Aver_00080 : CDS information
Location
Organism | Streptomyces avermitilis |
---|---|
Strain | ATCC 31267 (=NBRC 14893) |
Entry name | Avermectin |
Contig | AB032367 |
Start / Stop / Direction | 56,032 / 39,434 / - [in whole cluster] 50,034 / 33,436 / - [in contig] |
Location | complement(39434..56032) [in whole cluster] complement(33436..50034) [in contig] |
Type | CDS |
Length | 16,599 bp (5,532 aa) |
Annotation
Category | 1.1 PKS |
---|---|
Product | polyketide synthase |
Product (GenBank) | type I polyketide synthase AVES 3 |
Gene | |
Gene (GenBank) | aveA3 |
EC number | |
Keyword | |
Note | |
Note (GenBank) |
|
Reference |
|
PKS/NRPS Module
7 | methylmalonyl-CoA not conserved YASHS(S->C) | |
8 | malonyl-CoA | |
9 | methylmalonyl-CoA not conserved YASHS(S->C) |
Sequence
>polyketide synthase [type I polyketide synthase AVES 3] MDTSSEKLVDALRASLKANQTLRARNEQLAAAMEASSEPIAIVGMACRFPGGVCSPEELW ELVASGGDAIGEFPAGRGWDLEGLFDSDPDRSGTSYARYGGFLYEAGEFDADFFGISPRE ALAMDPQQRLLLETSWEAFERAGIDPLSMRGSRTGVFAGVMYHDYGSRLGTIPEGFEGYI GNGSGGAVASGRVAYTLGLEGPAVSVDTACSSSLVALHLACQSLRSGECTLALAGGVTVM STPHLFVEFSRQRGLSVDGRCKSFAGGADGTGMGEGVGMLLVERLSDAVRLGHRVLAVLR GSAVNQDGASNGLTAPNGPAQERVIRQALANAGLSVADVDVVEGHGTGTTLGDPIEAQAL LATYGQRAGNRPLWLGSVKSNIGHAQAAAGVGGVIKMVMALREGVLPRTLHVDEPSPQVD WSAGAVRLLTEAVPWPGDAAGRLRRAGVSSFGVSGTNAHVILEEAPAAGGCVAGGGVLEG APGLAISVAESVAAPVAVSAPVAESVPVPVPVPVPVPVSARSEAGLRAQAEALRQYVAVR PDVSLADVGAGLACGRAVLEHRAVVLAADREELVQGLGALAAGEPDRRVTTGHAPGGDRG GVVFVFPGQGGQWAGMGVRLLASSPVFARRMQACEEALAPWVDWSVVDILRRDAGDAVWE RADVVQPVLFSVMVSLAALWRSYGIEPDAVLGHSQGEIAAAHVCGALSLKDAAKTVALRS RALAAVRGRGGMASVPLPAQEVEQLIGERWAGRLWVAAVNGPRSTAVSGDAEAVDEVLAY CAGTGVRARRIPVDYASHCPHVQPLREELLELLGDISPQPSGVPFFSTVEGTWLDTTTLD AAYWYRNLHQPVRFSDAVQALADDGHRVFVEVSPHPTLVPAIEDTTEDTAEDVTAIGSLR 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>polyketide synthase [type I polyketide synthase AVES 3] ATGGACACGTCCAGCGAAAAGCTCGTCGACGCGCTTAGGGCGTCTCTGAAGGCGAACCAG ACCCTGCGGGCACGTAATGAGCAACTGGCAGCCGCCATGGAGGCGTCCAGCGAGCCGATT GCGATTGTGGGGATGGCGTGTCGTTTTCCGGGTGGGGTGTGTTCGCCGGAGGAGTTGTGG GAGCTGGTTGCGTCGGGTGGGGATGCGATTGGTGAATTTCCGGCCGGTCGGGGGTGGGAT CTGGAGGGGTTGTTTGATTCGGACCCTGACCGGTCGGGGACGTCGTACGCGCGGTATGGC GGGTTTTTGTATGAGGCGGGGGAGTTCGATGCGGACTTCTTCGGGATCAGTCCGCGTGAG