Dauno_00050 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sp.
Strain	C5
Entry name	Daunorubicin
Contig	U43704
Start / Stop / Direction	6,604 / 7,932 / + [in whole cluster] 3,408 / 4,736 / + [in contig]
Location	6604..7932 [in whole cluster] 3408..4736 [in contig]
Type	CDS
Length	1,329 bp (442 aa)

Annotation

Category	5.1 general function
Product	putative glycosyltransferase
Product (GenBank)	glycosyltransferase
Gene
Gene (GenBank)	dauH
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q53881 PmId [8655529] Cloning, sequencing, and analysis of aklaviketone reductase from Streptomyces sp. strain C5. (J Bacteriol. , 1996) comment Daunorubicin (DNR) 生合成PKSの上流領域にある6ORFsの同定。 DauH: Glycosyltransferase similar to Streptomyces peucetius DnrS (41%) 配列解析のみ。 Streptomyces sp. strain C5でのDNR生合成におけるDauHの機能は分かっていない。 Streptomyces peucetius DnrSでも明白な証拠には欠けている。
Related Reference	ACC P95834 NITE Adria_00070 PmId [8955419] Enhanced antibiotic production by manipulation of the Streptomyces peucetius dnrH and dnmT genes involved in doxorubicin (adriamycin) biosynthesis. (J Bacteriol. , 1996) [23885759] Nitrososynthase-triggered oxidative carbon-carbon bond cleavage in baumycin biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2013) comment BLAST id92% Streptomyces peucetius_dnrH Putative baumycin biosynthesis protein [DoBISCUIT]putative glycosyltransferase --- [PMID: 8955419](1996) dnrH不活化mutantは、RHOが2.5倍減、daunorubicin (DNR)8.5倍増、doxorubicin (DXR)増。 dnrH(-) strainでdnrHを過剰発現すると、RHO, DNR産生をwildレベルに回復。 dnrH(-) strainでdnmTを過剰発現すると、RHOが192倍減、DNRが9.4倍増。 baumycinsに通常割り当てられたHPLC chromatogramは、dnrH mutant strainのchromatogramから消失。 DnrH proteinは知られたglycosyltransferasesに似ているので、このタンパクはDNR→baumycinsとして知られるpolyglycosylated formsへの変換を触媒するかもしれない。 --- [PMID: 23885759](2013) クローニング、精製したDnrHを使って実験しているが、機能解明には至っていない。 Baumycins生合成への関与が提唱されている。
Related Reference	ACC Q9ZGH7 NITE Pikro_00090 PmId [15161264] Characterization of the glycosyltransferase activity of desVII: analysis of and implications for the biosynthesis of macrolide antibiotics. (J Am Chem Soc. , 2004) [15358425] New olivosyl derivatives of methymycin/pikromycin from an engineered strain of Streptomyces venezuelae. (FEMS Microbiol Lett. , 2004) [20695498] Characterization of glycosyltransferase DesVII and its auxiliary partner protein DesVIII in the methymycin/picromycin biosynthetic pathway. (Biochemistry. , 2010) [23770075] Combinatorial biosynthesis and antibacterial evaluation of glycosylated derivatives of 12-membered macrolide antibiotic YC-17. (J Biotechnol. , 2013) [26552796] In vivo investigation to the macrolide-glycosylating enzyme pair DesVII/DesVIII in Saccharopolyspora erythraea. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2016) comment BLAST id48% Streptomyces venezuelae_desVII Glycosyl transferase --- [PMID:15161264](2004) abstract glycosyltransferase DesVII のin vitro活性を実証。十分な活性を得るには、塩基性pHと追加タンパク成分DesVIII を必要とする。 --- [PMID:15358425](2004) 内因性deoxusugar(dTDP-D-desosamine)の生合成に関する全体的なgene clusterを削除し、dTDP-4-keto-6-deoxyglucose(内因性のdesosamine中間体)またはdTDP-D-olivose(外因性)の生合成に必要な遺伝子で置換したS.venezuelae mutant株において、'sugar-flexible' glycosyltransferase(DesVII) は12員環と14員環両方のmacrolactonesがquinovose or olivoseでglycosylateされた10-deoxymethynolide and narbonolideを産生した。またこれらのglycosylationにはDesVII に加えてDesVIII も必須であることが確認されている。 --- [PMID: 20695498](2010) DesVII はglycosyltransferases活性のために追加protein componentであるDesVIII を必要とする。 recombinant DesVIII proteinの追加でDesVII によるglycosylation効率を改善。量はとても少ないが、desVIII はそのhomolog dnrQによって置換されうる。 DesVII/DesVIII 複合体の形成はvivoでの両遺伝子の同時発現を必要とし、vitroでの個々に産生されたタンパクの混合では完全には達成されない。 DesVII と DesVIII の比率は1:1で、複合体はheterodimersの3量体[(αβ)3]として存在する。 DesVII/DesVIII 複合体の触媒効率は、DesVII のみのときより少なくとも2×10(3)倍高い。よって、DesVIII はタンパク産生のときDesVII の折りたたみを補助し、触媒中きつく結合したままにすることが示唆される。 --- [PMID:23770075](2013) abstract 基質が柔軟なglycosyltransferase DesVII とdeoxysugar生合成gene cassettesを用いて、様々な糖でD-desosamineを置換したglycosyl-10-deoxymethynolideを作成している。L-rhamnoseでの置換により抗菌活性が良くなった。

