Alnu_00100 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sp.
Strain	CM020
Entry name	Alnumycin
Contig	EU852062
Start / Stop / Direction	7,238 / 8,233 / + [in whole cluster] 7,238 / 8,233 / + [in contig]
Location	7238..8233 [in whole cluster] 7238..8233 [in contig]
Type	CDS
Length	996 bp (331 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	putative cyclase/dehydratase
Product (GenBank)	AlnQ aromatase
Gene
Gene (GenBank)	alnQ
EC number
Keyword	1st ring
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC B6SEF5 PmId [18940666] Characterization of the alnumycin gene cluster reveals unusual gene products for pyran ring formation and dioxan biosynthesis. (Chem Biol. , 2008) comment alnumycin gene clusterのクローニング、シークエンス。 aln2-alnT2の領域をS.albusに導入して、alnumycin産生されることを確認している。 AlnQ: Cyclase/aromatase 配列解析から、first ringのaromatizationを担うaromataseであると提唱されている。
Related Reference	ACC Q02055 NITE Actino_00210 PmId [11851466] Genetic Contributions to Understanding Polyketide Synthases. (Chem Rev. , 1997) comment Blast 13th, id45%, 2e-58 Streptomyces coelicolor_actVII Actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase [Actino_00210]cyclase/dehydratase(1st ring) -- [Pubmed登録なし]Engineered Biosynthesis of Novel Polyketides: actVII and actIV Genes Encode Aromatase and Cyclase Enzymes, Respectively. J. Am. Chem. Soc., 1994, 116 (24), pp 10855-10859 act minimal PKS, KR(actIII ), actVII, actIV の様々な組み合わせのrecombinantsによって産生されたpolyketides構造を測定。 minimal PKS = SEK4 minimal PKS + act KR = mutactin minimal PKS + act KR + actVII = SEK34 minimal PKS + act KR + actVII + actIV = DMAC ActVII は1st carbocyclic ringの2つのdehydrationsを触媒することを担うaromataseとして機能する。 ActIV は2つめのringを形成するための分子内aldol縮合を触媒するcyclaseである。 ActVII homologsは、gra, fren, tcm, gris生合成clusterにある。 ActIV homologsは、gra, fren, gris生合成clusterにある。 -- [PMID:11851466](1997) 上記PMIDなし論文がRef採用されているレビュー。 ActVII とgra, fren homologsはdidomain aromataseで、9-KRで還元されたC9-OH基を含み、2分子の水を除去をする。対して、N末だけActVII と似ているmonodomain aromatase_tcmNは、非還元polykeideを合成するPKSのcomponentである。

Sequence

>putative cyclase/dehydratase [AlnQ aromatase]
MDTETHERTADSPTRSAEHVTELAASARRAYALIEDVGRWPLLFAPCIWSQELERTGGIQ
RIRLWAVVGNGVRSWTSRRVLDPAGNRIDFAQETPAAPITEMSGHWRFQDASPGSPGRLE
LGHRWTTDGEPGAADRIAAALDSNSTVEIGALRAWAERPEEPDELILSFSDEELIAAPAA
EVYDFLYRADLWPERLPHVAGLDLESNPAEPATAGAEVQTMDMETSAADGSTHTTQSVRL
CFEGERIVYKQTTPPRGLLAHSGEWLFSSGPEGTLVTARHTVALDPAAVESVFGPGTTIA
QALLRARDIIGANSRGTLRTARSHLEQGAAE

>putative cyclase/dehydratase [AlnQ aromatase]
GTGGACACGGAGACGCACGAGAGGACCGCGGACAGCCCCACCCGTTCCGCCGAGCACGTG
ACCGAGCTGGCCGCGTCGGCCCGCCGCGCCTACGCGCTCATCGAGGACGTCGGCCGCTGG
CCGCTGCTCTTCGCGCCCTGCATCTGGTCCCAGGAACTGGAACGCACCGGCGGCATCCAG
CGCATCCGGCTCTGGGCGGTCGTCGGCAACGGGGTGCGCAGCTGGACCTCGCGGAGGGTG
CTCGACCCGGCGGGCAACCGGATCGACTTCGCCCAGGAGACCCCGGCCGCGCCGATCACG
GAGATGTCGGGTCACTGGCGGTTCCAGGACGCCTCGCCCGGCAGCCCCGGGCGGCTGGAA
CTCGGACACCGGTGGACCACCGACGGCGAACCGGGCGCGGCCGACCGCATCGCCGCCGCG
CTGGACTCCAACAGCACCGTCGAGATCGGGGCACTCCGGGCCTGGGCGGAACGCCCCGAG
GAGCCGGACGAGTTGATCCTGAGCTTCAGCGACGAGGAGCTCATAGCCGCGCCGGCCGCG
GAGGTCTACGACTTCCTGTACCGCGCCGATCTGTGGCCCGAGCGGCTGCCGCACGTGGCC
GGGCTCGACCTGGAGAGCAACCCGGCGGAGCCCGCCACCGCGGGCGCCGAGGTGCAGACG
ATGGACATGGAGACCTCCGCCGCCGACGGGAGTACGCACACCACCCAGTCGGTGCGGCTG
TGCTTCGAGGGCGAGCGGATCGTCTACAAACAGACCACCCCGCCGCGCGGGCTGCTGGCG
CACTCCGGAGAGTGGCTCTTCAGCAGTGGCCCTGAGGGCACCCTGGTCACCGCCCGGCAC
ACGGTGGCCCTCGATCCCGCCGCGGTGGAGAGCGTCTTCGGACCGGGCACCACCATCGCC
CAGGCCCTCCTCAGGGCCCGGGACATCATCGGCGCCAACAGCCGGGGCACCCTTCGGACG
GCCCGGAGCCACCTCGAGCAGGGGGCTGCCGAGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR005031 Streptomyces cyclase/dehydrase (Family) PF03364 Polyketide_cyc IPR019587 Polyketide cyclase/dehydrase (Family) PF10604 Polyketide_cyc2 IPR023393 START-like domain (Domain) G3DSA:3.30.530.20 G3DSA:3.30.530.20
SignalP	Eukaryota
TMHMM	No significant hit

Alnu_00090 Alnu_00110