GCGTTGGCGATGGATCCGCAGCAGCGGTTGTTGCTGGAGACGTCGTGGGAGGCGTTCGAG CGGGCGGGTATCGATCCGCTGTCGATGCGTGGCTCCCGTACGGGTGTCTTCGCCGGGGTG ATGTACCACGACTACGGATCCCGCCTGGGTACCATCCCCGAGGGATTCGAGGGCTACATC GGCAACGGTAGCGGCGGCGCCGTCGCGTCGGGCCGCGTCGCCTACACGCTCGGTCTCGAG GGCCCTGCCGTCTCGGTGGACACGGCATGTTCGTCGTCGTTGGTGGCGCTGCATCTGGCG TGCCAGTCGCTGCGGTCGGGTGAGTGCACGCTCGCGCTGGCCGGCGGTGTGACGGTGATG TCGACCCCGCACCTCTTCGTCGAGTTCTCACGCCAGCGCGGACTGTCGGTGGACGGCCGC TGCAAGTCCTTCGCGGGTGGAGCCGACGGCACCGGCATGGGCGAGGGCGTCGGGATGCTG TTGGTGGAGCGGTTGTCGGATGCGGTGCGGCTGGGGCATCGGGTGCTGGCGGTGCTGCGC 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CACCACCTCGACCTCCCCACTTATCCCTTCCAACGCCAGCACTACTGGCTCGACGCTCCC ACGGGAGCAGGTGACGTCGCCGCTGCTGGCTTGGAGCCGGCCGAACACCCTCTGCTCGCG GCAACAGTCCAACTCGCAGACACGGACGGCTGCCTACTGACGGGTCGCCTGTCCTTGCGC TCGCATCCGTGGCTGGGCGATTACGAGGTGGGGGGTGCGGTCCTGCTGTCGGGGTCGGCG TTCGTGGAGCTGGCGGTCCAGGTTGGCGAACGCGTGGGCTGCACCCGAATCGAGCAACTC ACTGTGCATGCGCCGCTGGTGGTTCCTGTGGGTGGGGGTGTGAGTGTGCAGGTTGGGGTT GCGGCTGCGGATGGGGAGGGGCGGCGTTTGGTGAGTGTGTATGCGCGGGGTGGGAGTGCT TGTGGTGGGGGTGGTGCGTCGGGTGGGGTGTGGACGTGTCATGCCTCGGGGGTGCTGGTT GAGGCTGCTGCTGGTGGTGGTGTGGTGGTGGATGGTCTGGCGGGGGTGTGGCCGCCGCGG GGTGCGGTGGCGGTGGATGTCGATGGTGTCCGTGACCGTTTGGCTGGGGCTGGTTGTGTT TTGGGGCCGGTGTTTTCGGGGCTGCGTGCGGTGTGGCGTGATGGGGGGGATTTGCTGGCT GAGGTGTGTCTGCCGGAGGAGGCGTGGGGTGATGCGGCTGGTTTTGGGCTGCATCCGGCG TTGCTGGATGGTGTGGTCCAGCCGTTGTCGGTGTTGCTTCCGGGTGGGACGGGGTTTGGG GAGGGGGCGGGGTTCGGGGAGGGTGTTCGGGTGCCGGCTGTGTGGGGTGGTGTGTCGCTT CACCGGGCGGGTGTGACCGGTGTGCGGGTGCGTGTGTGGGCTGTAGGGCGGGGCGGCGGG CGTGAGGCGGTGTCGGTCGTGGTCGGGGATGAGGCGGGTGTGCCGGTGGCGTCGGTCGAT 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GTGGTGGCCGGCCCGGAGGACGGCCCGGTGGATGTGGTGGGTGCGGCGGTGTGGGGGCTG GTGCGGTCGGCGCAGGCTGAGCATCCGGACCGGTTTGTCCTCCTCGACCTGGACACCGAC CTCGACAGCGGCGCTGACGCCGATGCCGGCAACGAGGCCGGTATGGGGTCTGGTCTGGAT GGTGGGCGTGTGGCTGCGGTGGTGGCGTGTGGTGAGCCGCAGTTGGCGGTGCGTGGTGAG CGGGTGCTGGCCGCACGCCTGACACGACTTGAGTCGCCGGTTGATGTATCGGGTCGGGAG GTGTTGCCGTGGTTGTCGGGTGGGTCGGTGTTGGTGACGGGTGGGACGGGTGTGCTGGGT GCGGCGGTGGCGCGGCATCTGGCTGGTGTGTGTGGGGTGCGGGATCTGTTGTTGGTGAGC CGGCGTGGTCCGGATGCTCCGGGTGCGGAGGGTTTGCGGGCGGAGCTGGCCGCGTTGGGG GCGGAGGTGCGGATTGTTGCGTGTGATGTGGGGGAGCGGCGGGAGGTGGTCCGGCTGCTG GAGGGTGTTCCTGCCGGGTGTCCGCTGACGGGTGTCGTGCATGCGGCTGGTGTGCTGGAC