Rubra_00510 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces achromogenes var. rubradiris
Strain	NRRL 3061 (=NBRC 14000)
Entry name	Rubradirin
Contig	AJ871581
Start / Stop / Direction	92,317 / 93,243 / + [in whole cluster] 92,317 / 93,243 / + [in contig]
Location	92317..93243 [in whole cluster] 92317..93243 [in contig]
Type	CDS
Length	927 bp (308 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	NDP-hexose C-4 O-methyltransferase
Product (GenBank)	hypothetical protein
Gene
Gene (GenBank)	rubN7
EC number	2.1.1.-
Keyword	D-rubranitrose
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q2PC39 PmId [18080113] Biosynthesis of rubradirin as an ansamycin antibiotic from Streptomyces achromogenes var. rubradiris NRRL3061. (Arch Microbiol. , 2008) [23885759] Nitrososynthase-triggered oxidative carbon-carbon bond cleavage in baumycin biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2013) comment [PMID: 18080113](2008) Rubradirin生合成clusterの報告。 Table1>配列比較からの推定機能 RubN7(308aa): Unknown 本文中ではO-methyltransferase RubN1-N8はdTDP-D-rubranitroseの合成に推定的に関与していることが配列解析で明らかになった。 nanchangmycin producerであるS. nanchangensisのL-evernitrose and O-methyl-L-rhodinoseに関与する4-O-methyltransferase(Sun et al. 2003)に高度な類似性を示すが、deoxysugar pathwaysに関連するその他のO-methyltransferasesとの有意な類似性は示さない。 --- [PMID: 23885759](2013) RubN7をクローニング、過剰発現、精製。dTDP-L-epi-vancosamineとSAMとRubN7のインキュベーションで、dTDP-L-evernosamineの形成(4-O-methylation)が見られた。
Related Reference	ACC Q2I754 PmId [16632249] Biosynthesis of the terpene phenalinolactone in Streptomyces sp. Tu6071: analysis of the gene cluster and generation of derivatives. (Chem Biol. , 2006) comment 5th(Q2I754) 57%, 3e-95 Streptomyces sp. Tu6071_plaM1 PlaM1 PlaM1は、putative rhodinosyl-4-O-methyltransferase_NanMと高い相同性あり。 PlaM1 inactive mutantでは、wildの主要代謝産物phenalinolactones A and Dが両方とも産生されず、新しい代謝産物を産生する。それはphenalinolactones chromophoreの典型的なUV/VIS spectrumを示すが、HPLC/electrospray ionization (ESI)-MSによって解析したところ、methyl基がないことがわかった。さらに1H-NMR spectroscopyからその位置を同定した。以上からPlaM1がL-amicetosyl-4''-O-methyltransferaseであることが実証された。

Sequence

>NDP-hexose C-4 O-methyltransferase [hypothetical protein]
MTGQVHRRYGPSAQWLHINEAHITEEAVADLAGFKSNGVNFKLALWNPQPNGVRYLKALT
FALGMQLSPANRERLQRTRNREVGDPYAVRCNGEPVCLDYLQAVHEVEFMAANLPLDGAR
IMEIGAGYGRTCHTLLSNHEVAGYTIVDLPNTLALSRRYLHTVLEPEQFAKIRFVGVDEV
EEQVRGARFDLCLNIDSFAEMDPGTVGDYLALIDATCAHFYVNNPVGKYIDKTLDGHSQG
AAVVELALNSGLLRDVIDIHDSEAVLQKVPAFVSAYRPGPRWQCVARERAVSWSYYWQAL
YRAGAVPR

>NDP-hexose C-4 O-methyltransferase [hypothetical protein]
ATGACCGGTCAGGTGCACCGGCGTTACGGCCCGAGCGCGCAGTGGCTGCACATCAACGAG
GCGCACATCACCGAGGAGGCCGTGGCCGACCTCGCCGGGTTCAAGTCGAACGGGGTCAAC
TTCAAGCTGGCGCTGTGGAACCCGCAGCCCAACGGCGTGCGCTACCTCAAGGCCCTCACC
TTCGCCCTGGGCATGCAGCTCAGCCCCGCCAACAGGGAGCGGCTGCAGCGCACACGCAAC
CGGGAGGTCGGCGACCCCTATGCGGTGCGCTGCAACGGCGAACCGGTGTGCCTGGACTAT
CTGCAGGCGGTGCACGAGGTCGAGTTCATGGCGGCGAACCTGCCCCTCGACGGCGCCCGC
ATCATGGAGATCGGCGCCGGCTACGGCCGGACCTGTCACACCCTGCTGTCCAACCACGAG
GTCGCCGGATACACGATCGTCGATCTGCCGAACACGCTCGCCCTGTCGCGCCGGTACCTG
CACACCGTGCTGGAGCCGGAGCAGTTCGCGAAGATCCGTTTCGTGGGCGTCGACGAGGTG
GAGGAGCAGGTGCGCGGCGCCCGCTTCGATCTGTGCCTGAACATCGACTCGTTCGCCGAG
ATGGACCCCGGCACCGTAGGGGACTACCTCGCGCTCATCGACGCGACCTGCGCGCACTTC
TACGTCAACAACCCGGTCGGCAAGTACATCGACAAGACGCTGGATGGCCACTCGCAGGGC
GCCGCCGTGGTGGAGCTGGCGCTCAACAGCGGGCTGCTGCGCGACGTCATCGACATCCAC
GACAGCGAGGCGGTGCTGCAGAAGGTGCCCGCTTTCGTGTCCGCCTACCGGCCCGGCCCG
CGGTGGCAGTGCGTGGCGCGGGAACGCGCGGTGTCGTGGAGTTACTACTGGCAGGCCCTG
TACCGCGCCGGGGCGGTGCCGCGGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Rubra_00500 Rubra_00520