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Bena_00080 : CDS information

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Organism
StrainA2991200
Entry nameBenastatin
Contig
Start / Stop / Direction6,432 / 6,875 / + [in whole cluster]
6,432 / 6,875 / + [in contig]
Location6432..6875 [in whole cluster]
6432..6875 [in contig]
TypeCDS
Length444 bp (147 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productputative oxidoreductase
Product (GenBank)BenD protein
Gene
Gene (GenBank)benD
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[17439117] Molecular analysis of the benastatin biosynthetic pathway and genetic engineering of altered fatty acid-polyketide hybrids. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
Benastatin A and B生合成をコードする全遺伝子座のクローニング、シークエンス。
flanking regionsの削除とS. albus, S. lividansでの異種性発現によってclusterが同定されている。

BenD: cyclase II

配列解析のみ。
whiE spore pigment生合成に関連したORF II に近しく関連。
RubD, GrhS, FdmEにも高い配列相同性あり。
Related Reference
ACC
P23157
PmId
[15701630] A novel quinone-forming monooxygenase family involved in modification of aromatic polyketides. (J Biol Chem. , 2005)
comment
Blast 6th, id54%, 1e-30
Streptomyces coelicolor_SCO5319
16.7 kDa protein in whiE locus(WhiE ORF II)

type III PKSに隣接して存在し、cupin superfamilyに属するMomAは、1,3,6,8-tetrahydroxynaphthalene (THN) → flaviolin へのmonooxygenationを触媒する。加えて基質としていくつかのpolyketidesを使用し、対応するquinoneを形成する。

MomAとAA配列類似のあるWhiE-ORFII はtype II minimal PKSの上流に隣接し、MomAと同様にTHNのmonooxygenationを触媒した。

よってcupin superfamilyに属する新規クラスのquinone形成monooxygenasesは、types II and III のPKSsによって合成された芳香族polyketidesの修飾に関連する。

ElmJ, TcmJ, GrhSを含んだalignmentあり。
(ここで示されているCupin motif内の重要なsitesは、BenDにも保存されている。)

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selected fasta
>putative oxidoreductase [BenD protein]
MSAHEAHTVPPTGTAELLVTKVAAGDVPSSPRHGGDLRIVLGPATTGVSSGFMGTGLLAV
GERIREHYHPYSDEFLYVVQGGLEVTTEGTDVHRVTAGEGILIPRMTRHKMLNDGTVPAF
VVFHSCPLAPRPELGHVDTEEADPDEQ
selected fasta
>putative oxidoreductase [BenD protein]
ATGTCCGCCCACGAAGCACACACCGTCCCGCCGACGGGGACGGCGGAGCTCCTCGTCACC
AAGGTCGCCGCCGGGGACGTCCCGTCGAGCCCTCGGCACGGAGGCGATCTGCGGATCGTC
CTCGGTCCGGCGACGACCGGAGTGAGCAGCGGCTTCATGGGCACCGGCCTGCTGGCCGTC
GGTGAACGGATCAGGGAGCACTACCACCCGTACTCGGACGAGTTCCTGTACGTGGTGCAG
GGCGGTCTGGAAGTGACGACGGAGGGCACGGACGTCCACCGGGTGACGGCGGGCGAGGGC
ATCCTCATCCCGCGTATGACCAGGCACAAGATGCTCAACGACGGCACTGTGCCGGCGTTC
GTCGTCTTCCACTCGTGCCCGCTCGCTCCCCGTCCCGAGCTGGGTCATGTCGACACGGAG
GAGGCTGATCCCGATGAGCAGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR011051 RmlC-like cupin domain (Domain)
[1-144] 2.39999798157265e-19 SSF51182
SSF51182   RmlC_like_cupin
IPR013096 Cupin 2, conserved barrel (Domain)
[57-122] 4.2e-16 PF07883
PF07883   Cupin_2
IPR014710 RmlC-like jelly roll fold (Domain)
[55-129] 3.7e-18 G3DSA:2.60.120.10
G3DSA:2.60.120.10   RmlC-like_jellyroll
SignalP
[1-25] 0.158 Signal
Eukaryota   
TMHMM
[39-61] Transmembrane (o-i)
Transmembrane 1   
Bena_00070 Bena_00070   Bena_00090 Bena_00090
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