GATGCGACGATCGCCTCTCTCACGCCCGAGCGGCTGGGCACGGTGTTCGCGGCCAAGGTG GATGCCGCTCTTTTGCTGGATGAGCTGACGCGGGGTATGGAGCTGTCGGCGTTCGTGCTG TTCTCCTCGGCCGCGGGGATCCTGGGGTCGGCCGGGCAGGGCAACTACGCCGCGGCCAAT GCCGCTCTGGACGCGCTGGCGTACCGGCGGCGGGCGGCGGGTCTGCCGGGGGTGTCGCTG GCGTGGGGGCTGTGGGAAGAGGCCAGCGGGATGACCGGGCACCTGGCCGGCACCGACCAC CGGCGCATCATCCGTTCCGGTCTGCATCCCATGTCGACCCCGGACGCACTGGCTCTCTTC 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AGCTTTGGCCTTGAGGGTCCGGCCGTGACCGTCGATACGGCGTGTTCGTCGTCGTTGGTG GCGTTGCATTGGGCGGCGCAGGCGTTGCGTGCGGGTGAGTGTTCGATGGCGCTTGCCGGG GGTGTGACGGTGATGTCGTCTCCGGGTACGTTTGTGGAGTTCTCACGTCAGCGGGGTCTG GCCGCGGACGGGCGGTGCAAGGCCTATTCGGCGGCTGCTGACGGTACCGGCTGGGCCGAG GGTGTGGGGATGCTGCTGGTGGAGCGGCTCTCCGACGCCCGTCGCAACGGTCACCGTGTC CTGGCCGTGGTGCGTGGCAGTGCGGTCAACCAGGACGGTGCGAGCAACGGTCTGACCGCG CCCAACGGGCCCTCCCAGCAGCGTGTCATCCGTCAGGCCCTGGCCAATGCGGGACTGACC CCGGCCGATGTCGACGCAGTGGAGGGCCACGGCACCGGGACCACTCTGGGGGACCCGATC GAGGCCCAGGCACTCCTGGCCGCCTACGGACAACACCGCCCCCACCACCGCCCCTTGTGG CTGGGATCCCTCAAATCCAACATCGGGCACGCACAGGCCGCCGCGGGCGTGGGCGGAGTC ATCAAGATGGTGATGGCCCTGCGCAACGGGCTGCTGCCACAGACCCTCCACGTGGACGAG CCCACCCCCCAGGTCGACTGGTCCACAGGCGCAGTACAACTCCTGACACAACCGGTGCCC TGGCCCGCCGACCCGGCCGGCCGGCCACGCCACGCCGGCGTGTCATCATTCGGCGTCAGC GGCACCAACGCCCATGTGATTTTGGAGGAGGCGCCTGCGGCGGCGGGCGGTGCTGCCGGT GGTGGGGTGTCGGTGGGTGCTCCGAATCCAGCCCTTCCGGTGGCTGAGTCTGAGCCGGTG CCGGTGCCGGTGCCGGTGTCGGCGAGGTCTGAGGCCGGGTTGCGGGCGCAGGCACAGGCG TTGCGCCAGTACGTGGCAGCCCGCCCGGACATGTCACCTGCCGACATCGGTGCGGGTCTG GCCCGCGGCCGGGCCGTACTGGAACACCGCGCCGTCATCCTGGCCGCGGACCGCGAGGAA CTGGCGCAGGCACTGACAGCCCTGGCAGCCGGCGAACCCCACCCCCACATCACCACAGGC CACACCCGGGGCAGTGACCGCGGCGGCGTCGTCTTCGTCTTCCCCGGACAGGGCGGCCAG TGGGCCGGGATGGGCCTGACCCTGCTCACCTCCTCACCCGTGTTCGCCGAACACATCGAC GCATGCGAGAAAGCCCTCACCCCCTGGGTGCCCTGGTCCCTGACCGACATCCTGCACCGC GACCCCGACGACCCCGCATGGCAACAAGCCGACGTGGTCCAGCCCGTGCTCTTCAGCATC ATGGTCTCCCTCGCCGCCCTGTGGCGCTCCTACGGCATCGAACCCGACGCGGTCCTCGGC CACTCCCAGGGAGAAATCGCCGCCGCCCACATCTGCGGCGCACTCAGCCTGAAAGACGCC GCCAAAACCGTTGCACTGCGCAGCCAGGCACTGGCCGCCGTACGAGGCCGGGGCGCCATG GTCTCACTGCCCCTGCCCGCCCAGGACGTGCAGCAGCTCATTTCCGAACGGTGGGAAGGG CAGTTGTGGGTGGCAGCCCTCAACGGCCCCCACTCCACCACCGTCTCCGGCGACACCACC GCAGTAGAAGAACTCCTCACCCACTGTGCCGACACCGGCCTACGGGCCAAACGCATCCCC GTCGACTACGCCTCCCACTGCCCCCACGTCCAACCCCTCCACGACGAACTCCTGCACCTG