Adria_00070 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces peucetius
Strain	ATCC 29050 (=NBRC 100596)
Entry name	Doxorubicin
Contig	U77891
Start / Stop / Direction	22,659 / 23,990 / + [in whole cluster] 5,654 / 6,985 / + [in contig]
Location	22659..23990 [in whole cluster] 5654..6985 [in contig]
Type	CDS
Length	1,332 bp (443 aa)

Annotation

Category	5.1 general function
Product	putative glycosyltransferase
Product (GenBank)	putative baumycin biosynthesis protein
Gene
Gene (GenBank)	dnrH
EC number
Keyword	baumycin
Note
Note (GenBank)	catalyzes formation of baumycins, C-4' glycosides of doxorubicin; putative glycosyl transferase; DnrH
Reference	ACC P95834 PmId [8955419] Enhanced antibiotic production by manipulation of the Streptomyces peucetius dnrH and dnmT genes involved in doxorubicin (adriamycin) biosynthesis. (J Bacteriol. , 1996) [23885759] Nitrososynthase-triggered oxidative carbon-carbon bond cleavage in baumycin biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2013) comment [PMID: 8955419](1996) dnrH不活化mutantは、RHOが2.5倍減、daunorubicin (DNR)8.5倍増、doxorubicin (DXR)増。 dnrH(-) strainでdnrHを過剰発現すると、RHO, DNR産生をwildレベルに回復。 dnrH(-) strainでdnmTを過剰発現すると、RHOが192倍減、DNRが9.4倍増。 baumycinsに通常割り当てられたHPLC chromatogramは、dnrH mutant strainのchromatogramから消失。 DnrH proteinは知られたglycosyltransferasesに似ているので、このタンパクはDNR→baumycinsとして知られるpolyglycosylated formsへの変換を触媒するかもしれない。 --- [PMID: 23885759](2013) クローニング、精製したDnrHを使って実験しているが、機能解明には至っていない。 Baumycins生合成への関与が提唱されている。
Related Reference	ACC Q9ZGH7 NITE Pikro_00090 PmId [15161264] Characterization of the glycosyltransferase activity of desVII: analysis of and implications for the biosynthesis of macrolide antibiotics. (J Am Chem Soc. , 2004) [15358425] New olivosyl derivatives of methymycin/pikromycin from an engineered strain of Streptomyces venezuelae. (FEMS Microbiol Lett. , 2004) [20695498] Characterization of glycosyltransferase DesVII and its auxiliary partner protein DesVIII in the methymycin/picromycin biosynthetic pathway. (Biochemistry. , 2010) [23770075] Combinatorial biosynthesis and antibacterial evaluation of glycosylated derivatives of 12-membered macrolide antibiotic YC-17. (J Biotechnol. , 2013) [26552796] In vivo investigation to the macrolide-glycosylating enzyme pair DesVII/DesVIII in Saccharopolyspora erythraea. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2016) comment BLAST id51% Streptomyces venezuelae_desVII Glycosyl transferase --- [PMID:15161264](2004) abstract glycosyltransferase DesVII のin vitro活性を実証。十分な活性を得るには、塩基性pHと追加タンパク成分DesVIII を必要とする。 --- [PMID:15358425](2004) 内因性deoxusugar(dTDP-D-desosamine)の生合成に関する全体的なgene clusterを削除し、dTDP-4-keto-6-deoxyglucose(内因性のdesosamine中間体)またはdTDP-D-olivose(外因性)の生合成に必要な遺伝子で置換したS.venezuelae mutant株において、'sugar-flexible' glycosyltransferase(DesVII) は12員環と14員環両方のmacrolactonesがquinovose or olivoseでglycosylateされた10-deoxymethynolide and narbonolideを産生した。またこれらのglycosylationにはDesVII に加えてDesVIII も必須であることが確認されている。 --- [PMID: 20695498](2010) DesVII はglycosyltransferases活性のために追加protein componentであるDesVIII を必要とする。 recombinant DesVIII proteinの追加でDesVII によるglycosylation効率を改善。量はとても少ないが、desVIII はそのhomolog dnrQによって置換されうる。 DesVII/DesVIII 複合体の形成はvivoでの両遺伝子の同時発現を必要とし、vitroでの個々に産生されたタンパクの混合では完全には達成されない。 DesVII と DesVIII の比率は1:1で、複合体はheterodimersの3量体[(αβ)3]として存在する。 DesVII/DesVIII 複合体の触媒効率は、DesVII のみのときより少なくとも2×10(3)倍高い。よって、DesVIII はタンパク産生のときDesVII の折りたたみを補助し、触媒中きつく結合したままにすることが示唆される。 --- [PMID:23770075](2013) abstract 基質が柔軟なglycosyltransferase DesVII とdeoxysugar生合成gene cassettesを用いて、様々な糖でD-desosamineを置換したglycosyl-10-deoxymethynolideを作成している。L-rhamnoseでの置換により抗菌活性が良くなった。

