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Enter_00080 : CDS information

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Organism
Strain
Entry nameEnterocin
Contig
Start / Stop / Direction8,626 / 7,826 / - [in whole cluster]
8,626 / 7,826 / - [in contig]
Locationcomplement(7826..8626) [in whole cluster]
complement(7826..8626) [in contig]
TypeCDS
Length801 bp (266 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productpolyketide C-9 ketoreductase
Product (GenBank)putative ketoreductase EncD
Gene
Gene (GenBank)encD
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[11137817] Cloning, sequencing and analysis of the enterocin biosynthesis gene cluster from the marine isolate 'Streptomyces maritimus': evidence for the derailment of an aromatic polyketide synthase. (Chem Biol. , 2000)
[15123240] Context-dependent behavior of the enterocin iterative polyketide synthase; a new model for ketoreduction. (Chem Biol. , 2004)
[17704772] Enzymatic total synthesis of enterocin polyketides. (Nat Chem Biol. , 2007)
comment
[PMID: 11137817](2000)
enterocin と wailupemycinsの生合成をコードするgene clusterの同定。

EncD: KR

actinorhodin生合成におけるKRであるActIII をEncDは代替できるので、類似した機能がEncDにある。

---
[PMID: 15123240](2004)
内在性ketoreductase(KR)であるEncDがないと、enterocin minimal PKSはbenzoate-primed polyketidesを産生できない。相同なactinorhodinのKRであるActIII または EncD active site mutantsで相補されても産生できない。

よって、enterocin PKSは、functional PKS enzyme complexにおける単なる構造的ではない触媒的な役割を果たすためにEncDを要求するということが示唆され、よってEncDは完全な組み立て後ではなく、鎖伸長の間にpolyketide鎖を還元すると考えられる。

---
[PMID: 17704772](2007)
enc genesを異種性に発現して得たタンパクを用いて、enterocinをin vitroに合成している。

EncDがcofactor NADPHと共に存在しないとoctaketides(enterocin and wailupemycin)を産生できず、acetate-primed nonaketideを産生する。このacetate-primed nonaketideはC-9での還元がされておらず、EncD存在下で見られるoctaketidesはC-9が還元されている。
よって、benzoate or acetateの基質を選択する追加的機能があるのかもしれない。

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selected fasta
>polyketide C-9 ketoreductase [putative ketoreductase EncD]
MPAHTESPSVALVTGGTSGIGLSIAQALLQDGLKVIITGRDPGKLETVVRSLKMEDDQFD
VAGYTCDVRDRDAVHDMVERCAKEHGEPKVLVNNAGRSGGGVTAAIPDELWLDVINTNLN
SVFWVTREVIRSSDAIKQPAGRIINIASTGGKQGVPYGAPYSAAKAGVIGFTKALAKEFA
AHGGPTVNAVCPGYVETPMAQDIRASYAKLNNVTEEQVLADFEAKIPLGRYCTPEEVAGM
VRYLVSPAAASVTAQALNVCGGLGSY
selected fasta
>polyketide C-9 ketoreductase [putative ketoreductase EncD]
ATGCCCGCACACACCGAGTCCCCAAGCGTCGCTCTGGTCACAGGCGGCACCAGCGGCATT
GGTCTGTCGATCGCCCAGGCCCTGCTGCAGGATGGGCTGAAGGTCATCATCACCGGCCGC
GACCCCGGGAAGCTGGAGACCGTCGTCAGGTCGCTGAAGATGGAGGACGACCAGTTCGAC
GTGGCCGGTTACACCTGCGACGTACGAGACCGCGACGCGGTGCACGACATGGTGGAACGG
TGCGCCAAGGAGCACGGCGAGCCGAAGGTCCTGGTCAACAACGCCGGCCGCAGCGGCGGC
GGCGTGACCGCCGCGATCCCCGACGAGTTGTGGCTGGACGTCATCAACACCAACCTCAAC
AGCGTCTTCTGGGTGACCCGCGAGGTCATCCGGAGCAGCGACGCGATCAAGCAGCCAGCC
GGCCGGATCATCAACATCGCGTCCACCGGCGGCAAGCAGGGCGTCCCGTACGGGGCCCCG
TACTCGGCGGCCAAGGCCGGTGTCATCGGCTTCACCAAGGCACTCGCCAAGGAATTCGCC
GCCCACGGCGGCCCCACCGTGAACGCGGTATGCCCCGGCTACGTGGAAACGCCCATGGCC
CAGGACATCCGCGCCAGTTACGCCAAGCTCAACAACGTCACCGAGGAGCAGGTCCTCGCC
GACTTCGAGGCCAAAATCCCCCTCGGCCGCTACTGCACCCCCGAGGAGGTGGCGGGCATG
GTGCGCTACCTGGTCAGCCCGGCAGCCGCGTCGGTGACCGCCCAGGCACTCAACGTCTGC
GGCGGACTGGGCAGTTACTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002198 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (Family)
[86-97] 4.00000300869883e-13 PR00080 [141-149] 4.00000300869883e-13 PR00080 [161-180] 4.00000300869883e-13 PR00080
PR00080   SDRFAMILY
[10-179] 2.4e-34 PF00106
PF00106   adh_short
IPR002347 Glucose/ribitol dehydrogenase (Family)
[10-27] 2.60000517657733e-43 PR00081 [86-97] 2.60000517657733e-43 PR00081 [135-151] 2.60000517657733e-43 PR00081 [161-180] 2.60000517657733e-43 PR00081 [183-200] 2.60000517657733e-43 PR00081 [227-247] 2.60000517657733e-43 PR00081
PR00081   GDHRDH
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[8-263] 3.10000000000005e-79 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
IPR020904 Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site (Conserved_site)
[148-176] PS00061
PS00061   ADH_SHORT
SignalP
[1-25] 0.506 Signal
Eukaryota   
[1-27] 0.279 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
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