CTGGGAGACATCACCCCCCAGCCGTCCACCATGCCGTTCTTCTCCACCGTCGTAGGGCAC CTGGTCTGGTACACCACAACCCTGGACGCCGCCTACTGGTACCGCAACCTCCACCAGCCC GTCCGCTTCAGCCACGCCATCCAGACCCTGACCGACGACGGACACCGCCCCTTCATCGAA ATCAGTCCCCACCCCACCCTCGTCCCCGCCATCGAAGACACCACCGAAAACACCACCGAA AACATCACCGCGACCGGCAGCCTCCGCCGCGGCGACAACGACACCCACCGCTTCCTCACC GCCCTCGCCCACACCCACACCACCGGCATTCGGACACCCACCACCTGGCACCACCACTAC ACCCAAACCCACCCCCACCCCCACAACCACCACCTCGACCTGCCCACCTACCCCTTCCAA CACCAGCACTACTGGCTCCAACCACCCACCACGACAACCGACCTCACCACCACCGGCCTC ACCCCCACCCACCACCCCCTCCTCACCGCAACACTCACCCTCGCCAACAACAACACACAA CTACTCACCGGCCGCCTCTCCCTACGCACCCACCCCTGGCTCACCGACCACACCGTCGTC GGTACCACTCTTGTGCCAGGAACCGCCCTCCTCGAACTCGCCCTCCAAGCAACCACGACC GACCACCTCGAAGAACTCGCCCTCCACACGCCTCTCGTCATCCCCCGTGAGGGTGCCGTC GACGTTCAGGTGCACATCAATCCACCGGACGACACCGACACTCGTTCACTGACGATCTAC TCGCGAAGCGAGAACGCCCCCGCAGCGGCTCCCTGGCGTCATCACGCCACGGCCGTTCTG GGAACCAAGACCTCGCGCATTGAGACAGGCCGTAGCCACGATGATCTGTCGATGTGGCCG CCAGCGGGCGCAGTTCGCTGTGCTGATGAGGAATTGGCAGCCTTGTATGGCGACTACGAG GCAAATGGCTTTGTCTATGGCCCCGCATTCCGGGGGCTGACTGCTGCCTGGCGTCTGGGA GACGAGGTGTTTGCCGAGGTTCGCCTTCCAGAACAGGTGCACGGCGAGGCATCCGCGTAC AACCTGCACCCGGCACTGCTGGATGCTGCCTTGCACGCAGCGGCCTTTGCGCCGTCGGGC AGTCTGCCGCAGGGATCCGTACCGTTCTCCTTCACCGGTGTGACGCTGCACGCCGCCAAT GCGTCGTCGTTGCGCGTGCGACTCTCGCCGGCCGATCCGAACAGCGGCCACGCCGCAGTT TCCGTGCTGGTCACGGATGACACCGGTACGCCCGTGGCGTCCGTCGAGGCGTTGGCGGTG CGCCCGTTGGCGGCGGACGAATTGCGAGCTGCCGAGCGCGCCGTACAGCGCGCTGAGCTC TTCGACATGAAGTGGGTTGAGGTGCCCTCAGATGTACTGGTGTCGGGCGGGGCATCGGTG GTGGTGCTGGATGGTGCCGACGACCTCGTTGGTCTGGCGGCTGAGGAGGATGGTGTGCCG GGGGTGGTGGTGTTGCGGTGCCCGGATGCCGGTGCCGATGGCGGCGGTGGTGGCGGTGGT GTGGGTGAGGTTGTTGGTGGGGTGTTGGGTGTGGTGCAGGGGTGGCTGGGGCTGGAGCGG TTTGCGGGTTCGCGGCTGGTGGTGGTGACCCGGGGTGCGGTGGTGGCCGGCCCGGAGGAC GGCCCGGTGGATGGCCCGGTGGATGTGGTGGGTGCGGCGGTGTGGGGGCTGGTGCGGTCG GCGCAGGCTGAGCATCCGGACCGGTTTGTCCTCCTCGACCTGGACACCGACCTCGACAGC GGCGCTGACCGCGATGCCGGCAACGAGGCCGGTATGGGGTCTGGTCTGGATGGTGGGCGT GTGGCTGCGGTGGTGGCGTGTGGTGAGCCGCAGTTGGCGGTGCGTGGTGAGCGGGTGCTG GCCGCACGCCTGACACGACTTGAGTCGCCGGTTGATGTATCGGGTCGGGAGGTGTTGCCG TGGTTGTCGGGTGGGTCGGTGTTGGTGACGGGTGGGACGGGTGTGCTGGGTGCGGCGGTG GCGCGGCATCTGGCTGGTGTGTGTGGGGTGCGGGATCTGTTGTTGGTGAGCCGGCGTGGT CCGGATGCTCCGGGTGCGGAGGGTTTGCGGGCGGAGCTGGCCGCGTTGGGGGCGGAGGTG CGGATTGTTGCGTGTGATGTGGGGGAGCGGCGGGAGGTGGTCCGGCTGCTGGAGGGTGTT