Sequence

>putative glycosyltransferase [glycosyltransferase]
MRVLFATMAARSHVYAQVTLASALRTAGHEVLVASQPDVLDDIVRAGLTRVRIGEDLNIE
EETREANASFEDDRNLGGLAMSNTRDDPLPWDHALGMFTAMTAMVFQNVCPEPMVDDLVG
LARDWRPDLVVWDPLTLAGPVAARLSGAAHARLLFGPDQMGRNRTAFRALLDRQRPSCVT
TRCAEWLTWTLERWRRQRLDMSEELVLGQWTIDPTPPSMRIPLDLPCVPVRYVPYNGPSL
LPDWLREPPRHPRRLCLTLGVSLGEATGAGTVAASDVLAAVDGLDVEVVATLSRNCQELG
TLPANVRAVDFVRLNALLPSCSGIIHHGGSGTFMTALAHATPQLIVPDMMWDAMEKAHGL
ARSGAGGYVDAKDVSPDLLRERVLDLFDDPSYAAGARRVRAEIVGTPSPNDIVPVLERLT
AEHQAGGPERSPALKSPSTGGA

>putative glycosyltransferase [glycosyltransferase]
GTGCGCGTCCTGTTCGCCACCATGGCCGCGCGGTCCCACGTCTACGCCCAGGTCACCTTG
GCGTCGGCACTGCGGACCGCGGGGCACGAGGTGCTCGTGGCCAGCCAGCCCGACGTCCTC
GACGACATCGTCCGGGCCGGTCTCACGCGCGTGCGGATCGGAGAGGACCTCAACATCGAG
GAGGAGACCCGGGAGGCCAACGCCAGCTTCGAGGACGACCGCAACCTCGGCGGCCTCGCT
ATGAGCAACACCCGTGACGATCCCTTACCGTGGGACCACGCCCTCGGCATGTTCACCGCG
ATGACCGCCATGGTCTTCCAGAACGTGTGCCCCGAACCCATGGTCGACGACCTCGTCGGC
CTCGCCCGCGACTGGCGGCCGGACCTCGTGGTCTGGGATCCGCTGACCCTGGCCGGACCG
GTGGCAGCCCGGCTCAGCGGCGCGGCACACGCCCGGCTGCTGTTCGGCCCGGATCAGATG
GGCCGGAACAGGACGGCGTTCCGCGCCCTGCTCGACCGGCAACGCCCGAGCTGCGTGACG
ACCCGCTGCGCCGAGTGGCTCACCTGGACGCTGGAGCGGTGGCGGCGGCAGCGCCTGGAC
ATGAGCGAGGAACTGGTGCTCGGGCAGTGGACGATCGACCCCACACCACCGTCCATGCGC
ATTCCCCTGGACCTGCCCTGCGTGCCGGTGCGCTACGTGCCGTACAACGGGCCCTCCCTG
CTTCCCGACTGGCTGCGCGAGCCGCCCCGCCACCCGCGGCGCCTGTGCCTGACGCTCGGT
GTGTCCCTCGGCGAGGCGACGGGCGCCGGTACGGTCGCCGCCTCCGACGTCCTGGCAGCC
GTGGACGGCCTGGACGTGGAGGTCGTCGCCACCCTGTCGCGGAACTGCCAGGAACTCGGC
ACCCTGCCGGCGAACGTACGGGCGGTGGACTTCGTCCGGTTGAACGCCCTGCTGCCGTCC
TGCTCGGGCATTATCCATCACGGCGGGTCCGGCACGTTCATGACGGCCCTGGCGCACGCG
ACGCCGCAGCTGATCGTGCCCGACATGATGTGGGACGCCATGGAGAAGGCACACGGCCTG
GCCCGCAGCGGTGCGGGCGGTTACGTGGACGCGAAGGACGTCTCGCCCGACCTGCTGCGT
GAGCGCGTCCTCGACCTGTTCGACGATCCGTCCTATGCCGCCGGGGCACGCCGTGTGCGC
GCCGAGATCGTCGGAACGCCGAGCCCGAACGACATCGTGCCCGTGCTGGAACGGCTGACC
GCCGAGCACCAGGCCGGCGGGCCGGAGCGGAGCCCGGCGCTCAAGTCGCCTTCCACCGGC
GGTGCCTAG

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR004276 Glycosyl transferase, family 28 (Domain) PF03033 Glyco_transf_28 IPR010610 Domain of unknown function DUF1205 (Domain) PF06722 DUF1205
SignalP	Eukaryota Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

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