Enter_00060 Enter_00060   Enter_00080 Enter_00080

Enter_00070 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
Strain
Entry nameEnterocin
Contig
Start / Stop / Direction7,798 / 7,073 / - [in whole cluster]
7,798 / 7,073 / - [in contig]
Locationcomplement(7073..7798) [in whole cluster]
complement(7073..7798) [in contig]
TypeCDS
Length726 bp (241 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category3.2 modification methylation
ProductSAM-dependent O-methyltransferase
Product (GenBank)putative O-methyl transferase EncK
Gene
Gene (GenBank)encK
EC number2.1.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[11137817] Cloning, sequencing and analysis of the enterocin biosynthesis gene cluster from the marine isolate 'Streptomyces maritimus': evidence for the derailment of an aromatic polyketide synthase. (Chem Biol. , 2000)
[11893195] Mutational analysis of the enterocin favorskii biosynthetic rearrangement. (Org Lett. , 2002)
[15505225] EncM, a versatile enterocin biosynthetic enzyme involved in Favorskii oxidative rearrangement, aldol condensation, and heterocycle-forming reactions. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 2004)
[17704772] Enzymatic total synthesis of enterocin polyketides. (Nat Chem Biol. , 2007)
comment
[PMID: 11137817](2000)
enterocin と wailupemycinsの生合成をコードするgene clusterの同定。

EncK: Methyltransferase (MT)
配列解析のみ。

---
[PMID: 11893195](2002) abstract
S.maritimusのenterocin生合成に関わるencMおよびencKの解析。
どちらのmutantもenterocin産生が停止し、nonrearranged-、nonmethylated polyketideが蓄積。

これまでは、EncMがFavorskii-like rearrangement、EncKがO-methylationを触媒していると考えられていたが、どちらのproductもFavorskii-like rearrangementに関与していることが示された。
特に、EncMについては、その役割から"favorskiiase"とも呼ばれるようである。

---
[PMID: 15505225](2004)
Favorskii-like rearrangementに関与するのがEncM単独であるとわかったのでEncKについて再検討したところ、発酵条件が影響していたことが判明。

異種性に発現したencABCLMN/encDでFavorskii-like rearrangement済のdesmethyl-5-deoxyenterocinを検出。encABCLMN/encDKで5-deoxyenterocinを検出。

よってEncKは desmethyl-5-deoxyenterocin → 5-deoxyenterocinを担う。
このメチル化はenterocin生合成において最後から2番目のステップである。

pyrone環を持っているbicyclic polyketidesはvivoでメチル化されないので、EncKはenterocinのpyrone環のために特異的であるようだ。

---
[PMID: 17704772](2007)
enc genesを異種性に発現して得たタンパクを用いて、enterocinをin vitroに合成している。
encKはE.coliで発現すると不溶性だが、S. lividansでは可溶性。

EncA/B, EncC, EncD, EncM, EncN and SgFabDのenzyme mixtureにcofactor SAMと共にEncKを加えると、メチル化された5-deoxyenterocinが得られた。

wailupemycin F and Gの同一部分はメチル化されなかったので、EncKはdesmethyl-5-deoxyenterocinに重要な基質認識特性があると示唆される。

close this sectionSequence

selected fasta
>SAM-dependent O-methyltransferase [putative O-methyl transferase EncK]
MTIDASPESSAFGFEGQSYYEHRRLRLYDAVVVHASNRLLWRCPKSRLLEHYNDWITSRH
LEVGPGSGYYLDHCRFPAGTPELTLLDLNPDPLKFAAHRLRRYTPRCVQADILEPLPDFV
GSGFTSIAYNYVMHCLPEPPGGKQIVFKHLREALAPDGVLFGSTVLSQGVKHTALSRRFN
ILYQRQGSFHNQHDSVHGLHQALEEHFASHWIEVRGSVALFAARASQTTAPRHPGASLDQ
R
selected fasta
>SAM-dependent O-methyltransferase [putative O-methyl transferase EncK]
ATGACCATCGATGCATCCCCCGAGTCCTCCGCCTTCGGCTTCGAGGGCCAGTCCTACTAC
GAACACCGGCGGCTGCGCCTGTATGACGCCGTGGTCGTCCATGCGTCGAACCGGCTGCTG
TGGCGCTGCCCGAAGTCACGGCTGCTCGAGCACTACAACGACTGGATCACCTCCCGCCAC
CTGGAGGTCGGCCCCGGCTCGGGCTACTACCTGGACCACTGCCGCTTCCCCGCAGGCACA
CCCGAGCTGACCCTGCTCGACCTCAACCCCGACCCGCTCAAGTTCGCCGCGCACCGCCTG
CGCCGCTACACCCCGCGCTGCGTGCAGGCGGACATCCTGGAACCCTTGCCCGACTTCGTC
GGCAGCGGATTCACATCCATCGCCTACAACTACGTCATGCACTGCCTGCCCGAGCCACCG
GGCGGCAAGCAGATCGTCTTCAAGCACCTGCGCGAGGCACTCGCGCCCGACGGCGTCCTC
TTCGGCAGCACCGTCCTGTCCCAGGGCGTGAAACACACCGCCCTCTCCCGCCGCTTCAAC
ATCCTCTACCAGCGCCAGGGCTCCTTCCACAACCAGCATGACAGCGTCCACGGACTGCAC
CAGGCCCTGGAGGAACACTTCGCCAGCCACTGGATCGAGGTACGCGGCAGCGTCGCACTC
TTCGCGGCCCGCGCATCGCAGACCACCGCGCCCCGCCACCCCGGAGCATCCCTGGACCAG
CGATGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR016584 S-adenosyl-L-methionine dependent methyltransferase, YbcY, predicted (Family)
[1-228] PIRSF011491
PIRSF011491   Mtase_YbcY_prd
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Enter_00060 Enter_00060   Enter_00080 Enter_00080
Page top