CCTGCCGGGTGTCCGCTGACGGGTGTCGTGCATGCGGCTGGTGTGCTGGACGATGCGACG ATCGCCTCTCTCACGCCCGAGCGGCTGGGCACGGTGTTCGCGGCCAAGGTGGATGCCGCT CTTTTGCTGGATGAGCTGACGCGGGGTATGGAGCTGTCGGCGTTCGTGCTGTTCTCCTCG GCCGCGGGGATCCTGGGGTCGGCCGGGCAGGGCAACTACGCCGCGGCCAATGCCGCTCTG GACGCGCTGGCGTACCGGCGGCGGGCGGCGGGTCTGCCGGGGGTGTCGCTGGCGTGGGGG CTGTGGGAAGAGGCCAGCGGGATGACCGGGCATCTGGCCGGCACCGACCACCGGCGCATC ATCCGTTCCGGTCTGCATCCCATGTCGACCCCGGACGCACTGGCCCTCTTCGATGCGGCC CTGGCTCTGGACCGGCCGGTCCTGCTGCCCGCCGACCTGCGTCCCGCCCCGCCCCTGCCG CCCCTGCTGCAGGACCTCCTGCCCGCCACCCGCCGCCGCACCACCCGCACCACCACTACC GGTGGTGCGGACAACGGCGCCCAGCTGCACGGCCGGCTGGCCGGCCAGACACACGAACAA CAGCACACCACCCTCCTCGCCCTGGTCCGCTCCCACATCGCCACCGTCCTGGGCCACACC ACCCCCGACACCATCCCCCCCGACCGCGCGTTCCGCGACCTCGGCTTCGACTCCCTCACC GCCGTCGAACTACGCAACCGGCTCTCCCACACCACCGGACTCCGCCTCCCCACCACCCTC GCCTTCGACCACCCCAACCCCACCACCCTCACCCACCACCTCCACACACAACTCGTCAGC AAGGGACTCACCGCCGCGGCCGAGCCGGACGCCGCAACGACACCCCCGGGGCTGCCCTCG CTGCTCTCGGAGCTCGAGCGGCTGGAGGCGGTAGTGCTCTCCTCCACCACATCCTCCGCT GCCCCGCTGGACGACGGCGCGCGCACGCGGCTGGCCTCCCGACTGCATTCCCTCGCCCAG AAGTTGAACGGCGACGACACCGCCCCCGACCTCGCAGAGACATCGGACGAGGAGATGTTC GCTCTCATCGACAGGGAAGTCGGATTCGAATCTCAATGA
Feature
BLASTP Database:UniProtKB:2011_09 |
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---|---|
InterPro Database:interpro:38.0 |
IPR001227 Acyl transferase domain (Domain)
IPR002198 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (Family)
IPR006162 Phosphopantetheine attachment site (PTM)
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
IPR013968 Polyketide synthase, KR (Domain)
IPR014030 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal (Domain)
IPR014031 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (Domain)
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
IPR018201 Beta-ketoacyl synthase, active site (Active_site)
IPR020801 Polyketide synthase, acyl transferase domain (Domain)
IPR020806 Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding domain (Domain)
IPR020807 Polyketide synthase, dehydratase domain (Domain)
IPR020841 Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase domain (Domain)
IPR020842 Polyketide synthase/Fatty acid synthase, KR (Domain)
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SignalP | No significant hit |
TMHMM | No significant hit |