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Dauno_00120 : CDS information

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Organism
StrainC5
Entry nameDaunorubicin
Contig
Start / Stop / Direction21,108 / 21,404 / + [in whole cluster]
3,838 / 4,134 / + [in contig]
Location21108..21404 [in whole cluster]
3838..4134 [in contig]
TypeCDS
Length297 bp (98 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
Productputative glycosyltransferase helper protein(fragment)
Product (GenBank)
Gene
Gene (GenBank)dauQ
EC number
Keyword
  • daunosamine
Note
Note (GenBank)
  • putative
Reference
ACC
PmId
[7836284] Analysis of clustered genes encoding both early and late steps in daunomycin biosynthesis by Streptomyces sp. strain C5. (J Bacteriol. , 1995)
comment
Daunorubicin (DNR)のPKS genes領域に近接した4ORFsの同定論文。

FIG. 2.のorfAにこのentryは相当する。
詳細記載なし。
Related Reference
ACC
Q54823
NITE
Adria_00350
PmId
[7592454] Cloning and characterization of the Streptomyces peucetius dnrQS genes encoding a daunosamine biosynthesis enzyme and a glycosyl transferase involved in daunorubicin biosynthesis. (J Bacteriol. , 1995)
[17049185] Functional analysis of desVIII homologues involved in glycosylation of macrolide antibiotics by interspecies complementation. (Gene. , 2007)
comment
BLAST id94%, N末部分hit
Streptomyces peucetius_dnrQ
DnrQ protein
[DoBISCUIT]putative glycosyltransferase helper protein

---
[PMID: 7592454](1995)
dnrQSの配列解析とdnrQ不活化・相補実験。
dnrQ::aphII mutantはRHOを産生するが、DNRを産生できない。
よってdnrQはdaunosemine生合成に必要、と言っている。

---
[PMID: 17049185](2007) abstract
glycosyltransferase補助タンパクをコードするStreptomyces venezuelae ATCC 15439のdesVIII.
このdesVIIIを不活化したmutantをdnrQで相補すると、desVIIIによる自己相補の26%まで回復する。
よってdnrQには類似機能が示唆される。
ACC
Q9L4U5
NITE
Acla_00220
PmId
[15911373] AknT is an activating protein for the glycosyltransferase AknS in L-aminodeoxysugar transfer to the aglycone of aclacinomycin A. (Chem Biol. , 2005)
[17685523] Characterization of rhodosaminyl transfer by the AknS/AknT glycosylation complex and its use in reconstituting the biosynthetic pathway of aclacinomycin A. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
BLAST id51%, N末部分hit
Streptomyces galilaeus_aknT
AknT
[DoBISCUIT]glycosyltransferase helper protein

---
[PMID: 15911373](2005)
AknKの実験に基づき代替基質として2-deoxyfucoseを用いたAknS/Tの実験。
AknS単独でも活性はあるが、AknTがないと活性は低い。

---
[PMID: 17685523](2007)
dTDP-L-rhodosamineがAknS/AknTの自然な基質であることを確認。
これまでに代替基質として使用されていたdTDP-2-deoxyfucoseより100倍、dTDP-daunosamineより1000倍速いKcat値を示す。

partner protein AknTは、L-rhodosamine移動のためのAknSの代謝回転速度を200倍に加速する。
AknTの存在はKm値に影響せず、kcatに影響する。AknS:AknTの最適比率は1:3。

aglycone, L-rhodosamine, 2-deoxyfucose, AknS/T, AknKでの産物は2糖型aclacinomycinが主要産物でだったことから、3糖目は2-deoxyfucoseでなく、これまでの提唱通りL-rhodinoseでありそう。
ACC
Q9ZGH8
NITE
Pikro_00080
PmId
[20695498] Characterization of glycosyltransferase DesVII and its auxiliary partner protein DesVIII in the methymycin/picromycin biosynthetic pathway. (Biochemistry. , 2010)
[26552796] In vivo investigation to the macrolide-glycosylating enzyme pair DesVII/DesVIII in Saccharopolyspora erythraea. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2016)
comment
BLAST id50%, N末部分hit
Streptomyces venezuelae_desVIII
Putative tautomerase
[DoBISCUIT]glycosyltransferase helper protein

---
[PMID: 20695498]
DesVII はglycosyltransferases活性のために追加protein componentであるDesVIII を必要とする。
recombinant DesVIII proteinの追加でDesVII によるglycosylation効率を改善。
量はとても少ないが、desVIII はそのhomolog dnrQによって置換されうる。

DesVII/DesVIII 複合体の形成はvivoでの両遺伝子の同時発現を必要とし、vitroでの個々に産生されたタンパクの混合では完全には達成されない。
DesVII と DesVIII の比率は1:1で、複合体はheterodimersの3量体[(αβ)3]として存在する。
DesVII/DesVIII 複合体の触媒効率は、DesVII のみのときより少なくとも2×10(3)倍高い。

よって、DesVIII はタンパク産生のときDesVII の折りたたみを補助し、触媒中きつく結合したままにすることが示唆される。

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selected fasta
>putative glycosyltransferase helper protein(fragment)
MTMPTPTSAPPAAPTNSELGRHLLTVRGFHFVFGALGDPYARRLRGEADHLSLGELVRDR
GPLHRSALGTWVTADGETSAGLLDDPLLGPRHPASEGLQ
selected fasta
>putative glycosyltransferase helper protein(fragment)
ATGACGATGCCCACACCCACGTCCGCGCCGCCGGCCGCCCCGACCAACAGCGAGCTGGGG
CGCCATCTGCTGACCGTGCGCGGCTTCCACTTCGTCTTCGGCGCGCTGGGCGACCCCTAT
GCCCGGCGACTGCGCGGCGAAGCCGATCATCTGTCTCTCGGTGAACTGGTCCGCGACCGA
GGTCCGCTCCACCGCAGTGCGCTGGGCACCTGGGTGACGGCGGACGGAGAAACATCGGCC
GGCCTGCTGGACGATCCGCTGCTGGGCCCTCGGCACCCCGCCTCGGAAGGGCTGCAG

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09
show BLAST table
InterPro No significant hit
SignalP
 [1-37]  0.229 Signal
Eukaryota   
TMHMM No significant hit
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