTCGACAGCCCGCTGGACGGG GAGTACTGGTACCGGAACCTGCGTGAGCCGGTCGGTTTCCACCCCGCCGTCAGCCAGTTG 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Feature
| BLASTP Database:UniProtKB:2011_09 |
|
|---|---|
| InterPro Database:interpro:38.0 |
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IPR006162 Phosphopantetheine attachment site (PTM)
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
IPR011032 GroES-like (Domain)
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IPR013154 Alcohol dehydrogenase GroES-like (Domain)
IPR013968 Polyketide synthase, KR (Domain)
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IPR014031 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (Domain)
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
IPR018201 Beta-ketoacyl synthase, active site (Active_site)
IPR020801 Polyketide synthase, acyl transferase domain (Domain)
IPR020806 Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding domain (Domain)
IPR020807 Polyketide synthase, dehydratase domain (Domain)
IPR020841 Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase domain (Domain)
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IPR020843 Polyketide synthase, enoylreductase (Domain)
|
| SignalP | No significant hit |
| TMHMM | No significant hit |
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