Sequence

>putative glycosyltransferase [putative baumycin biosynthesis protein]
MRVLFATMAARSHVYAQVTLASALRTAGHEVLVASQPDVLDDIVRAGLTAVRIGEDLNIE
EETREANASFEDDRNLGGLAMSNSRDDPFPWDHALGMFTAMTAMVFQNVCPEPMVDDLVG
LARDWRPDLVVWDPLTLAGPVAARLSGAAHARLLFGPDQMGRNRTAFRALLDRQPPELRD
DPLAEWLTWTLERCGGSAGDMSEELVLGQWTIDPTPPSMRIPLDLPCVPVRYVPYNGPSL
LPGWLREPPRHPRRLCLTLGVSLGEATGAGTVAASDVLAAVDGLDVEVVATLPRELREEL
GTLPANVRAVDFVPLNALLPSCSGIIHHGGSGTFMTALVHAIPQLIVPDMMWDAMEKAHG
LARSGAGSYVDARDVSPELLRERVLALLDDPSYAAGARRVRAEIVGTPSPNDIVPVLERL
TAEHRAGGAEGGPALKSPSTGGA

>putative glycosyltransferase [putative baumycin biosynthesis protein]
GTGCGCGTCCTGTTCGCCACCATGGCCGCGCGGTCCCATGTCTACGCCCAGGTCACCCTG
GCGTCGGCACTGCGGACCGCGGGGCACGAAGTGCTCGTGGCCAGCCAGCCCGACGTCCTC
GACGACATCGTCCGGGCCGGTCTCACCGCCGTGCGGATCGGGGAGGACCTCAACATCGAG
GAGGAGACCCGGGAGGCCAACGCCAGCTTCGAGGACGACCGCAACCTCGGGGGCCTCGCC
ATGAGCAACTCCCGTGATGACCCCTTCCCGTGGGACCACGCGCTCGGCATGTTCACCGCG
ATGACCGCCATGGTCTTCCAGAACGTGTGCCCCGAGCCCATGGTCGACGACCTCGTCGGC
CTCGCCCGCGACTGGCGGCCGGACCTCGTGGTCTGGGATCCGCTGACCCTGGCCGGGCCG
GTGGCCGCCCGGCTCAGCGGGGCGGCGCACGCCCGGCTGCTGTTCGGCCCGGACCAGATG
GGCCGGAACAGGACGGCGTTCCGCGCCCTGCTCGACCGGCAACCGCCCGAGCTGCGCGAC
GACCCGCTGGCCGAGTGGCTCACCTGGACGCTGGAGCGGTGCGGCGGCAGCGCCGGGGAC
ATGAGCGAGGAGCTGGTCCTCGGGCAGTGGACGATCGACCCCACACCGCCGTCGATGCGC
ATCCCCCTGGACCTGCCCTGCGTGCCGGTGCGCTACGTGCCGTACAACGGGCCCTCCCTG
CTCCCCGGCTGGCTGCGCGAGCCGCCCCGCCACCCGCGGCGCCTGTGCCTGACGCTCGGT
GTGTCCCTCGGCGAGGCGACGGGCGCCGGCACGGTCGCCGCCTCCGACGTCCTGGCGGCC
GTGGACGGCCTGGACGTGGAGGTCGTCGCCACCCTGCCGCGGGAACTGCGCGAGGAGCTC
GGCACCCTGCCGGCGAACGTGCGGGCCGTGGACTTCGTCCCGCTGAACGCCCTGCTGCCG
TCCTGCTCGGGCATCATCCATCACGGCGGGTCCGGCACGTTCATGACGGCCCTGGTGCAC
GCGATACCGCAGCTGATCGTGCCTGACATGATGTGGGACGCCATGGAGAAGGCACACGGC
CTGGCCCGCAGCGGTGCGGGCAGTTACGTGGACGCGCGGGACGTCTCGCCGGAACTGCTG
CGCGAGCGCGTCCTCGCCCTGCTCGACGATCCGTCCTACGCCGCCGGGGCACGCCGGGTG
CGCGCCGAGATCGTCGGGACGCCGAGCCCGAACGACATCGTGCCCGTGCTGGAGCGGCTG
ACCGCCGAGCACCGGGCCGGCGGGGCGGAGGGGGGCCCGGCGCTCAAGTCGCCTTCCACC
GGCGGTGCCTAG

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR004276 Glycosyl transferase, family 28 (Domain) PF03033 Glyco_transf_28 IPR010610 Domain of unknown function DUF1205 (Domain) PF06722 DUF1205
SignalP	Bacteria, Gram-negative Eukaryota Bacteria, Gram-positive
TMHMM	No significant hit

Adria_00060 Adria_00230