Acla_00180 Acla_00180   Acla_00200 Acla_00200

Acla_00190 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
StrainATCC 31615
Entry nameAclacinomycin A
Contig
Start / Stop / Direction20,976 / 21,965 / + [in whole cluster]
4,821 / 5,810 / + [in contig]
Location20976..21965 [in whole cluster]
4821..5810 [in contig]
TypeCDS
Length990 bp (329 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category2.3 modification addition of sugar moiety
Productputative NDP-hexose C-3 ketoreductase
Product (GenBank)putative 3-ketoreductase
Gene
Gene (GenBank)aknQ
EC number
Keyword
  • L-2-deoxyfucose
  • L-rhodinose
Note
Note (GenBank)
  • AknQ
Reference
ACC
PmId
[11016846] A gene cluster from Streptomyces galilaeus involved in glycosylation of aclarubicin. (Mol Gen Genet. , 2000)
[12427929] Characterization of mutations in aclacinomycin A-non-producing Streptomyces galilaeus strains with altered glycosylation patterns. (Microbiology. , 2002)
comment
[PMID: 11016846](2000)
anthracycline生合成gene clusterの15kb領域をクローニング、特徴づけ。
このclusterはaclacinomycinsの産生に関連するgeneを含む。

AknQ: 3-Ketoreductase

同様のketoreductaseがgranaticin と landomycinの生合成clusterにも存在する。

aknO, aknP and aknQを削除するとaclacinomycin非産生となることから、クローニングされたこのclusterがaclacinomycin生合成に関連すると確認している。
でもこのaclacinomycin生合成完全抑制は、おそらくaknOの不活化に由来すると述べられている。

---
[PMID: 12427929](2002)
同じ著者らの続報。
上記論文を引用してFig. 2b(Sg9 gene cluster organization)とTable 4を記載。

Table 4. Putative functions of Sg9 gene products
AknQ: dTDP-hexose 3-ketoreductase

mutant H038はrhodosamineのみを糖として持つaclacinomycin Tを産生する。
よってこのmutantには2-deoxyfucoseとrhodinoseの生合成経路に関与する遺伝子に問題がある。
mutant H038はAknQの発現によりwild型の産生を回復。
mutant H038におけるaknQの配列は変異によるAA置換があり、このミスセンス変異が2-deoxyfucoseとrhodinoseの生合成に影響している。
Related Reference
ACC
Q9ALN5
NITE
Spino_00080
PmId
[18345667] In vitro characterization of the enzymes involved in TDP-D-forosamine biosynthesis in the spinosyn pathway of Saccharopolyspora spinosa. (J Am Chem Soc. , 2008)
comment
Blast 7th, id53%, 7e-88
Saccharopolyspora spinosa_spnN
Probable NDP-hexose-3-ketoreductase

Forosamine合成過程で、3位のケト基の還元に関与する。

NAD(P)H-dependent dTDP-3,4-diketo-2,6-dideoxy-D-glucose 3-ketoreductase_SpnN

dTDP-D-glucose, RfbB(dTDP-D-glucose→dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose), TylX3(SpnNの1つ前の反応を担うSpnOのhomologue), SpnN, and NADPHをインキュベーションしてできた産物がdTDP-4-keto-2,6-dideoxy-D-glucoseであることをHPLC chromatogram、1H NMR spectrumなどで確認している。NADPHはNADHの2倍速く消費されるので、おそらくNADPH-dependentである。

close this sectionSequence

selected fasta
>putative NDP-hexose C-3 ketoreductase [putative 3-ketoreductase]
MPKDTPRPVLRIGVLGCADIAVRRILPAIVEHPSVRLVALASRDGARAERLAARFGCAAV
TGYKALLDREDINAVYVPLPPGMHHEWVTEALTAGKHVLVEKPLSTTYAQSVDLVAMAGR
LGLALTENFMFLHHSQHEAVRAMTGEIGELRVFTSSFGVPPPHPSSFRHDARLGGGALLD
VGVYPLRAAQLHLAGELDVLGACLRVDEATGVDVAGSALLSTATGVTAQLDFGFQHAYRS
VYALWGSRGRLSVPRAFTPPREHRPVVRIEQQDRLTEVTLPADHQVGNALDAFASAVHSE
TVRASLGEALLRQALLVEQVRKAARVVSG
selected fasta
>putative NDP-hexose C-3 ketoreductase [putative 3-ketoreductase]
ATGCCGAAGGACACTCCACGGCCCGTACTCCGCATCGGGGTTCTGGGCTGTGCCGATATC
GCGGTGCGCCGGATCCTGCCCGCGATCGTGGAGCATCCGTCGGTCCGGCTGGTCGCTCTG
GCGAGCCGGGACGGGGCGCGCGCCGAACGGCTCGCGGCCCGTTTCGGATGCGCGGCGGTG
ACCGGCTACAAGGCGCTGCTGGACCGTGAGGACATCAACGCCGTCTACGTTCCCCTGCCG
CCCGGCATGCACCACGAATGGGTCACCGAAGCGCTGACGGCGGGCAAGCACGTGCTGGTG
GAGAAGCCGCTCAGCACGACGTACGCGCAGAGCGTCGACCTGGTGGCGATGGCCGGCCGG
CTCGGCCTCGCGCTCACCGAGAACTTCATGTTCCTGCACCACTCGCAGCACGAGGCGGTC
CGGGCCATGACCGGCGAGATCGGGGAACTGCGGGTCTTCACCAGTTCCTTCGGCGTGCCG
CCGCCCCACCCCTCGTCCTTCCGGCACGACGCGCGGCTCGGCGGCGGCGCCCTGCTGGAC
GTCGGTGTCTATCCGCTGCGCGCGGCCCAGCTCCACCTCGCCGGGGAACTCGACGTGCTG
GGCGCCTGTCTGCGCGTGGACGAGGCGACCGGCGTCGACGTCGCGGGAAGCGCGCTGCTG
TCCACGGCGACGGGTGTGACCGCGCAGCTCGACTTCGGCTTCCAGCACGCGTACCGGTCC
GTGTACGCGCTGTGGGGCAGCCGCGGCAGGCTGAGCGTGCCGCGGGCCTTCACCCCGCCC
CGTGAGCACCGCCCGGTGGTCCGTATCGAACAGCAGGACCGTCTCACCGAAGTGACGCTG
CCCGCCGATCACCAGGTGGGCAACGCGCTCGACGCGTTCGCCTCGGCGGTGCACTCGGAG
ACCGTCCGTGCCTCCCTGGGGGAGGCGCTGCTGCGTCAGGCGCTCCTGGTCGAGCAGGTA
CGCAAAGCCGCGCGGGTCGTCAGCGGCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR000683 Oxidoreductase, N-terminal (Domain)
[10-126] 1.8e-27 PF01408
PF01408   GFO_IDH_MocA
IPR004104 Oxidoreductase, C-terminal (Domain)
[144-242] 1.3e-10 PF02894
PF02894   GFO_IDH_MocA_C
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
[9-153] 1.2e-39 G3DSA:3.40.50.720
G3DSA:3.40.50.720   NAD(P)-bd
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Acla_00180 Acla_00180   Acla_00200 Acla_00200
Page top